More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2282 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02406  hypothetical protein  38.35 
 
 		 1048 aa  719    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2282  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 1061 aa  2199    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156681  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0539  putative metal dependent phosphohydrolase  45.13 
 
 		 1073 aa  967    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3366  metal dependent phosphohydrolase  47.82 
 
 		 1065 aa  1018    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4091  metal dependent phosphohydrolase  45.55 
 
 		 1060 aa  983    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0651  metal dependent phosphohydrolase  45.97 
 
 		 1067 aa  967    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0428  integral membrane protein, putative two-component signal transducer  40.8 
 
 		 1054 aa  858    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812941  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0537  metal dependent phosphohydrolase  46.93 
 
 		 1056 aa  951    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0538  metal dependent phosphohydrolase  43.73 
 
 		 1055 aa  892    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.329724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3667  metal dependent phosphohydrolase  45.05 
 
 		 1102 aa  957    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0980  metal dependent phosphohydrolase  38.98 
 
 		 1065 aa  766    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.63647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02400  hypothetical protein  36.77 
 
 		 840 aa  574  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2105  putative metal dependent phosphohydrolase  53.72 
 
 		 938 aa  443  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3248  metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 		 961 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.819996  normal  0.0972265 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2599  metal dependent phosphohydrolase  47.3 
 
 		 796 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.047672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3126  metal dependent phosphohydrolase  47.97 
 
 		 968 aa  406  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3876  hypothetical protein  49.4 
 
 		 973 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1538  metal dependent phosphohydrolase  49.62 
 
 		 1004 aa  399  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.13069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3006  metal dependent phosphohydrolase  51.91 
 
 		 983 aa  388  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182003 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0250  putative metal dependent phosphohydrolase  49.51 
 
 		 980 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270817  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2386  metal dependent phosphohydrolase  50.9 
 
 		 984 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2287  HAMP domain-containing protein  50.9 
 
 		 984 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3976  metal dependent phosphohydrolase, HD region  49.77 
 
 		 980 aa  375  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.777517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3829  metal dependent phosphohydrolase  48.09 
 
 		 940 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1901  metal dependent phosphohydrolase  49.11 
 
 		 962 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0333053  hitchhiker  0.00824164 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1571  metal dependent phosphohydrolase  48.38 
 
 		 964 aa  363  1e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2068  membrane protein  45.91 
 
 		 840 aa  357  8.999999999999999e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1857  metal dependent phosphohydrolase  40.09 
 
 		 746 aa  294  6e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3357  hypothetical protein  38.85 
 
 		 528 aa  259  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3620  GAF containing protein  37.86 
 
 		 540 aa  248  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2177  metal dependent phosphohydrolase  36.96 
 
 		 576 aa  244  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0301  metal dependent phosphohydrolase  34.29 
 
 		 542 aa  225  4e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0342  hypothetical protein  47.66 
 
 		 270 aa  221  3.9999999999999997e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000914134  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  31.43 
 
 		 796 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2026  metal dependent phosphohydrolase  31.3 
 
 		 568 aa  182  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00491297  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0133  metal dependent phosphohydrolase  54.36 
 
 		 524 aa  169  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.140491  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5032  metal dependent phosphohydrolase  31.97 
 
 		 539 aa  155  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0337  metal dependent phosphohydrolase  28.07 
 
 		 515 aa  154  8e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0343  chemotactic transducer-related protein  54.62 
 
 		 711 aa  141  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00597283  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.3 
 
 		 2213 aa  132  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1233  metal dependent phosphohydrolase  28.23 
 
 		 544 aa  129  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.246188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4432  metal dependent phosphohydrolase  26.37 
 
 		 686 aa  123  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2304  metal dependent phosphohydrolase  40.88 
 
 		 691 aa  120  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02399  hypothetical protein  56.25 
 
 		 102 aa  114  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  24.9 
 
 		 1574 aa  108  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.85 
 
 		 2654 aa  104  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.27 
 
 		 1410 aa  101  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4029  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  26.05 
 
 		 1244 aa  95.1  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  22.62 
 
 		 2035 aa  94.7  8e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1958  putative PAS/PAC sensor protein  25.19 
 
 		 598 aa  93.2  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0417  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.79 
 
 		 1247 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2193  metal dependent phosphohydrolase  37.7 
 
 		 560 aa  90.1  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.579233  normal  0.606327 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1075  metal dependent phosphohydrolase  35.85 
 
 		 425 aa  89.4  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1147  metal dependent phosphohydrolase  35.85 
 
 		 422 aa  89.4  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.837057  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2367  diguanylate cyclase  23.73 
 
 		 923 aa  89.4  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.457753  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0420  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  24.79 
 
 		 1247 aa  88.6  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1079  metal dependent phosphohydrolase  35.22 
 
 		 422 aa  88.2  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0386  sensory box protein  24.37 
 
 		 1247 aa  87.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.298787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  23.48 
 
 		 775 aa  87.8  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4816  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.37 
 
 		 1247 aa  87.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.201907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12730  metal dependent phosphohydrolase  39.23 
 
 		 424 aa  87.4  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.53 
 
 		 1248 aa  86.3  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  30.15 
 
 		 726 aa  85.5  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1920  diguanylate cyclase  24.47 
 
 		 893 aa  85.5  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1889  diguanylate cyclase  21.99 
 
 		 714 aa  85.1  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.838759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  23.32 
 
 		 778 aa  84.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3491  HDIG domain-containing protein  33.96 
 
 		 422 aa  84  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2113  PAS  25.62 
 
 		 1206 aa  82.8  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.819255  normal  0.387177 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.31 
 
 		 1194 aa  82.4  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0814409  normal  0.0127622 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0759  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.04 
 
 		 818 aa  82  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0726  histidine kinase  23.69 
 
 		 570 aa  80.5  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.408803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07500  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1245 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.411522  normal  0.391796 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2326  extracellular solute-binding protein/sensory box protein  24.17 
 
 		 751 aa  79  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163187  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2782  Hpt sensor hybrid histidine kinase  25.71 
 
 		 1091 aa  79  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003575  HDIG domain protein  30.77 
 
 		 421 aa  79  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0144  sensor protein evgS precursor  23.55 
 
 		 830 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2080  diguanylate cyclase  23.16 
 
 		 934 aa  77.8  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0191  sensor protein EvgS  23.14 
 
 		 830 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.337786  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1189  metal dependent phosphohydrolase  30.52 
 
 		 434 aa  77  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.972086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3808  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.72 
 
 		 808 aa  76.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0284545  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3921  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.72 
 
 		 808 aa  76.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.799409 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0829  Hpt sensor hybrid histidine kinase  25.66 
 
 		 812 aa  77  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177536 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3689  diguanylate cyclase  23.15 
 
 		 935 aa  75.9  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  36.28 
 
 		 636 aa  75.9  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2527  Hpt sensor hybrid histidine kinase  25.96 
 
 		 1090 aa  75.5  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120042  normal  0.0845157 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1864  Hpt sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 1069 aa  75.1  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1911  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  38.6 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0445959  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.59 
 
 		 940 aa  75.1  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3639  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.1 
 
 		 1210 aa  74.7  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.847136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3077  metal dependent phosphohydrolase  37.72 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2100  two-component sensor protein  25.1 
 
 		 1211 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  0.142111 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.52 
 
 		 1436 aa  73.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.701044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3358  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.52 
 
 		 1436 aa  73.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.504651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0621  hypothetical protein  41.25 
 
 		 431 aa  74.3  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  26 
 
 		 1788 aa  74.3  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2752  metal-dependent phosphohydrolase  38.18 
 
 		 456 aa  73.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.204771  normal  0.694957 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1357  metal dependent phosphohydrolase  31.4 
 
 		 444 aa  73.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6654  Hpt sensor hybrid histidine kinase  23.57 
 
 		 829 aa  73.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000220106 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1162  two-component sensor  23.67 
 
 		 1215 aa  73.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4255  PAS/PAC sensor, hybrid histidine kinase  23.81 
 
 		 1418 aa  73.2  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377123  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>