More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3512 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3512  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 647 aa  1296    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4136  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.08 
 
 		 660 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.08 
 
 		 660 aa  559  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.751262  normal  0.782794 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4208  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.23 
 
 		 660 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.94 
 
 		 658 aa  554  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3813  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.94 
 
 		 658 aa  555  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0320682 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3904  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.94 
 
 		 658 aa  554  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.202773  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4635  methyl-accepting chemotaxis protein  51.63 
 
 		 658 aa  548  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3848  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.62 
 
 		 660 aa  535  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0148  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.05 
 
 		 651 aa  521  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.06 
 
 		 646 aa  520  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.723587  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3639  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.67 
 
 		 652 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3540  chemotaxis sensory transducer  45.21 
 
 		 668 aa  481  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.502982  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.52 
 
 		 648 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0139  methyl-accepting chemotaxis protein  28.9 
 
 		 650 aa  216  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.69 
 
 		 628 aa  160  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00619864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5564  putative chemotaxis transducer  31.17 
 
 		 657 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01753  hypothetical protein  37.04 
 
 		 545 aa  149  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64060  putative chemotaxis transducer  30.95 
 
 		 657 aa  146  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.22 
 
 		 654 aa  140  7e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  32.8 
 
 		 545 aa  133  9e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0622  chemotaxis sensory transducer  30.36 
 
 		 648 aa  132  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.33 
 
 		 558 aa  127  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3827  methyl-accepting chemotaxis transducer  34.87 
 
 		 695 aa  126  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221184 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0607  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.91 
 
 		 653 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100705 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.02 
 
 		 552 aa  124  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.52 
 
 		 653 aa  124  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0562  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.95 
 
 		 653 aa  123  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1091  chemotaxis sensory transducer  28.32 
 
 		 620 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0174472  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.68 
 
 		 554 aa  122  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2273  methyl-accepting chemotaxis protein  29.06 
 
 		 650 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.487735  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 527 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3502  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.27 
 
 		 620 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.666992  normal  0.2901 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2239  chemotaxis sensory transducer  32.57 
 
 		 648 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.1 
 
 		 554 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3725  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.48 
 
 		 620 aa  120  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2309  methyl-accepting chemotaxis protein-like protein  51.49 
 
 		 547 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.037772  hitchhiker  0.0000415162 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3533  methyl-accepting chemotaxis protein  28.8 
 
 		 660 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2609  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.53 
 
 		 621 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.27 
 
 		 527 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  33.1 
 
 		 557 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.41 
 
 		 554 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.65 
 
 		 620 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.566037  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3642  methyl-accepting chemotaxis protein  38.49 
 
 		 673 aa  119  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.92 
 
 		 653 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.149752 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.56 
 
 		 707 aa  118  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.852924  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2955  chemotaxis sensory transducer  34.66 
 
 		 497 aa  118  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.56 
 
 		 554 aa  118  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0226  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.13 
 
 		 527 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.22 
 
 		 554 aa  118  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1699  methyl-accepting chemotaxis protein  28.61 
 
 		 660 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.606414  hitchhiker  0.000000000000351139 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4233  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.13 
 
 		 525 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000524679 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.78 
 
 		 554 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.48 
 
 		 554 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.73 
 
 		 640 aa  117  5e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43692  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.66 
 
 		 554 aa  117  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2954  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.56 
 
 		 620 aa  117  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000679912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3768  chemotaxis sensory transducer  38.14 
 
 		 560 aa  117  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2212  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.54 
 
 		 549 aa  117  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004004  methyl-accepting chemotaxis protein  33.59 
 
 		 663 aa  117  6.9999999999999995e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0734  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.4 
 
 		 643 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.770301  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3056  methyl-accepting chemotaxis protein  28.07 
 
 		 650 aa  117  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  28.07 
 
 		 650 aa  117  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.279097  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3169  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.44 
 
 		 620 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  32.72 
 
 		 554 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  28.07 
 
 		 660 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  33.65 
 
 		 623 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3425  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.42 
 
 		 418 aa  116  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146645  hitchhiker  0.000433 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2327  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.47 
 
 		 554 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644098  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.23 
 
 		 527 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.436185 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0606  methyl-accepting chemotaxis protein  28.42 
 
 		 587 aa  116  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0016  methyl-accepting chemotaxis protein  28.01 
 
 		 660 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.12 
 
 		 544 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  30.41 
 
 		 553 aa  116  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.61 
 
 		 673 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.73728 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.08 
 
 		 620 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.733563  normal  0.773778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.61 
 
 		 673 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3099  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.36 
 
 		 672 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.500846  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0764  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.48 
 
 		 620 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0622  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.74 
 
 		 539 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.321986 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.65 
 
 		 554 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1076  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.9 
 
 		 673 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.450868  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1061  methyl-accepting chemotaxis protein  33.61 
 
 		 626 aa  115  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646209  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.68 
 
 		 548 aa  115  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0974  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.9 
 
 		 673 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2733  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.48 
 
 		 579 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0796  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.85 
 
 		 620 aa  115  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0792  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.08 
 
 		 620 aa  115  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.912748  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05387  histidine kinase  29.64 
 
 		 589 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.9 
 
 		 673 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.32 
 
 		 634 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  33.89 
 
 		 621 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2891  chemotaxis sensory transducer  35.19 
 
 		 673 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1043  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.9 
 
 		 673 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.530938  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00119  methyl-accepting chemotaxis protein  35.4 
 
 		 626 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0691  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 620 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3551  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 620 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183884 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 620 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.35347 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.6 
 
 		 568 aa  114  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0962  methyl-accepting chemotaxis protein  31.48 
 
 		 643 aa  114  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000917898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>