More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3126 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2599  metal dependent phosphohydrolase  96.98 
 
 		 796 aa  1544    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.047672 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3006  metal dependent phosphohydrolase  41 
 
 		 983 aa  645    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182003 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3126  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 968 aa  1960    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2105  putative metal dependent phosphohydrolase  45.19 
 
 		 938 aa  788    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3248  metal dependent phosphohydrolase  84.67 
 
 		 961 aa  1597    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.819996  normal  0.0972265 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0250  putative metal dependent phosphohydrolase  50.16 
 
 		 980 aa  920    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270817  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3976  metal dependent phosphohydrolase, HD region  41.18 
 
 		 980 aa  629  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3876  hypothetical protein  38.75 
 
 		 973 aa  615  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1901  metal dependent phosphohydrolase  33.89 
 
 		 962 aa  565  1.0000000000000001e-159  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0333053  hitchhiker  0.00824164 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1571  metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 		 964 aa  548  1e-154  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2287  HAMP domain-containing protein  34.18 
 
 		 984 aa  544  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2386  metal dependent phosphohydrolase  34.18 
 
 		 984 aa  544  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1538  metal dependent phosphohydrolase  34.69 
 
 		 1004 aa  528  1e-148  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.13069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3829  metal dependent phosphohydrolase  30.12 
 
 		 940 aa  476  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4091  metal dependent phosphohydrolase  52.32 
 
 		 1060 aa  437  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0538  metal dependent phosphohydrolase  52.87 
 
 		 1055 aa  434  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.329724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0537  metal dependent phosphohydrolase  52.91 
 
 		 1056 aa  431  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0651  metal dependent phosphohydrolase  47.89 
 
 		 1067 aa  424  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3366  metal dependent phosphohydrolase  50.97 
 
 		 1065 aa  420  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0539  putative metal dependent phosphohydrolase  47.78 
 
 		 1073 aa  414  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3667  metal dependent phosphohydrolase  46.17 
 
 		 1102 aa  416  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2068  membrane protein  36.79 
 
 		 840 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0980  metal dependent phosphohydrolase  47.47 
 
 		 1065 aa  402  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.63647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2282  metal dependent phosphohydrolase  47.97 
 
 		 1061 aa  396  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156681  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02406  hypothetical protein  50.91 
 
 		 1048 aa  386  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0428  integral membrane protein, putative two-component signal transducer  45.89 
 
 		 1054 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812941  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1857  metal dependent phosphohydrolase  34.75 
 
 		 746 aa  310  5.9999999999999995e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3620  GAF containing protein  37.5 
 
 		 540 aa  294  6e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0133  metal dependent phosphohydrolase  35.59 
 
 		 524 aa  277  8e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.140491  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02400  hypothetical protein  48.79 
 
 		 840 aa  276  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2177  metal dependent phosphohydrolase  32.65 
 
 		 576 aa  270  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0343  chemotactic transducer-related protein  27.94 
 
 		 711 aa  262  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00597283  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0342  hypothetical protein  49.8 
 
 		 270 aa  245  3e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000914134  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  30.08 
 
 		 796 aa  224  9e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2026  metal dependent phosphohydrolase  26.59 
 
 		 568 aa  189  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00491297  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3357  hypothetical protein  43.56 
 
 		 528 aa  187  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0337  metal dependent phosphohydrolase  25.94 
 
 		 515 aa  179  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4432  metal dependent phosphohydrolase  29.24 
 
 		 686 aa  167  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206968  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2598  hypothetical protein  92.16 
 
 		 115 aa  161  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146267  normal  0.0658488 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5032  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 		 539 aa  156  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0301  metal dependent phosphohydrolase  49.32 
 
 		 542 aa  147  8.000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  24.82 
 
 		 726 aa  128  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2304  metal dependent phosphohydrolase  45.67 
 
 		 691 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  23.86 
 
 		 724 aa  102  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02399  hypothetical protein  54.95 
 
 		 102 aa  101  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1233  metal dependent phosphohydrolase  36.22 
 
 		 544 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.246188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  22.93 
 
 		 702 aa  100  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2193  metal dependent phosphohydrolase  37.98 
 
 		 560 aa  100  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.579233  normal  0.606327 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  26.79 
 
 		 651 aa  95.9  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  24.17 
 
 		 637 aa  94.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  39.69 
 
 		 760 aa  85.5  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  39.13 
 
 		 636 aa  84.7  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  22.94 
 
 		 643 aa  83.2  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  37.61 
 
 		 424 aa  83.6  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3786  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.95 
 
 		 610 aa  81.3  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0254049  normal  0.3858 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  36.69 
 
 		 419 aa  80.5  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  36.89 
 
 		 654 aa  80.1  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2567  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.82 
 
 		 768 aa  79  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0479714  hitchhiker  0.00000000485501 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1079  metal dependent phosphohydrolase  34.75 
 
 		 422 aa  79  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 		 431 aa  77.4  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3823  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.44 
 
 		 354 aa  77.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  22.76 
 
 		 701 aa  76.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  32.5 
 
 		 647 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  21.09 
 
 		 712 aa  75.9  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  32.5 
 
 		 647 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1391  metal dependent phosphohydrolase  34.51 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.142811  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1147  metal dependent phosphohydrolase  33.9 
 
 		 422 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1075  metal dependent phosphohydrolase  33.9 
 
 		 425 aa  75.5  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2526  metal dependent phosphohydrolase  36.04 
 
 		 403 aa  75.1  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376552 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1911  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  37.29 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0445959  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3509  metal-dependent phosphohydrolase  36.13 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2545  metal dependent phosphohydrolase  40.34 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  36.13 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5340  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.35 
 
 		 348 aa  73.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64097  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  33.81 
 
 		 404 aa  73.9  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  35.29 
 
 		 411 aa  73.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3816  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.04 
 
 		 351 aa  73.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0960158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1357  metal dependent phosphohydrolase  29.93 
 
 		 444 aa  73.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1749  metal dependent phosphohydrolase  36.54 
 
 		 392 aa  73.2  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.601239  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1189  metal dependent phosphohydrolase  33.09 
 
 		 434 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.972086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0538  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.04 
 
 		 363 aa  73.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.973232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  37.07 
 
 		 1171 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  38.95 
 
 		 635 aa  73.2  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0995  metal dependent phosphohydrolase  39.25 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  36.97 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1097  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.61 
 
 		 391 aa  73.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151318 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  32.05 
 
 		 389 aa  72  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  46.51 
 
 		 319 aa  72  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  42.05 
 
 		 431 aa  72  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  35 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3111  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.83 
 
 		 596 aa  71.6  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2563  metal dependent phosphohydrolase  37.84 
 
 		 422 aa  71.2  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30647  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0627  metal dependent phosphohydrolase  33.91 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0839  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.44 
 
 		 343 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0526  methyl-accepting chemotaxis protein  22.45 
 
 		 658 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  21.38 
 
 		 701 aa  70.5  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5980  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.23 
 
 		 599 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  35.2 
 
 		 399 aa  70.5  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0663  response regulator receiver  44.87 
 
 		 340 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1813  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.96 
 
 		 512 aa  70.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0479529  normal  0.434013 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>