More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1571 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1571  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 964 aa  1984    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3006  metal dependent phosphohydrolase  38.62 
 
 		 983 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182003 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3876  hypothetical protein  37.39 
 
 		 973 aa  560  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3976  metal dependent phosphohydrolase, HD region  40.16 
 
 		 980 aa  553  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3126  metal dependent phosphohydrolase  36.69 
 
 		 968 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3248  metal dependent phosphohydrolase  36.32 
 
 		 961 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.819996  normal  0.0972265 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2105  putative metal dependent phosphohydrolase  35.52 
 
 		 938 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2287  HAMP domain-containing protein  34.59 
 
 		 984 aa  515  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2386  metal dependent phosphohydrolase  34.59 
 
 		 984 aa  515  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2599  metal dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 		 796 aa  509  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.047672 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1901  metal dependent phosphohydrolase  33.65 
 
 		 962 aa  490  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0333053  hitchhiker  0.00824164 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0250  putative metal dependent phosphohydrolase  35.75 
 
 		 980 aa  491  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270817  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3829  metal dependent phosphohydrolase  33.41 
 
 		 940 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1538  metal dependent phosphohydrolase  32.76 
 
 		 1004 aa  458  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.13069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2068  membrane protein  35.75 
 
 		 840 aa  421  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2282  metal dependent phosphohydrolase  48.38 
 
 		 1061 aa  359  9.999999999999999e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156681  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0651  metal dependent phosphohydrolase  47.33 
 
 		 1067 aa  349  1e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4091  metal dependent phosphohydrolase  45.7 
 
 		 1060 aa  347  6e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0428  integral membrane protein, putative two-component signal transducer  46.53 
 
 		 1054 aa  347  8e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812941  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0537  metal dependent phosphohydrolase  48.31 
 
 		 1056 aa  343  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0538  metal dependent phosphohydrolase  46.06 
 
 		 1055 aa  340  5e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.329724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02406  hypothetical protein  48.32 
 
 		 1048 aa  339  9.999999999999999e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3667  metal dependent phosphohydrolase  45.29 
 
 		 1102 aa  333  6e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0539  putative metal dependent phosphohydrolase  45.86 
 
 		 1073 aa  333  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3366  metal dependent phosphohydrolase  45.61 
 
 		 1065 aa  327  8.000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0980  metal dependent phosphohydrolase  41.34 
 
 		 1065 aa  326  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.63647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1857  metal dependent phosphohydrolase  40.86 
 
 		 746 aa  310  8e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3620  GAF containing protein  40.59 
 
 		 540 aa  300  8e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3357  hypothetical protein  41.36 
 
 		 528 aa  291  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0343  chemotactic transducer-related protein  31.8 
 
 		 711 aa  283  8.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00597283  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0133  metal dependent phosphohydrolase  37.39 
 
 		 524 aa  271  5e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.140491  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2177  metal dependent phosphohydrolase  32.75 
 
 		 576 aa  270  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0301  metal dependent phosphohydrolase  38.62 
 
 		 542 aa  266  2e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0342  hypothetical protein  51.38 
 
 		 270 aa  258  4e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000914134  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02400  hypothetical protein  47.02 
 
 		 840 aa  247  9e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  30.86 
 
 		 796 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0337  metal dependent phosphohydrolase  26.5 
 
 		 515 aa  188  5e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2304  metal dependent phosphohydrolase  30.12 
 
 		 691 aa  169  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5032  metal dependent phosphohydrolase  29.03 
 
 		 539 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1233  metal dependent phosphohydrolase  25.16 
 
 		 544 aa  142  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.246188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2026  metal dependent phosphohydrolase  49.63 
 
 		 568 aa  141  7e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00491297  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2193  metal dependent phosphohydrolase  38.76 
 
 		 560 aa  107  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.579233  normal  0.606327 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4432  metal dependent phosphohydrolase  37.88 
 
 		 686 aa  105  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02399  hypothetical protein  53.61 
 
 		 102 aa  103  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  27.18 
 
 		 637 aa  92  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  40.35 
 
 		 636 aa  85.1  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1251  metal-dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 461 aa  84.7  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.390467 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  28.02 
 
 		 643 aa  84.7  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1412  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 461 aa  84.3  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.397441 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  41.28 
 
 		 635 aa  81.3  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  34 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  38.94 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  36.84 
 
 		 654 aa  79.3  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1075  metal dependent phosphohydrolase  36.23 
 
 		 425 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1147  metal dependent phosphohydrolase  36.23 
 
 		 422 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0402  metal dependent phosphohydrolase  35.83 
 
 		 450 aa  77.8  0.0000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3894  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.59 
 
 		 353 aa  77  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109719  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3509  metal-dependent phosphohydrolase  42.48 
 
 		 351 aa  77  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3816  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.48 
 
 		 351 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0960158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1391  metal dependent phosphohydrolase  39.42 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.142811  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0538  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.48 
 
 		 363 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.973232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1079  metal dependent phosphohydrolase  36.23 
 
 		 422 aa  76.3  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  37.72 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0012  hypothetical protein  40.35 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000839505  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.72 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  37.19 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1749  metal dependent phosphohydrolase  39.22 
 
 		 392 aa  74.3  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.601239  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3491  HDIG domain-containing protein  36.96 
 
 		 422 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  37.96 
 
 		 703 aa  73.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0342  metal dependent phosphohydrolase  37.29 
 
 		 389 aa  73.2  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  36.3 
 
 		 619 aa  73.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0038  metal dependent phosphohydrolase  37.07 
 
 		 347 aa  73.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000509519  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003575  HDIG domain protein  36.11 
 
 		 421 aa  73.6  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  54.84 
 
 		 364 aa  73.6  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2382  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.42 
 
 		 359 aa  73.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1338  metal dependent phosphohydrolase  35.77 
 
 		 451 aa  73.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.427381 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0974  metal dependent phosphohydrolase  42.02 
 
 		 160 aa  72.8  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00455004  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  39.47 
 
 		 539 aa  72  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  33.81 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  36.28 
 
 		 647 aa  72  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5340  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.27 
 
 		 348 aa  72  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64097  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  34.59 
 
 		 419 aa  72  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0009  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  36.28 
 
 		 647 aa  71.6  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0585  metal dependent phosphohydrolase  33.1 
 
 		 420 aa  72  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  24.36 
 
 		 726 aa  71.6  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5359  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.59 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2012  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  51.52 
 
 		 531 aa  71.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0999069  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1189  metal dependent phosphohydrolase  36.15 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.972086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3096  metal dependent phosphohydrolase  31.85 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.789641  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  37.23 
 
 		 703 aa  71.2  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2526  metal dependent phosphohydrolase  31.91 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376552 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3239  metal dependent phosphohydrolase  31.85 
 
 		 421 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  34.06 
 
 		 760 aa  70.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  37.96 
 
 		 710 aa  70.9  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0679  metal dependent phosphohydrolase  31.85 
 
 		 571 aa  70.5  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0891  metal dependent phosphohydrolase  35.48 
 
 		 439 aa  70.9  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3269  response regulator  34.71 
 
 		 600 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.633194  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0479  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45 
 
 		 350 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0230  metal dependent phosphohydrolase  35.51 
 
 		 383 aa  70.9  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000415135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>