More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3010 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_3067  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.98 
 
 		 539 aa  703    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0971462  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.35 
 
 		 539 aa  705    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.417897  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3010  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 539 aa  1068    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0622  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.86 
 
 		 539 aa  667    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.321986 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3220  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.53 
 
 		 539 aa  707    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0243326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0524  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  74.95 
 
 		 539 aa  766    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01731  Methyl-accepting chemotaxis protein  34.44 
 
 		 539 aa  271  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0143  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.84 
 
 		 539 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.15 
 
 		 547 aa  222  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0441023  normal  0.46066 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1600  chemotaxis sensory transducer  29.87 
 
 		 538 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00759873  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.54 
 
 		 538 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.797541  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.42 
 
 		 637 aa  201  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.96 
 
 		 541 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.11 
 
 		 638 aa  194  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.99 
 
 		 634 aa  193  8e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 		 544 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.68 
 
 		 552 aa  192  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.62 
 
 		 564 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.13 
 
 		 411 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.1 
 
 		 544 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0081  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.47 
 
 		 544 aa  188  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  36.16 
 
 		 634 aa  187  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2955  chemotaxis sensory transducer  36.97 
 
 		 497 aa  187  6e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.01 
 
 		 541 aa  187  6e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.65 
 
 		 636 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.05 
 
 		 638 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26280  putative chemotaxis transducer  40.64 
 
 		 545 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.917899 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.43 
 
 		 548 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05150  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.79 
 
 		 650 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.05 
 
 		 552 aa  184  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14959  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.73 
 
 		 638 aa  184  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.75 
 
 		 638 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.73 
 
 		 636 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.75 
 
 		 634 aa  183  7e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.9 
 
 		 548 aa  183  7e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.84 
 
 		 568 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.04 
 
 		 645 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.658451 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001273  methyl-accepting chemotaxis protein  35.91 
 
 		 638 aa  182  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.73 
 
 		 645 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2970  chemotaxis sensory transducer  40 
 
 		 712 aa  182  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  38.03 
 
 		 713 aa  182  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.26 
 
 		 573 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.05 
 
 		 637 aa  182  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0938  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.56 
 
 		 548 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.08 
 
 		 548 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.1 
 
 		 544 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.43 
 
 		 546 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01753  hypothetical protein  37.63 
 
 		 545 aa  180  7e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00464  methyl-accepting chemotaxis protein  32.22 
 
 		 636 aa  179  9e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.81 
 
 		 548 aa  179  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.1 
 
 		 544 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  36.23 
 
 		 639 aa  179  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.49 
 
 		 674 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.13 
 
 		 546 aa  179  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01518  hypothetical protein  31.04 
 
 		 674 aa  179  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.73 
 
 		 645 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.75 
 
 		 540 aa  178  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.73 
 
 		 645 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.5 
 
 		 716 aa  178  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  33.81 
 
 		 545 aa  178  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.8 
 
 		 572 aa  178  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  36.49 
 
 		 712 aa  177  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1091  chemotaxis sensory transducer  34.97 
 
 		 620 aa  177  5e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0174472  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2220  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  34.96 
 
 		 646 aa  177  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.071358  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3644  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.07 
 
 		 378 aa  176  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.31 
 
 		 560 aa  176  7e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.62 
 
 		 554 aa  176  8e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3169  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.51 
 
 		 620 aa  176  8e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.91 
 
 		 548 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4964  methyl-accepting chemotaxis protein  36.2 
 
 		 545 aa  176  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  36.54 
 
 		 712 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.53 
 
 		 499 aa  176  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0811848  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4675  methyl-accepting chemotaxis protein  31.28 
 
 		 701 aa  175  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595763  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3725  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.67 
 
 		 620 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403145  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2448  methyl-accepting chemotaxis protein  34.96 
 
 		 646 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.718596  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004004  methyl-accepting chemotaxis protein  29.13 
 
 		 663 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1102  methyl-accepting chemotaxis protein  37.43 
 
 		 638 aa  174  5e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0712  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.34 
 
 		 624 aa  173  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2607  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.24 
 
 		 541 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00122932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0470  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.01 
 
 		 668 aa  173  5.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  34.42 
 
 		 559 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.88 
 
 		 620 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.566037  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.11 
 
 		 648 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.74 
 
 		 554 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1228  methyl-accepting chemotaxis transducer  37.54 
 
 		 688 aa  173  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2823  methyl-accepting chemotaxis transducer  27.26 
 
 		 550 aa  173  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3522  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.26 
 
 		 636 aa  173  9e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0596  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.43 
 
 		 640 aa  173  9e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.270432 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2609  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.47 
 
 		 621 aa  172  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  33.16 
 
 		 645 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0657  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  32.86 
 
 		 648 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  38.1 
 
 		 553 aa  172  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4190  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.54 
 
 		 688 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.251316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  37.5 
 
 		 714 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3576  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.52 
 
 		 772 aa  172  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0207298 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  34.76 
 
 		 553 aa  172  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.68 
 
 		 554 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.88 
 
 		 543 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3269  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.21 
 
 		 605 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000515244  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.74 
 
 		 554 aa  172  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>