More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3876 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3976  metal dependent phosphohydrolase, HD region  43.76 
 
 		 980 aa  691    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3876  hypothetical protein  100 
 
 		 973 aa  1988    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3006  metal dependent phosphohydrolase  44.04 
 
 		 983 aa  716    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182003 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3248  metal dependent phosphohydrolase  39.53 
 
 		 961 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.819996  normal  0.0972265 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3126  metal dependent phosphohydrolase  39.11 
 
 		 968 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2386  metal dependent phosphohydrolase  36.83 
 
 		 984 aa  613  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2287  HAMP domain-containing protein  36.83 
 
 		 984 aa  613  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0250  putative metal dependent phosphohydrolase  39.19 
 
 		 980 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270817  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2105  putative metal dependent phosphohydrolase  38.06 
 
 		 938 aa  589  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1901  metal dependent phosphohydrolase  35.26 
 
 		 962 aa  588  1e-166  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0333053  hitchhiker  0.00824164 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1571  metal dependent phosphohydrolase  37.39 
 
 		 964 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453782  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2599  metal dependent phosphohydrolase  41.21 
 
 		 796 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.047672 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3829  metal dependent phosphohydrolase  32.45 
 
 		 940 aa  513  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1538  metal dependent phosphohydrolase  35.85 
 
 		 1004 aa  501  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.13069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2068  membrane protein  37.05 
 
 		 840 aa  437  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3366  metal dependent phosphohydrolase  50.75 
 
 		 1065 aa  399  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0537  metal dependent phosphohydrolase  49.12 
 
 		 1056 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2282  metal dependent phosphohydrolase  49.16 
 
 		 1061 aa  392  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156681  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4091  metal dependent phosphohydrolase  48.13 
 
 		 1060 aa  392  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0651  metal dependent phosphohydrolase  48.64 
 
 		 1067 aa  388  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0538  metal dependent phosphohydrolase  49.15 
 
 		 1055 aa  389  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.329724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0539  putative metal dependent phosphohydrolase  46.31 
 
 		 1073 aa  378  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3667  metal dependent phosphohydrolase  47.24 
 
 		 1102 aa  379  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02406  hypothetical protein  50 
 
 		 1048 aa  372  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0980  metal dependent phosphohydrolase  44.96 
 
 		 1065 aa  357  8.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.63647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0428  integral membrane protein, putative two-component signal transducer  46.63 
 
 		 1054 aa  354  4e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812941  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1857  metal dependent phosphohydrolase  36.99 
 
 		 746 aa  338  1.9999999999999998e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3620  GAF containing protein  38.64 
 
 		 540 aa  291  6e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0133  metal dependent phosphohydrolase  38.95 
 
 		 524 aa  290  1e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.140491  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0343  chemotactic transducer-related protein  29.36 
 
 		 711 aa  287  5.999999999999999e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00597283  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0301  metal dependent phosphohydrolase  35.96 
 
 		 542 aa  286  1.0000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2177  metal dependent phosphohydrolase  32.2 
 
 		 576 aa  271  2.9999999999999997e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0342  hypothetical protein  50.78 
 
 		 270 aa  256  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000914134  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02400  hypothetical protein  46.07 
 
 		 840 aa  246  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2026  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 		 568 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00491297  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3357  hypothetical protein  37.21 
 
 		 528 aa  232  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  28.95 
 
 		 796 aa  211  5e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0337  metal dependent phosphohydrolase  28.05 
 
 		 515 aa  199  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2304  metal dependent phosphohydrolase  30.12 
 
 		 691 aa  187  9e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5032  metal dependent phosphohydrolase  28.45 
 
 		 539 aa  181  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1233  metal dependent phosphohydrolase  25.95 
 
 		 544 aa  164  9e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.246188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4432  metal dependent phosphohydrolase  26.17 
 
 		 686 aa  163  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2193  metal dependent phosphohydrolase  26.55 
 
 		 560 aa  160  8e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.579233  normal  0.606327 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  27.36 
 
 		 651 aa  111  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02399  hypothetical protein  53.68 
 
 		 102 aa  101  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  38.52 
 
 		 636 aa  93.6  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  24.25 
 
 		 724 aa  93.2  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  25.29 
 
 		 712 aa  91.7  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  25.91 
 
 		 726 aa  88.2  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  36.3 
 
 		 760 aa  82.8  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5359  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.36 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1251  metal-dependent phosphohydrolase  39.58 
 
 		 461 aa  81.3  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.390467 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  32.5 
 
 		 417 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1412  metal dependent phosphohydrolase  39.58 
 
 		 461 aa  80.9  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.397441 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1437  metal dependent phosphohydrolase  37.4 
 
 		 471 aa  79.3  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3894  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109719  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  33.33 
 
 		 431 aa  78.6  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  26.65 
 
 		 637 aa  78.2  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  33.82 
 
 		 647 aa  77.8  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0307  hypothetical protein  40 
 
 		 460 aa  77.8  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  35.43 
 
 		 635 aa  77.4  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  33.82 
 
 		 647 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  32.88 
 
 		 654 aa  77.4  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  31.85 
 
 		 390 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  32.52 
 
 		 648 aa  76.6  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1357  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 		 444 aa  76.3  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2382  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.64 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  25.22 
 
 		 643 aa  74.7  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1075  metal dependent phosphohydrolase  34.88 
 
 		 425 aa  74.7  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  31.72 
 
 		 424 aa  73.9  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0038  metal dependent phosphohydrolase  33.64 
 
 		 347 aa  73.9  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000509519  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1147  metal dependent phosphohydrolase  34.65 
 
 		 422 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  38.94 
 
 		 1171 aa  74.3  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2526  metal dependent phosphohydrolase  37.37 
 
 		 403 aa  73.9  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376552 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  45.35 
 
 		 427 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  45.35 
 
 		 395 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  44.83 
 
 		 393 aa  73.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.35 
 
 		 351 aa  73.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1911  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  33.82 
 
 		 268 aa  73.6  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0445959  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0663  response regulator receiver  48.72 
 
 		 340 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0974  metal dependent phosphohydrolase  36.11 
 
 		 160 aa  73.2  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00455004  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3491  HDIG domain-containing protein  35.96 
 
 		 422 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2545  metal dependent phosphohydrolase  40.71 
 
 		 269 aa  73.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3823  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.09 
 
 		 354 aa  73.2  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  48.1 
 
 		 419 aa  72.8  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03429  two-component system response regulator (hybrid family) protein  50.63 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3786  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.06 
 
 		 529 aa  72  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  45.57 
 
 		 401 aa  72  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1749  metal dependent phosphohydrolase  31.3 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.601239  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3458  response regulator receiver  32.87 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  32.85 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  43.02 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  25.56 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1079  metal dependent phosphohydrolase  34.65 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1261  metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00227498  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1097  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.53 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151318 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  23.08 
 
 		 701 aa  71.2  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0402  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0752  metal dependent phosphohydrolase  32.33 
 
 		 306 aa  70.9  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0100091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>