More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3067 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0622  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.76 
 
 		 539 aa  721    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.321986 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  99.63 
 
 		 539 aa  1072    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.417897  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3220  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  99.07 
 
 		 539 aa  1064    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0243326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3067  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 539 aa  1073    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0971462  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3010  chemotaxis sensory transducer  66.98 
 
 		 539 aa  703    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0524  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.09 
 
 		 539 aa  690    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01731  Methyl-accepting chemotaxis protein  32.72 
 
 		 539 aa  265  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.35 
 
 		 547 aa  234  4.0000000000000004e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0441023  normal  0.46066 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0143  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.54 
 
 		 539 aa  231  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.47 
 
 		 538 aa  228  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.797541  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.34 
 
 		 541 aa  213  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.97 
 
 		 645 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.72 
 
 		 637 aa  209  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  35.26 
 
 		 645 aa  208  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.91 
 
 		 645 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.91 
 
 		 645 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.84 
 
 		 645 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.658451 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.03 
 
 		 552 aa  206  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.31 
 
 		 636 aa  205  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1600  chemotaxis sensory transducer  28.36 
 
 		 538 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00759873  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.49 
 
 		 541 aa  200  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  36.97 
 
 		 712 aa  200  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  38.37 
 
 		 712 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.96 
 
 		 637 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  38.37 
 
 		 713 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.29 
 
 		 638 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.81 
 
 		 634 aa  197  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2955  chemotaxis sensory transducer  36.62 
 
 		 497 aa  197  6e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.84 
 
 		 716 aa  196  7e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0734  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.19 
 
 		 643 aa  195  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.770301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.25 
 
 		 634 aa  195  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  34.26 
 
 		 545 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.62 
 
 		 638 aa  194  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2220  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  35.41 
 
 		 646 aa  194  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.071358  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3169  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.26 
 
 		 620 aa  194  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.34 
 
 		 638 aa  194  5e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.45 
 
 		 564 aa  194  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0938  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.04 
 
 		 548 aa  193  8e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0657  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  34.28 
 
 		 648 aa  193  8e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.61 
 
 		 545 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650014  normal  0.35347 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.61 
 
 		 545 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.61 
 
 		 545 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194984 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.04 
 
 		 548 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2823  methyl-accepting chemotaxis transducer  28.13 
 
 		 550 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.61 
 
 		 545 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  35.65 
 
 		 639 aa  191  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.42 
 
 		 411 aa  192  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0401  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  32.82 
 
 		 539 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2448  methyl-accepting chemotaxis protein  35.13 
 
 		 646 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.718596  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  35.16 
 
 		 559 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.88 
 
 		 552 aa  191  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14959  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.55 
 
 		 636 aa  190  5e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.86 
 
 		 573 aa  190  7e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.86 
 
 		 548 aa  190  7e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 545 aa  189  9e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2116  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.05 
 
 		 545 aa  189  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2240  methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 		 545 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.34 
 
 		 548 aa  188  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1767  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.05 
 
 		 545 aa  188  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.381763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.05 
 
 		 545 aa  188  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3269  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 605 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000515244  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01753  hypothetical protein  33.85 
 
 		 545 aa  187  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.34 
 
 		 540 aa  187  4e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0081  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.47 
 
 		 544 aa  187  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.59 
 
 		 638 aa  187  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  36.54 
 
 		 553 aa  186  7e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.42 
 
 		 632 aa  186  8e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.01 
 
 		 568 aa  186  9e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  39.37 
 
 		 634 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.66 
 
 		 636 aa  186  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00353653  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.97 
 
 		 674 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3725  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.32 
 
 		 620 aa  184  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403145  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.15 
 
 		 544 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26280  putative chemotaxis transducer  37 
 
 		 545 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.917899 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  36.57 
 
 		 553 aa  184  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.16 
 
 		 773 aa  184  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0623  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.84 
 
 		 647 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.494937  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0584  methyl-accepting chemotaxis transducer  34.56 
 
 		 647 aa  183  7e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77697  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.15 
 
 		 544 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.32 
 
 		 499 aa  183  8.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0811848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.47 
 
 		 543 aa  183  9.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.01 
 
 		 630 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.2 
 
 		 572 aa  183  9.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00464  methyl-accepting chemotaxis protein  33.98 
 
 		 636 aa  182  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.39 
 
 		 542 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.53 
 
 		 546 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.54 
 
 		 560 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.05 
 
 		 547 aa  182  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1267  methyl-accepting chemotaxis protein  38.36 
 
 		 557 aa  182  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.56 
 
 		 648 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1929  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.38 
 
 		 662 aa  182  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23754  normal  0.0188929 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.9 
 
 		 647 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4964  methyl-accepting chemotaxis protein  35.33 
 
 		 545 aa  181  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2609  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.06 
 
 		 621 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2954  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.19 
 
 		 620 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000679912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2282  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.11 
 
 		 664 aa  181  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.330304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  36.53 
 
 		 561 aa  181  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  37.58 
 
 		 623 aa  181  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.21 
 
 		 668 aa  181  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3856  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.2 
 
 		 640 aa  181  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.825575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>