53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1998 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1998  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  393  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.95956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1233  metal dependent phosphohydrolase  38.67 
 
 		 544 aa  114  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.246188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5032  metal dependent phosphohydrolase  40.13 
 
 		 539 aa  111  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2193  metal dependent phosphohydrolase  39.18 
 
 		 560 aa  97.4  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.579233  normal  0.606327 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4432  metal dependent phosphohydrolase  31.37 
 
 		 686 aa  92.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.206968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2677  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 		 415 aa  82  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.508126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3061  metal dependent phosphohydrolase  33.74 
 
 		 419 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1212  metal dependent phosphohydrolase  33.9 
 
 		 418 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00677868  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1857  metal dependent phosphohydrolase  27.87 
 
 		 746 aa  72.8  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  36.8 
 
 		 858 aa  72.8  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0301  metal dependent phosphohydrolase  32.65 
 
 		 542 aa  72.4  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 602 aa  72  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.525886  normal  0.309242 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2026  metal dependent phosphohydrolase  33.57 
 
 		 568 aa  69.3  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00491297  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  33.87 
 
 		 864 aa  68.9  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  30.92 
 
 		 612 aa  68.6  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2304  metal dependent phosphohydrolase  32.89 
 
 		 691 aa  68.6  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2177  metal dependent phosphohydrolase  31.17 
 
 		 576 aa  68.6  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  32.12 
 
 		 859 aa  68.2  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2659  GAF domain/HD domain-containing protein  30.56 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0133  metal dependent phosphohydrolase  31.41 
 
 		 524 aa  65.1  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.140491  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0930  metal dependent phosphohydrolase  29.7 
 
 		 796 aa  64.3  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2892  putative phytochrome sensor protein  31.86 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0337  metal dependent phosphohydrolase  25.45 
 
 		 515 aa  62.4  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3357  hypothetical protein  28.65 
 
 		 528 aa  62  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3938  putative GAF sensor protein  33.9 
 
 		 806 aa  58.2  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.34 
 
 		 792 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3620  GAF containing protein  25.41 
 
 		 540 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3659  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.79 
 
 		 362 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0907  putative PAS/PAC sensor protein  32.86 
 
 		 535 aa  55.5  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0295  putative phytochrome sensor protein  38.1 
 
 		 767 aa  54.3  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.42905  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0279  putative phytochrome sensor protein  29.45 
 
 		 767 aa  52.8  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  29.27 
 
 		 860 aa  52  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1538  metal dependent phosphohydrolase  28.3 
 
 		 1004 aa  52  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.13069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0923  putative phytochrome sensor protein  30.89 
 
 		 794 aa  51.6  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1971  putative phytochrome sensor protein  29.63 
 
 		 771 aa  50.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000984823  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 		 861 aa  49.7  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  39.39 
 
 		 438 aa  49.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3238  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  26.77 
 
 		 662 aa  47.8  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0144494  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  29.93 
 
 		 571 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0883  GAF domain-containing protein  36.64 
 
 		 304 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  35.63 
 
 		 911 aa  46.6  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1014 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1840  GAF domain protein  22.76 
 
 		 382 aa  46.6  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  34.78 
 
 		 423 aa  45.8  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 815 aa  45.4  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  30.28 
 
 		 903 aa  45.1  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 1017 aa  44.7  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1844  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.27 
 
 		 356 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3639  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  33.77 
 
 		 547 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00185015  normal  0.0105552 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0051  metal dependent phosphohydrolase  26.39 
 
 		 407 aa  43.1  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1244  putative phytochrome sensor protein  24.55 
 
 		 772 aa  42.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000557718  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3785  putative GAF sensor protein  29.73 
 
 		 302 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.674833  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3644  putative GAF sensor protein  29.73 
 
 		 306 aa  41.2  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>