More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0601 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0562  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  98.32 
 
 		 653 aa  1249    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0607  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  95.25 
 
 		 653 aa  1144    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100705 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5564  putative chemotaxis transducer  66.06 
 
 		 657 aa  753    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0622  chemotaxis sensory transducer  74.49 
 
 		 648 aa  870    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.98 
 
 		 654 aa  746    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 653 aa  1273    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  89.28 
 
 		 653 aa  1048    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.149752 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64060  putative chemotaxis transducer  65.2 
 
 		 657 aa  727    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.43 
 
 		 541 aa  180  8e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.74 
 
 		 543 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.59 
 
 		 773 aa  178  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.42 
 
 		 544 aa  176  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.81 
 
 		 638 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  27.96 
 
 		 640 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.72 
 
 		 646 aa  173  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.805637  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3465  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.68 
 
 		 423 aa  173  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.29 
 
 		 548 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 		 629 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.88 
 
 		 550 aa  171  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4964  methyl-accepting chemotaxis protein  36.63 
 
 		 545 aa  171  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.15 
 
 		 674 aa  171  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.62 
 
 		 650 aa  171  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2607  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.46 
 
 		 541 aa  171  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00122932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.29 
 
 		 637 aa  171  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  42.8 
 
 		 523 aa  170  7e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.06 
 
 		 544 aa  170  9e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0974  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.23 
 
 		 532 aa  170  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0956  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.35 
 
 		 676 aa  169  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.87 
 
 		 640 aa  168  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0712  chemotaxis sensory transducer  36.49 
 
 		 541 aa  168  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000566108  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.65 
 
 		 568 aa  169  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.84 
 
 		 632 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1396  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.43 
 
 		 548 aa  168  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.664947  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  38.36 
 
 		 633 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.32 
 
 		 492 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178377  decreased coverage  0.00000773933 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.58 
 
 		 541 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3459  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.32 
 
 		 492 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433284 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3582  methyl-accepting chemotaxis protein  38.59 
 
 		 541 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2955  chemotaxis sensory transducer  33.71 
 
 		 497 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.82 
 
 		 564 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3220  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.43 
 
 		 539 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0243326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.43 
 
 		 539 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.417897  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3067  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.43 
 
 		 539 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0971462  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.57 
 
 		 541 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1833  chemotaxis sensory transducer, Pas/Pac sensor  44.53 
 
 		 521 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.884809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.18 
 
 		 634 aa  165  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5811  putative chemotaxis transducer  42.52 
 
 		 647 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  39.34 
 
 		 647 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  34.66 
 
 		 630 aa  164  6e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.73 
 
 		 572 aa  164  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.76 
 
 		 630 aa  164  6e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.46 
 
 		 541 aa  164  6e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  34.09 
 
 		 712 aa  164  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.42 
 
 		 619 aa  164  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  40.21 
 
 		 521 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.976535  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.76 
 
 		 630 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2111  aerotaxis receptor Aer-2  40.21 
 
 		 521 aa  163  9e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0317394 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3628  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.21 
 
 		 521 aa  163  9e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00119  methyl-accepting chemotaxis protein  34.15 
 
 		 626 aa  163  9e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.11 
 
 		 558 aa  163  9e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.83 
 
 		 492 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224536 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.83 
 
 		 543 aa  163  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  33.81 
 
 		 712 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004004  methyl-accepting chemotaxis protein  30.9 
 
 		 663 aa  162  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2016  methyl-accepting chemotaxis protein  34.64 
 
 		 433 aa  162  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000104003  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4022  chemotaxis sensory transducer  35.05 
 
 		 493 aa  162  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.08 
 
 		 667 aa  162  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.21 
 
 		 411 aa  162  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.57 
 
 		 630 aa  162  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2398  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.71 
 
 		 656 aa  162  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.201842  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26280  putative chemotaxis transducer  40 
 
 		 545 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.917899 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  34.99 
 
 		 559 aa  161  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  34.77 
 
 		 642 aa  161  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.46 
 
 		 634 aa  161  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  32.28 
 
 		 545 aa  160  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  34.18 
 
 		 634 aa  161  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1912  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.44 
 
 		 492 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.407863  hitchhiker  0.000000143908 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.47 
 
 		 630 aa  160  6e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  43.44 
 
 		 521 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.814601 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.47 
 
 		 630 aa  160  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.47 
 
 		 630 aa  160  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3266  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.64 
 
 		 543 aa  160  6e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.47 
 
 		 630 aa  160  7e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.25 
 
 		 674 aa  160  7e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3010  chemotaxis sensory transducer  32.29 
 
 		 539 aa  160  7e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01518  hypothetical protein  31.46 
 
 		 674 aa  160  8e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.83 
 
 		 681 aa  160  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.04 
 
 		 541 aa  160  8e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  35.65 
 
 		 645 aa  160  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001073  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  34.1 
 
 		 628 aa  160  9e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3805  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.67 
 
 		 422 aa  160  9e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000721713  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28050  putative chemotaxis transducer  38.31 
 
 		 531 aa  160  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.652078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  30.5 
 
 		 638 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.1 
 
 		 540 aa  159  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  36.83 
 
 		 541 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0897  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.75 
 
 		 541 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.25 
 
 		 539 aa  159  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.6 
 
 		 674 aa  159  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2443  putative chemotaxis transducer  38.64 
 
 		 531 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.22 
 
 		 626 aa  158  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>