36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1840 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1840  GAF domain protein  100 
 
 		 382 aa  763    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1233  metal dependent phosphohydrolase  27.57 
 
 		 544 aa  80.1  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.246188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2193  metal dependent phosphohydrolase  24.4 
 
 		 560 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.579233  normal  0.606327 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5032  metal dependent phosphohydrolase  24.46 
 
 		 539 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2659  GAF domain/HD domain-containing protein  25.87 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0301  metal dependent phosphohydrolase  24.07 
 
 		 542 aa  57.4  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0337  metal dependent phosphohydrolase  24.77 
 
 		 515 aa  54.7  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  20.6 
 
 		 792 aa  53.5  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4432  metal dependent phosphohydrolase  23.55 
 
 		 686 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2304  metal dependent phosphohydrolase  26.9 
 
 		 691 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2677  metal dependent phosphohydrolase  26.17 
 
 		 415 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.508126  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  25.2 
 
 		 861 aa  51.2  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0133  metal dependent phosphohydrolase  21.98 
 
 		 524 aa  51.2  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.140491  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3116  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0115  Stage II sporulation E family protein  28.69 
 
 		 429 aa  50.1  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  24.07 
 
 		 860 aa  49.7  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0467  putative GAF sensor protein  37.33 
 
 		 736 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.116791  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3061  metal dependent phosphohydrolase  27.34 
 
 		 419 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00443  type II secretion system protein E:GAF domain  38.67 
 
 		 738 aa  49.7  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  26.79 
 
 		 859 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2248  putative GAF sensor protein  27.52 
 
 		 182 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2177  metal dependent phosphohydrolase  22.36 
 
 		 576 aa  47.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3357  hypothetical protein  21.17 
 
 		 528 aa  46.6  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.15 
 
 		 1017 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1998  hypothetical protein  22.76 
 
 		 195 aa  46.6  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.95956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1212  metal dependent phosphohydrolase  28.07 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00677868  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2026  metal dependent phosphohydrolase  22.16 
 
 		 568 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00491297  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0335  metal dependent phosphohydrolase  26.53 
 
 		 403 aa  44.3  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  21.33 
 
 		 366 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2264  putative GAF sensor protein  26.03 
 
 		 236 aa  43.9  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0011  metal dependent phosphohydrolase  26.63 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000714378  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1857  metal dependent phosphohydrolase  24.2 
 
 		 746 aa  43.5  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0295  putative phytochrome sensor protein  24.07 
 
 		 767 aa  43.1  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.42905  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0051  metal dependent phosphohydrolase  34.67 
 
 		 407 aa  42.7  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0883  GAF domain-containing protein  20.42 
 
 		 304 aa  42.7  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3938  putative GAF sensor protein  32.35 
 
 		 806 aa  42.7  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>