More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0717 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5564  putative chemotaxis transducer  64.38 
 
 		 657 aa  738    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0562  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.83 
 
 		 653 aa  740    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0607  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.29 
 
 		 653 aa  731    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100705 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.6 
 
 		 653 aa  718    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.149752 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 654 aa  1265    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0622  chemotaxis sensory transducer  66.09 
 
 		 648 aa  754    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.98 
 
 		 653 aa  738    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64060  putative chemotaxis transducer  63.47 
 
 		 657 aa  710    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.76 
 
 		 650 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.02 
 
 		 540 aa  181  4e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.92 
 
 		 773 aa  180  9e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  43.18 
 
 		 523 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.94 
 
 		 544 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.11 
 
 		 543 aa  178  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.37 
 
 		 640 aa  177  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.91 
 
 		 638 aa  174  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  34.66 
 
 		 629 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0956  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.08 
 
 		 676 aa  172  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.01 
 
 		 541 aa  172  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.62 
 
 		 411 aa  171  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  28.18 
 
 		 640 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.33 
 
 		 548 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  34.88 
 
 		 642 aa  170  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.34 
 
 		 681 aa  170  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.73 
 
 		 637 aa  170  7e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3680  methyl-accepting chemotaxis protein  37.5 
 
 		 676 aa  170  9e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.7 
 
 		 642 aa  170  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3582  methyl-accepting chemotaxis protein  39.26 
 
 		 541 aa  169  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1637  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.66 
 
 		 538 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.662156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31400  putative chemotaxis transducer  35.06 
 
 		 575 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.307711  hitchhiker  0.0000000000413464 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1396  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.46 
 
 		 548 aa  168  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.664947  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.18 
 
 		 541 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.83 
 
 		 646 aa  167  8e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.805637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.62 
 
 		 830 aa  166  9e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  35.23 
 
 		 630 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  32.93 
 
 		 545 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.94 
 
 		 639 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1999  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.95 
 
 		 405 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2672  putative chemotaxis transducer  35.06 
 
 		 538 aa  165  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.119833  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.9 
 
 		 541 aa  165  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01731  Methyl-accepting chemotaxis protein  35.09 
 
 		 539 aa  164  6e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.64 
 
 		 639 aa  164  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.886367 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  36.66 
 
 		 712 aa  164  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.83 
 
 		 638 aa  164  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.85 
 
 		 543 aa  164  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4658  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.64 
 
 		 639 aa  164  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.96 
 
 		 568 aa  163  9e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.7 
 
 		 630 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0712  chemotaxis sensory transducer  37.01 
 
 		 541 aa  162  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000566108  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004004  methyl-accepting chemotaxis protein  30.22 
 
 		 663 aa  162  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.31 
 
 		 630 aa  162  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3848  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.8 
 
 		 660 aa  162  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.08 
 
 		 521 aa  162  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00326538  normal  0.948878 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.44 
 
 		 638 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1007  hemolysin secretion protein HylB  33.16 
 
 		 548 aa  162  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.702356  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  31.7 
 
 		 553 aa  162  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.61 
 
 		 630 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.61 
 
 		 630 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2562  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.46 
 
 		 671 aa  161  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046581 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2443  putative chemotaxis transducer  40.65 
 
 		 531 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  29.92 
 
 		 553 aa  162  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.43 
 
 		 541 aa  161  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.04 
 
 		 639 aa  161  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  31.72 
 
 		 541 aa  160  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  41.47 
 
 		 561 aa  161  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2952  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.57 
 
 		 541 aa  160  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000751538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.71 
 
 		 674 aa  160  6e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2954  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.7 
 
 		 620 aa  160  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000679912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01753  hypothetical protein  34.55 
 
 		 545 aa  160  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4317  chemotaxis sensory transducer  34.77 
 
 		 540 aa  160  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.05 
 
 		 544 aa  160  7e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.22 
 
 		 572 aa  160  7e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  34.88 
 
 		 633 aa  160  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.24 
 
 		 548 aa  160  8e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3621  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.42 
 
 		 555 aa  160  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.30858 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  36.33 
 
 		 712 aa  160  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.43 
 
 		 564 aa  159  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.93 
 
 		 638 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2659  methyl-accepting chemotaxis protein  34.61 
 
 		 556 aa  159  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1007  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.26 
 
 		 573 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.02936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.75 
 
 		 550 aa  159  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.76 
 
 		 544 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  34.15 
 
 		 559 aa  159  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.66 
 
 		 630 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.66 
 
 		 630 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.66 
 
 		 630 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.93 
 
 		 638 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.66 
 
 		 630 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0213  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.23 
 
 		 807 aa  158  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.344812 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.6 
 
 		 499 aa  158  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0811848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  38.52 
 
 		 521 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.976535  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.24 
 
 		 639 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.97 
 
 		 716 aa  158  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.93 
 
 		 638 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2502  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.23 
 
 		 649 aa  157  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.988754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0671  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.23 
 
 		 531 aa  157  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178659  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.52 
 
 		 636 aa  157  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2111  aerotaxis receptor Aer-2  38.52 
 
 		 521 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0317394 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2607  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.42 
 
 		 541 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00122932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3628  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.52 
 
 		 521 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>