More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3357 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3357  hypothetical protein  100 
 
 		 528 aa  1094    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1857  metal dependent phosphohydrolase  53.98 
 
 		 746 aa  570  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3620  GAF containing protein  53.28 
 
 		 540 aa  558  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0301  metal dependent phosphohydrolase  50.95 
 
 		 542 aa  498  1e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0133  metal dependent phosphohydrolase  48.75 
 
 		 524 aa  484  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.140491  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2177  metal dependent phosphohydrolase  44.91 
 
 		 576 aa  457  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1538  metal dependent phosphohydrolase  44 
 
 		 1004 aa  457  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.13069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2026  metal dependent phosphohydrolase  43.56 
 
 		 568 aa  438  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00491297  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  42.37 
 
 		 796 aa  418  9.999999999999999e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0337  metal dependent phosphohydrolase  38.08 
 
 		 515 aa  352  8e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3006  metal dependent phosphohydrolase  40.31 
 
 		 983 aa  350  3e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182003 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2105  putative metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 		 938 aa  338  1.9999999999999998e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0250  putative metal dependent phosphohydrolase  35.03 
 
 		 980 aa  330  3e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270817  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3976  metal dependent phosphohydrolase, HD region  37.63 
 
 		 980 aa  329  6e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2386  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 		 984 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2287  HAMP domain-containing protein  35.71 
 
 		 984 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1571  metal dependent phosphohydrolase  41.36 
 
 		 964 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1901  metal dependent phosphohydrolase  38.62 
 
 		 962 aa  295  1e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0333053  hitchhiker  0.00824164 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2068  membrane protein  39.07 
 
 		 840 aa  288  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4432  metal dependent phosphohydrolase  33.51 
 
 		 686 aa  286  9e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1233  metal dependent phosphohydrolase  33.27 
 
 		 544 aa  280  3e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.246188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3829  metal dependent phosphohydrolase  40.48 
 
 		 940 aa  280  6e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5032  metal dependent phosphohydrolase  35.26 
 
 		 539 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2304  metal dependent phosphohydrolase  34.24 
 
 		 691 aa  268  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2282  metal dependent phosphohydrolase  39.1 
 
 		 1061 aa  266  5e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156681  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4091  metal dependent phosphohydrolase  37.2 
 
 		 1060 aa  266  8e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0537  metal dependent phosphohydrolase  41.69 
 
 		 1056 aa  262  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02406  hypothetical protein  41.33 
 
 		 1048 aa  260  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0980  metal dependent phosphohydrolase  37.01 
 
 		 1065 aa  260  5.0000000000000005e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.63647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2193  metal dependent phosphohydrolase  31.92 
 
 		 560 aa  256  1.0000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.579233  normal  0.606327 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0539  putative metal dependent phosphohydrolase  36.67 
 
 		 1073 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0428  integral membrane protein, putative two-component signal transducer  35.55 
 
 		 1054 aa  248  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812941  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3366  metal dependent phosphohydrolase  37.79 
 
 		 1065 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0538  metal dependent phosphohydrolase  36.86 
 
 		 1055 aa  246  9e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.329724  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2599  metal dependent phosphohydrolase  35.7 
 
 		 796 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.047672 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3876  hypothetical protein  37.21 
 
 		 973 aa  244  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3248  metal dependent phosphohydrolase  37.3 
 
 		 961 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.819996  normal  0.0972265 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3667  metal dependent phosphohydrolase  36.94 
 
 		 1102 aa  232  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0651  metal dependent phosphohydrolase  36.13 
 
 		 1067 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3126  metal dependent phosphohydrolase  43.56 
 
 		 968 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02400  hypothetical protein  39.43 
 
 		 840 aa  179  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0342  hypothetical protein  38.37 
 
 		 270 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000914134  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  48.45 
 
 		 792 aa  156  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0343  chemotactic transducer-related protein  45.14 
 
 		 711 aa  148  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00597283  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3061  metal dependent phosphohydrolase  32.36 
 
 		 419 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0883  GAF domain-containing protein  39.38 
 
 		 304 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1212  metal dependent phosphohydrolase  32.61 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00677868  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2677  metal dependent phosphohydrolase  31.33 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.508126  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2659  GAF domain/HD domain-containing protein  31.34 
 
 		 417 aa  112  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  26.3 
 
 		 371 aa  102  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  29.01 
 
 		 574 aa  97.8  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  44.83 
 
 		 636 aa  97.1  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  26.86 
 
 		 366 aa  90.9  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3188  HD domain-containing protein  40 
 
 		 417 aa  88.2  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  37.39 
 
 		 424 aa  88.2  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  34.93 
 
 		 363 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  31.16 
 
 		 571 aa  85.1  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  36.61 
 
 		 635 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2526  metal dependent phosphohydrolase  37.38 
 
 		 403 aa  84  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376552 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  37.39 
 
 		 647 aa  84  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  37.39 
 
 		 647 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0810  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.21 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 602 aa  83.6  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.525886  normal  0.309242 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0839  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.21 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02399  hypothetical protein  46.59 
 
 		 102 aa  83.2  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  39.64 
 
 		 654 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  32.24 
 
 		 864 aa  81.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  32.47 
 
 		 612 aa  81.3  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0335  metal dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 		 403 aa  80.5  0.00000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1412  metal dependent phosphohydrolase  38.53 
 
 		 461 aa  80.9  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.397441 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0585  metal dependent phosphohydrolase  36.43 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1765  metal dependent phosphohydrolase  39.25 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00286355  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0055  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0752  metal dependent phosphohydrolase  34.43 
 
 		 306 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0100091  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1357  metal dependent phosphohydrolase  31.3 
 
 		 444 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1075  metal dependent phosphohydrolase  33.91 
 
 		 425 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  35.83 
 
 		 648 aa  79.3  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1079  metal dependent phosphohydrolase  35.65 
 
 		 422 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  32.19 
 
 		 390 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1251  metal-dependent phosphohydrolase  37.61 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.390467 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  35.54 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1147  metal dependent phosphohydrolase  33.91 
 
 		 422 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  28.72 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  35.25 
 
 		 431 aa  78.6  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.54 
 
 		 491 aa  78.2  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1749  metal dependent phosphohydrolase  32.39 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.601239  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  38.33 
 
 		 1171 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0679  response regulator receiver  33.86 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0836964  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0737  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1507  putative PAS/PAC sensor protein  38.46 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000751678  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  30.11 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2866  metal dependent phosphohydrolase  38.74 
 
 		 432 aa  77  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.128247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  33.59 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3491  HDIG domain-containing protein  32.17 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0307  hypothetical protein  35.9 
 
 		 460 aa  76.6  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  38.79 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  25.36 
 
 		 465 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  34.92 
 
 		 518 aa  76.3  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1189  metal dependent phosphohydrolase  34.21 
 
 		 434 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.972086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  34.17 
 
 		 619 aa  76.6  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>