More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3425 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3425  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 418 aa  840    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146645  hitchhiker  0.000433 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2954  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.8 
 
 		 620 aa  205  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000679912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2609  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.53 
 
 		 621 aa  204  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3169  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.08 
 
 		 620 aa  203  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3502  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.73 
 
 		 620 aa  203  6e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.666992  normal  0.2901 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3725  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36 
 
 		 620 aa  199  6e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1091  chemotaxis sensory transducer  38.74 
 
 		 620 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0174472  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.17 
 
 		 620 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.566037  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.87 
 
 		 620 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.58 
 
 		 620 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.35347 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3551  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.58 
 
 		 620 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183884 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0691  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.58 
 
 		 620 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0796  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.77 
 
 		 620 aa  187  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  35.55 
 
 		 645 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  47.3 
 
 		 521 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.814601 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2111  aerotaxis receptor Aer-2  47.3 
 
 		 521 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0317394 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2327  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.25 
 
 		 554 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644098  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.52 
 
 		 637 aa  181  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3628  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.3 
 
 		 521 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  47.3 
 
 		 521 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.976535  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.37 
 
 		 554 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.42 
 
 		 645 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.63 
 
 		 645 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.658451 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.05 
 
 		 637 aa  179  7e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.39 
 
 		 555 aa  179  8e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.09 
 
 		 645 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2282  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.14 
 
 		 664 aa  178  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.330304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.91 
 
 		 620 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.733563  normal  0.773778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0792  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.91 
 
 		 620 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.912748  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3770  aerotaxis receptor Aer  36.81 
 
 		 521 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.29 
 
 		 554 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.09 
 
 		 645 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.06 
 
 		 554 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.02 
 
 		 554 aa  178  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.73 
 
 		 554 aa  177  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0734  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.06 
 
 		 643 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.770301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3576  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.66 
 
 		 772 aa  177  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0207298 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.73 
 
 		 554 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0764  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.59 
 
 		 620 aa  177  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.54 
 
 		 554 aa  176  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0185  methyl-accepting chemotaxis protein  31.23 
 
 		 770 aa  176  6e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44300  aerotaxis receptor Aer  36.54 
 
 		 521 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.44 
 
 		 554 aa  176  8e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4372  methyl-accepting chemotaxis protein  35.29 
 
 		 619 aa  176  9e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.92 
 
 		 554 aa  176  9e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.13 
 
 		 626 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.05 
 
 		 548 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000213036  normal  0.437149 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2212  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.58 
 
 		 549 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1929  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.42 
 
 		 662 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23754  normal  0.0188929 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2562  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.07 
 
 		 671 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046581 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2254  methyl-accepting chemotaxis protein  33.63 
 
 		 491 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177753  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.15 
 
 		 543 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.2 
 
 		 558 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  39.12 
 
 		 553 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.97 
 
 		 545 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  hitchhiker  0.00000653474 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.34 
 
 		 639 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  34.88 
 
 		 554 aa  173  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 552 aa  173  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.73 
 
 		 554 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.51 
 
 		 634 aa  172  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.01 
 
 		 554 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.01 
 
 		 568 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2059  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  32.29 
 
 		 491 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.116428  normal  0.539616 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.72 
 
 		 554 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.46 
 
 		 554 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  44.72 
 
 		 626 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02788  hypothetical protein  35.96 
 
 		 698 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.77 
 
 		 540 aa  171  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.96 
 
 		 564 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1833  chemotaxis sensory transducer, Pas/Pac sensor  45.95 
 
 		 521 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.884809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0962  methyl-accepting chemotaxis protein  33.24 
 
 		 643 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000917898  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.86 
 
 		 640 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.92 
 
 		 554 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.36 
 
 		 554 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.64 
 
 		 554 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.08 
 
 		 554 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.53 
 
 		 521 aa  170  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00326538  normal  0.948878 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  36.87 
 
 		 553 aa  170  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  35.99 
 
 		 714 aa  170  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.97 
 
 		 630 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.97 
 
 		 630 aa  170  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0756  methyl-accepting chemotaxis protein  33.25 
 
 		 558 aa  169  6e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  34.68 
 
 		 623 aa  169  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.97 
 
 		 630 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.97 
 
 		 630 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.05 
 
 		 492 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224536 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3838  methyl-accepting chemotaxis protein  35.86 
 
 		 620 aa  169  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.16 
 
 		 541 aa  168  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29760  putative chemotaxis transducer  35.99 
 
 		 714 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.53 
 
 		 638 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  33.43 
 
 		 713 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2891  chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 673 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0877  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35 
 
 		 540 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.11332 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.34 
 
 		 674 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2952  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.79 
 
 		 541 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000751538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.55 
 
 		 638 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.96 
 
 		 638 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3406  PAS  44.14 
 
 		 521 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387271  normal  0.671486 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.44 
 
 		 548 aa  167  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.62 
 
 		 668 aa  167  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>