More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0622 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0562  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.73 
 
 		 653 aa  874    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0607  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  75.04 
 
 		 653 aa  867    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100705 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.51 
 
 		 654 aa  768    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5564  putative chemotaxis transducer  65.91 
 
 		 657 aa  754    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64060  putative chemotaxis transducer  65.6 
 
 		 657 aa  731    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0622  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 648 aa  1269    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.73 
 
 		 653 aa  870    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  73.35 
 
 		 653 aa  822    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.149752 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.75 
 
 		 650 aa  180  9e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 		 541 aa  176  9e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.88 
 
 		 548 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3465  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.74 
 
 		 423 aa  172  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  36.71 
 
 		 712 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.24 
 
 		 638 aa  168  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.56 
 
 		 640 aa  168  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.57 
 
 		 773 aa  167  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.44 
 
 		 568 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  36.39 
 
 		 712 aa  166  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.24 
 
 		 646 aa  166  9e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.805637  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.45 
 
 		 716 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.6 
 
 		 543 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.23 
 
 		 674 aa  165  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4706  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.81 
 
 		 541 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.94 
 
 		 544 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.72 
 
 		 637 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.62 
 
 		 544 aa  165  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  36.07 
 
 		 541 aa  165  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1637  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.18 
 
 		 538 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.662156  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  35.6 
 
 		 541 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.87 
 
 		 544 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  34.5 
 
 		 634 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.1 
 
 		 540 aa  164  7e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  32.48 
 
 		 640 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  34.17 
 
 		 630 aa  162  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  33.97 
 
 		 642 aa  163  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1396  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.36 
 
 		 548 aa  163  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.664947  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  33.08 
 
 		 629 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.29 
 
 		 564 aa  162  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.07 
 
 		 544 aa  161  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.58 
 
 		 543 aa  161  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.13 
 
 		 541 aa  160  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.722367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.62 
 
 		 550 aa  160  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3220  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.86 
 
 		 539 aa  160  8e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0243326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.96 
 
 		 634 aa  160  9e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.13 
 
 		 541 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  decreased coverage  0.0000342214 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3582  methyl-accepting chemotaxis protein  33.72 
 
 		 541 aa  160  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0379  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.74 
 
 		 647 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.454626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.74 
 
 		 541 aa  160  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.452969  normal  0.355365 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.49 
 
 		 411 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  36.99 
 
 		 523 aa  159  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3621  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.59 
 
 		 555 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.30858 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.39 
 
 		 541 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.582352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4658  chemotaxis sensory transducer, Pas/Pac sensor  36.97 
 
 		 529 aa  159  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.15 
 
 		 638 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.59 
 
 		 555 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.57 
 
 		 539 aa  158  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.417897  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3067  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.57 
 
 		 539 aa  158  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0971462  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  33.04 
 
 		 642 aa  158  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2955  chemotaxis sensory transducer  32.22 
 
 		 497 aa  158  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.69 
 
 		 634 aa  158  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.86 
 
 		 630 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5160  methyl-accepting chemotaxis protein  37.81 
 
 		 647 aa  158  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.391343  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0712  chemotaxis sensory transducer  36.3 
 
 		 541 aa  158  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000566108  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1007  hemolysin secretion protein HylB  38.1 
 
 		 548 aa  157  5.0000000000000005e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.702356  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.86 
 
 		 630 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.62 
 
 		 541 aa  157  6e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.86 
 
 		 630 aa  157  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.56 
 
 		 545 aa  157  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.888266  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1660  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.59 
 
 		 538 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170942 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.86 
 
 		 630 aa  157  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  35.62 
 
 		 713 aa  157  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0213  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.43 
 
 		 807 aa  156  9e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.344812 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0974  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.04 
 
 		 532 aa  156  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.89 
 
 		 544 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.08 
 
 		 830 aa  156  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.21 
 
 		 492 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178377  decreased coverage  0.00000773933 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3459  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.21 
 
 		 492 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433284 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.49 
 
 		 807 aa  155  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  35.78 
 
 		 541 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4022  chemotaxis sensory transducer  39.08 
 
 		 493 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31400  putative chemotaxis transducer  33.91 
 
 		 575 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.307711  hitchhiker  0.0000000000413464 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00119  methyl-accepting chemotaxis protein  37.95 
 
 		 626 aa  155  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.67 
 
 		 638 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.88 
 
 		 541 aa  155  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  34.14 
 
 		 645 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.91 
 
 		 544 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.8 
 
 		 492 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224536 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1999  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.42 
 
 		 405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.52 
 
 		 638 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1776  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.93 
 
 		 543 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.87 
 
 		 541 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.01 
 
 		 541 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.58 
 
 		 630 aa  154  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.58 
 
 		 630 aa  154  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  34.56 
 
 		 633 aa  154  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2672  putative chemotaxis transducer  33.91 
 
 		 538 aa  154  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.119833  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.71 
 
 		 533 aa  154  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2728  chemotaxis sensory transducer  33.15 
 
 		 544 aa  154  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00837045  normal  0.306222 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.3 
 
 		 638 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.74 
 
 		 558 aa  154  5.9999999999999996e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>