More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1857 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1857  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
746 aa  1541    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3357  hypothetical protein  53.98 
 
 
528 aa  558  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0301  metal dependent phosphohydrolase  50.56 
 
 
542 aa  518  1.0000000000000001e-145  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0133  metal dependent phosphohydrolase  47.57 
 
 
524 aa  514  1e-144  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.140491  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3620  GAF containing protein  47.74 
 
 
540 aa  501  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1538  metal dependent phosphohydrolase  44.53 
 
 
1004 aa  499  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.13069  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2177  metal dependent phosphohydrolase  45.25 
 
 
576 aa  472  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  46.07 
 
 
796 aa  459  1e-127  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2026  metal dependent phosphohydrolase  44.92 
 
 
568 aa  437  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00491297  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0337  metal dependent phosphohydrolase  42.28 
 
 
515 aa  420  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3006  metal dependent phosphohydrolase  39.21 
 
 
983 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000182003 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2287  HAMP domain-containing protein  37.22 
 
 
984 aa  351  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2386  metal dependent phosphohydrolase  37.22 
 
 
984 aa  351  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2068  membrane protein  41.83 
 
 
840 aa  334  3e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0250  putative metal dependent phosphohydrolase  38.67 
 
 
980 aa  332  1e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270817  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3876  hypothetical protein  42.06 
 
 
973 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0539  putative metal dependent phosphohydrolase  44.5 
 
 
1073 aa  328  3e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0537  metal dependent phosphohydrolase  47.94 
 
 
1056 aa  324  3e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3976  metal dependent phosphohydrolase, HD region  41.81 
 
 
980 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777517  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1901  metal dependent phosphohydrolase  35.42 
 
 
962 aa  320  7e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0333053  hitchhiker  0.00824164 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2599  metal dependent phosphohydrolase  34.86 
 
 
796 aa  317  5e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.047672 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0538  metal dependent phosphohydrolase  42.65 
 
 
1055 aa  314  4.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.329724  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4091  metal dependent phosphohydrolase  42.93 
 
 
1060 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3126  metal dependent phosphohydrolase  34.86 
 
 
968 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1571  metal dependent phosphohydrolase  40.86 
 
 
964 aa  310  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453782  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0428  integral membrane protein, putative two-component signal transducer  44.82 
 
 
1054 aa  310  5.9999999999999995e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812941  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3366  metal dependent phosphohydrolase  43.33 
 
 
1065 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0651  metal dependent phosphohydrolase  44.62 
 
 
1067 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2105  putative metal dependent phosphohydrolase  38.29 
 
 
938 aa  302  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3667  metal dependent phosphohydrolase  42.45 
 
 
1102 aa  293  7e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2282  metal dependent phosphohydrolase  40.33 
 
 
1061 aa  291  2e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156681  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4432  metal dependent phosphohydrolase  33.75 
 
 
686 aa  292  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206968  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02406  hypothetical protein  43.67 
 
 
1048 aa  290  7e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3829  metal dependent phosphohydrolase  40.41 
 
 
940 aa  281  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0980  metal dependent phosphohydrolase  39.39 
 
 
1065 aa  271  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.63647  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1233  metal dependent phosphohydrolase  31.71 
 
 
544 aa  269  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.246188  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5032  metal dependent phosphohydrolase  33.15 
 
 
539 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2304  metal dependent phosphohydrolase  32.6 
 
 
691 aa  258  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280506  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2193  metal dependent phosphohydrolase  32.48 
 
 
560 aa  251  3e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.579233  normal  0.606327 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02400  hypothetical protein  38.78 
 
 
840 aa  183  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3248  metal dependent phosphohydrolase  55.86 
 
 
961 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.819996  normal  0.0972265 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0342  hypothetical protein  48.92 
 
 
270 aa  151  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000914134  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0343  chemotactic transducer-related protein  47.56 
 
 
711 aa  146  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00597283  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  44.27 
 
 
792 aa  145  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0883  GAF domain-containing protein  41.03 
 
 
304 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3061  metal dependent phosphohydrolase  32.59 
 
 
419 aa  114  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1212  metal dependent phosphohydrolase  32.1 
 
 
418 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00677868  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2677  metal dependent phosphohydrolase  30.98 
 
 
415 aa  108  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.508126  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  27.11 
 
 
574 aa  104  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2659  GAF domain/HD domain-containing protein  29.06 
 
 
417 aa  100  9e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02399  hypothetical protein  54.35 
 
 
102 aa  100  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  28.09 
 
 
366 aa  97.8  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  27.6 
 
 
571 aa  95.1  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2145  metal dependent phosphohydrolase  23.69 
 
 
565 aa  87.4  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  28.72 
 
 
373 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  25.33 
 
 
911 aa  86.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  25.12 
 
 
861 aa  85.5  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  39.84 
 
 
636 aa  85.9  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  38.71 
 
 
424 aa  85.1  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 
602 aa  85.1  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.525886  normal  0.309242 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  24.74 
 
 
864 aa  85.1  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  31.21 
 
 
371 aa  84  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
539 aa  83.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  38.33 
 
 
419 aa  83.2  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  29.39 
 
 
612 aa  81.6  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  25.27 
 
 
859 aa  80.1  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2655  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  35.77 
 
 
353 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3527  metal dependent phosphohydrolase  23.25 
 
 
562 aa  79.3  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0752  metal dependent phosphohydrolase  31.69 
 
 
306 aa  79  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0100091  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2545  metal dependent phosphohydrolase  38.6 
 
 
269 aa  78.6  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3894  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.82 
 
 
353 aa  78.6  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109719  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1075  metal dependent phosphohydrolase  38.05 
 
 
425 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1147  metal dependent phosphohydrolase  38.05 
 
 
422 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  36.84 
 
 
1171 aa  77.8  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  24.91 
 
 
858 aa  77.8  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1079  metal dependent phosphohydrolase  38.05 
 
 
422 aa  77.8  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  37.72 
 
 
649 aa  77.8  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  37.39 
 
 
654 aa  77.4  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  31.61 
 
 
760 aa  77  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  37.96 
 
 
635 aa  77  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1357  metal dependent phosphohydrolase  34.82 
 
 
444 aa  75.5  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1749  metal dependent phosphohydrolase  44.14 
 
 
392 aa  75.5  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.601239  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.93 
 
 
351 aa  75.1  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0055  metal dependent phosphohydrolase  36.07 
 
 
248 aa  75.5  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  36.59 
 
 
399 aa  75.1  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1437  metal dependent phosphohydrolase  39.45 
 
 
471 aa  74.7  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  35.83 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4196  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.05 
 
 
350 aa  74.7  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0488  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 
462 aa  74.7  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.354545  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0663  putative PAS/PAC sensor protein  36.07 
 
 
384 aa  74.3  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  25.42 
 
 
860 aa  73.9  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3491  HDIG domain-containing protein  37.17 
 
 
422 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3509  metal-dependent phosphohydrolase  37.17 
 
 
351 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  32.26 
 
 
1237 aa  73.6  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0479  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.23 
 
 
350 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1189  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 
434 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.972086  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0538  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.83 
 
 
363 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.973232  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2670  metal dependent phosphohydrolase, HD region  29.8 
 
 
344 aa  72.8  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1998  hypothetical protein  27.87 
 
 
195 aa  72.8  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.95956  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2495  metal dependent phosphohydrolase  38.53 
 
 
400 aa  73.2  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>