More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2823 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2823  methyl-accepting chemotaxis transducer  100 
 
 		 550 aa  1104    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01731  Methyl-accepting chemotaxis protein  33.7 
 
 		 539 aa  286  5.999999999999999e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0143  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.08 
 
 		 539 aa  251  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  37.43 
 
 		 634 aa  211  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.01 
 
 		 547 aa  210  4e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0441023  normal  0.46066 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1776  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.95 
 
 		 543 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.91 
 
 		 637 aa  205  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.04 
 
 		 638 aa  205  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.57 
 
 		 634 aa  204  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.06 
 
 		 634 aa  203  6e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3220  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.88 
 
 		 539 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0243326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.13 
 
 		 539 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.417897  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3067  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.88 
 
 		 539 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0971462  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.09 
 
 		 637 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.05 
 
 		 564 aa  197  6e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.96 
 
 		 495 aa  197  6e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000865197  normal  0.384283 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3116  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.49 
 
 		 495 aa  196  6e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.49 
 
 		 495 aa  196  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00108184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.52 
 
 		 540 aa  196  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.5 
 
 		 716 aa  194  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.92 
 
 		 538 aa  194  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.797541  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1176  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 495 aa  193  6e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00652986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 495 aa  193  6e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0413666  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 495 aa  193  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000101058  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  34.84 
 
 		 712 aa  193  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0567  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.14 
 
 		 633 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3213  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 495 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.023485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.92 
 
 		 573 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  34.56 
 
 		 712 aa  192  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0563  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.14 
 
 		 633 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.24 
 
 		 714 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0164438 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0539  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.14 
 
 		 633 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.92 
 
 		 548 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.63 
 
 		 548 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0938  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.92 
 
 		 548 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  34.52 
 
 		 713 aa  190  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0622  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.81 
 
 		 539 aa  190  7e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.321986 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1600  chemotaxis sensory transducer  30.19 
 
 		 538 aa  189  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00759873  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.84 
 
 		 558 aa  189  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.76 
 
 		 544 aa  188  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506259 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2607  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.75 
 
 		 541 aa  187  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00122932  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3699  methyl-accepting chemotaxis protein  38.21 
 
 		 543 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.61 
 
 		 497 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.615607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3269  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.16 
 
 		 605 aa  185  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000515244  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.21 
 
 		 640 aa  184  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3010  chemotaxis sensory transducer  27.26 
 
 		 539 aa  184  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0942  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.31 
 
 		 495 aa  183  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000202207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.29 
 
 		 560 aa  183  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.84 
 
 		 541 aa  183  7e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3557  methyl-accepting chemotaxis transducer  36.1 
 
 		 714 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.1 
 
 		 714 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.16 
 
 		 411 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.33 
 
 		 548 aa  182  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3256  methyl-accepting chemotaxis protein  34.28 
 
 		 558 aa  181  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00119  methyl-accepting chemotaxis protein  32.18 
 
 		 626 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  32.63 
 
 		 629 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0570  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.29 
 
 		 674 aa  181  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0657  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  35.16 
 
 		 648 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  33.83 
 
 		 632 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.14 
 
 		 628 aa  181  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  32.63 
 
 		 629 aa  181  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.24 
 
 		 554 aa  181  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.14 
 
 		 628 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  33.14 
 
 		 643 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  35.58 
 
 		 545 aa  180  5.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.15 
 
 		 552 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3773  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.14 
 
 		 633 aa  180  7e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  33.83 
 
 		 632 aa  179  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  36.25 
 
 		 559 aa  179  9e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01753  hypothetical protein  35.38 
 
 		 545 aa  179  9e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26280  putative chemotaxis transducer  40.66 
 
 		 545 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.917899 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2220  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  32.66 
 
 		 646 aa  179  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.071358  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.81 
 
 		 554 aa  178  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.18 
 
 		 542 aa  178  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29800  putative chemotaxis transducer  37.19 
 
 		 561 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00431462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.47 
 
 		 554 aa  177  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  34.69 
 
 		 629 aa  178  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1102  methyl-accepting chemotaxis protein  35.13 
 
 		 638 aa  177  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  33.24 
 
 		 553 aa  177  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2130  methyl-accepting chemotaxis protein  33.62 
 
 		 546 aa  177  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665531  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.08 
 
 		 541 aa  177  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  37.19 
 
 		 561 aa  177  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.18 
 
 		 544 aa  177  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  31.47 
 
 		 554 aa  176  7e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  34.69 
 
 		 629 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.99 
 
 		 438 aa  176  8e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.18 
 
 		 544 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2480  methyl-accepting chemotaxis protein  34.64 
 
 		 629 aa  176  8e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2074  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.54 
 
 		 714 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2246  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  35.22 
 
 		 629 aa  176  9e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.54 
 
 		 554 aa  176  9e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1228  methyl-accepting chemotaxis transducer  35.65 
 
 		 688 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.36 
 
 		 688 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.61 
 
 		 543 aa  176  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0081  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.1 
 
 		 544 aa  176  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.88 
 
 		 714 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33 
 
 		 552 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14959  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.14 
 
 		 572 aa  176  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29760  putative chemotaxis transducer  36.44 
 
 		 714 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3725  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.78 
 
 		 620 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403145  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>