More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2386 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2287  HAMP domain-containing protein  100 
 
 		 984 aa  2043    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2386  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 984 aa  2043    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3006  metal dependent phosphohydrolase  38.44 
 
 		 983 aa  634  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3976  metal dependent phosphohydrolase, HD region  38.58 
 
 		 980 aa  616  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3876  hypothetical protein  36.83 
 
 		 973 aa  608  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3829  metal dependent phosphohydrolase  35.85 
 
 		 940 aa  568  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2105  putative metal dependent phosphohydrolase  34.9 
 
 		 938 aa  559  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1901  metal dependent phosphohydrolase  34.94 
 
 		 962 aa  539  9.999999999999999e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0333053  hitchhiker  0.00824164 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3126  metal dependent phosphohydrolase  35.15 
 
 		 968 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2599  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 		 796 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.047672 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1571  metal dependent phosphohydrolase  34.59 
 
 		 964 aa  515  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1538  metal dependent phosphohydrolase  33.63 
 
 		 1004 aa  515  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.13069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0250  putative metal dependent phosphohydrolase  32.52 
 
 		 980 aa  512  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270817  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3248  metal dependent phosphohydrolase  32.84 
 
 		 961 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.819996  normal  0.0972265 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2068  membrane protein  37.44 
 
 		 840 aa  409  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3667  metal dependent phosphohydrolase  49.28 
 
 		 1102 aa  391  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4091  metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 		 1060 aa  392  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0537  metal dependent phosphohydrolase  51.3 
 
 		 1056 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0539  putative metal dependent phosphohydrolase  48.77 
 
 		 1073 aa  386  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0651  metal dependent phosphohydrolase  50.26 
 
 		 1067 aa  385  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0538  metal dependent phosphohydrolase  51.94 
 
 		 1055 aa  381  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.329724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0428  integral membrane protein, putative two-component signal transducer  48.54 
 
 		 1054 aa  380  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812941  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2282  metal dependent phosphohydrolase  50.9 
 
 		 1061 aa  377  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156681  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3366  metal dependent phosphohydrolase  51.3 
 
 		 1065 aa  379  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02406  hypothetical protein  51.17 
 
 		 1048 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1857  metal dependent phosphohydrolase  37.22 
 
 		 746 aa  351  4e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0980  metal dependent phosphohydrolase  45.05 
 
 		 1065 aa  350  6e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.63647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3357  hypothetical protein  35.38 
 
 		 528 aa  314  4.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0301  metal dependent phosphohydrolase  35.74 
 
 		 542 aa  307  7e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0343  chemotactic transducer-related protein  31.77 
 
 		 711 aa  304  5.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00597283  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3620  GAF containing protein  36.95 
 
 		 540 aa  291  5.0000000000000004e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0133  metal dependent phosphohydrolase  37.33 
 
 		 524 aa  284  6.000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.140491  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2177  metal dependent phosphohydrolase  30.86 
 
 		 576 aa  272  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  33.93 
 
 		 796 aa  263  2e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0342  hypothetical protein  50 
 
 		 270 aa  260  8e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000914134  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02400  hypothetical protein  45.45 
 
 		 840 aa  254  6e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2026  metal dependent phosphohydrolase  28.4 
 
 		 568 aa  229  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00491297  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0337  metal dependent phosphohydrolase  26.38 
 
 		 515 aa  207  8e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2304  metal dependent phosphohydrolase  24.89 
 
 		 691 aa  177  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1233  metal dependent phosphohydrolase  25.93 
 
 		 544 aa  164  8.000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.246188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5032  metal dependent phosphohydrolase  25.92 
 
 		 539 aa  161  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4432  metal dependent phosphohydrolase  25.13 
 
 		 686 aa  156  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2193  metal dependent phosphohydrolase  25.87 
 
 		 560 aa  151  6e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.579233  normal  0.606327 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02399  hypothetical protein  50 
 
 		 102 aa  97.4  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  21.97 
 
 		 726 aa  89.7  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1075  metal dependent phosphohydrolase  36.23 
 
 		 425 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1147  metal dependent phosphohydrolase  36.23 
 
 		 422 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 424 aa  84  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1079  metal dependent phosphohydrolase  36.23 
 
 		 422 aa  84.3  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3491  HDIG domain-containing protein  34.78 
 
 		 422 aa  82  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1189  metal dependent phosphohydrolase  37.84 
 
 		 434 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.972086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  42.2 
 
 		 431 aa  78.6  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2563  metal dependent phosphohydrolase  33.09 
 
 		 422 aa  78.2  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30647  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1391  metal dependent phosphohydrolase  37.14 
 
 		 420 aa  76.3  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.142811  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1919  hypothetical protein  34.75 
 
 		 384 aa  75.9  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.731705  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0402  metal dependent phosphohydrolase  32.61 
 
 		 450 aa  76.3  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003575  HDIG domain protein  33.33 
 
 		 421 aa  76.3  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  36.97 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 636 aa  75.1  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  22.27 
 
 		 643 aa  74.7  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  38.66 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  29.33 
 
 		 417 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0342  metal dependent phosphohydrolase  28.36 
 
 		 389 aa  73.9  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  31.88 
 
 		 390 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  32.84 
 
 		 760 aa  72.8  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0488  metal dependent phosphohydrolase  27.91 
 
 		 462 aa  73.2  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.354545  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  28.65 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  39.36 
 
 		 465 aa  72  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  35.96 
 
 		 650 aa  72  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3393  metal dependent phosphohydrolase  32.58 
 
 		 448 aa  71.2  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1749  metal dependent phosphohydrolase  36.29 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.601239  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  36.84 
 
 		 635 aa  70.9  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2495  metal dependent phosphohydrolase  32.61 
 
 		 400 aa  70.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  31.16 
 
 		 389 aa  70.1  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0995  metal dependent phosphohydrolase  33.96 
 
 		 418 aa  70.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  37.39 
 
 		 427 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  24.57 
 
 		 366 aa  70.1  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  22.45 
 
 		 637 aa  70.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  39.81 
 
 		 419 aa  70.1  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3894  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.4 
 
 		 353 aa  69.3  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109719  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3077  metal dependent phosphohydrolase  32.77 
 
 		 328 aa  69.7  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1338  metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 		 451 aa  69.3  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.427381 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5340  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.02 
 
 		 348 aa  69.7  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64097  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0974  metal dependent phosphohydrolase  37.96 
 
 		 160 aa  69.7  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00455004  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  35.65 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0335  metal dependent phosphohydrolase  32.76 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1339  metal dependent phosphohydrolase  32.68 
 
 		 463 aa  68.2  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000978961  normal  0.92428 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1251  metal-dependent phosphohydrolase  34.23 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.390467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1412  metal dependent phosphohydrolase  35.14 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.397441 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  29.17 
 
 		 710 aa  67.8  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  30.66 
 
 		 649 aa  67.8  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  31.58 
 
 		 712 aa  67.4  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0663  response regulator receiver  47.44 
 
 		 340 aa  67.4  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  32.14 
 
 		 400 aa  67.4  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  29.93 
 
 		 401 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  36.13 
 
 		 414 aa  67.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3509  metal-dependent phosphohydrolase  35.16 
 
 		 351 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  43.37 
 
 		 571 aa  66.6  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 		 399 aa  66.6  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  33.61 
 
 		 411 aa  67  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>