More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2068 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2068  membrane protein  100 
 
 		 840 aa  1720    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3876  hypothetical protein  37.05 
 
 		 973 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3248  metal dependent phosphohydrolase  37.89 
 
 		 961 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.819996  normal  0.0972265 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1901  metal dependent phosphohydrolase  38.25 
 
 		 962 aa  421  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0333053  hitchhiker  0.00824164 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1571  metal dependent phosphohydrolase  35.75 
 
 		 964 aa  421  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3006  metal dependent phosphohydrolase  39.14 
 
 		 983 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182003 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2599  metal dependent phosphohydrolase  39.08 
 
 		 796 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.047672 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2386  metal dependent phosphohydrolase  37.44 
 
 		 984 aa  409  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3976  metal dependent phosphohydrolase, HD region  39.23 
 
 		 980 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2287  HAMP domain-containing protein  37.44 
 
 		 984 aa  409  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3126  metal dependent phosphohydrolase  36.79 
 
 		 968 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3829  metal dependent phosphohydrolase  36.38 
 
 		 940 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2105  putative metal dependent phosphohydrolase  39.08 
 
 		 938 aa  397  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1538  metal dependent phosphohydrolase  48.66 
 
 		 1004 aa  395  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.13069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0250  putative metal dependent phosphohydrolase  37.04 
 
 		 980 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270817  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0537  metal dependent phosphohydrolase  50.26 
 
 		 1056 aa  373  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0538  metal dependent phosphohydrolase  47.96 
 
 		 1055 aa  356  1e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.329724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0651  metal dependent phosphohydrolase  48.98 
 
 		 1067 aa  355  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4091  metal dependent phosphohydrolase  46.31 
 
 		 1060 aa  352  2e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2282  metal dependent phosphohydrolase  45.91 
 
 		 1061 aa  349  1e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156681  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0539  putative metal dependent phosphohydrolase  47.55 
 
 		 1073 aa  348  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3667  metal dependent phosphohydrolase  48.21 
 
 		 1102 aa  348  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0428  integral membrane protein, putative two-component signal transducer  45.1 
 
 		 1054 aa  337  5e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812941  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02406  hypothetical protein  46.89 
 
 		 1048 aa  335  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3366  metal dependent phosphohydrolase  45.5 
 
 		 1065 aa  335  2e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1857  metal dependent phosphohydrolase  41.83 
 
 		 746 aa  334  4e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3620  GAF containing protein  42.95 
 
 		 540 aa  323  6e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0980  metal dependent phosphohydrolase  41.46 
 
 		 1065 aa  314  5.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.63647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3357  hypothetical protein  39.07 
 
 		 528 aa  278  4e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0301  metal dependent phosphohydrolase  35.78 
 
 		 542 aa  265  2e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0133  metal dependent phosphohydrolase  39.24 
 
 		 524 aa  263  8.999999999999999e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.140491  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0342  hypothetical protein  50.8 
 
 		 270 aa  252  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000914134  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  37.24 
 
 		 796 aa  248  3e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02400  hypothetical protein  45.55 
 
 		 840 aa  247  8e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2026  metal dependent phosphohydrolase  31.56 
 
 		 568 aa  224  4e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00491297  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2177  metal dependent phosphohydrolase  32.18 
 
 		 576 aa  223  8e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0337  metal dependent phosphohydrolase  28.51 
 
 		 515 aa  192  2.9999999999999997e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0343  chemotactic transducer-related protein  30.59 
 
 		 711 aa  181  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00597283  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5032  metal dependent phosphohydrolase  28.83 
 
 		 539 aa  154  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2304  metal dependent phosphohydrolase  28.36 
 
 		 691 aa  153  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4432  metal dependent phosphohydrolase  27.11 
 
 		 686 aa  150  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1233  metal dependent phosphohydrolase  28.72 
 
 		 544 aa  137  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.246188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2193  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 		 560 aa  131  6e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.579233  normal  0.606327 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02399  hypothetical protein  51.04 
 
 		 102 aa  100  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2495  metal dependent phosphohydrolase  44.95 
 
 		 400 aa  86.3  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  36.72 
 
 		 636 aa  85.5  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  38.71 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  38.05 
 
 		 760 aa  82.8  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  37.27 
 
 		 635 aa  82.4  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0335  metal dependent phosphohydrolase  38.26 
 
 		 403 aa  77.4  0.0000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1357  metal dependent phosphohydrolase  32.37 
 
 		 444 aa  76.6  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  35.34 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0342  metal dependent phosphohydrolase  36.13 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0974  metal dependent phosphohydrolase  32.84 
 
 		 160 aa  75.1  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00455004  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  30.97 
 
 		 647 aa  74.7  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  30.97 
 
 		 647 aa  74.7  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0752  metal dependent phosphohydrolase  33.91 
 
 		 306 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0100091  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  31.53 
 
 		 654 aa  73.9  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  34.21 
 
 		 649 aa  73.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1911  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  36.75 
 
 		 268 aa  72.4  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0445959  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1793  metal dependent phosphohydrolase  34.35 
 
 		 298 aa  72.8  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000123225  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  34.11 
 
 		 366 aa  72.8  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  35.34 
 
 		 1171 aa  72.4  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  36.67 
 
 		 710 aa  72  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  36.84 
 
 		 692 aa  72  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2563  metal dependent phosphohydrolase  33.64 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30647  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4319  Metal dependent phosphohydrolase with a response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  35.09 
 
 		 650 aa  71.2  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1765  metal dependent phosphohydrolase  28.67 
 
 		 436 aa  71.2  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00286355  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1919  hypothetical protein  34.06 
 
 		 384 aa  70.1  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.731705  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4392  metal dependent phosphohydrolase  38.95 
 
 		 407 aa  70.1  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.824859  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1391  metal dependent phosphohydrolase  34.09 
 
 		 420 aa  70.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.142811  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2655  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  28.95 
 
 		 353 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  32.17 
 
 		 417 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  36.13 
 
 		 401 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1079  metal dependent phosphohydrolase  33.04 
 
 		 422 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1598  metal dependent phosphohydrolase  34.21 
 
 		 547 aa  69.7  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1663  metal dependent phosphohydrolase  27.31 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.860701  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  35 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1075  metal dependent phosphohydrolase  33.04 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1147  metal dependent phosphohydrolase  33.04 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  34.26 
 
 		 648 aa  68.9  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3393  metal dependent phosphohydrolase  37.04 
 
 		 448 aa  69.3  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1463  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.4 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.404054 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3509  metal-dependent phosphohydrolase  35.4 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.84 
 
 		 491 aa  68.9  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  39.66 
 
 		 1073 aa  68.9  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1744  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.06 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3894  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.75 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109719  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  32.74 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  33.33 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5359  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.96 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  36.21 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.21 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0891  metal dependent phosphohydrolase  29.53 
 
 		 439 aa  68.2  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  30.7 
 
 		 619 aa  68.2  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3001  metal dependent phosphohydrolase  33.63 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  36.84 
 
 		 465 aa  67.8  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3816  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.4 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0960158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3640  metal dependent phosphohydrolase  35.4 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>