More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4019 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3848  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.28 
 
 		 660 aa  685    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.67 
 
 		 660 aa  715    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.751262  normal  0.782794 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4635  methyl-accepting chemotaxis protein  61.57 
 
 		 658 aa  699    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 646 aa  1293    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.723587  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0148  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.61 
 
 		 651 aa  672    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.36 
 
 		 658 aa  699    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4208  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.51 
 
 		 660 aa  713    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4136  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.04 
 
 		 660 aa  716    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3639  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.23 
 
 		 652 aa  642    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3813  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.36 
 
 		 658 aa  701    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0320682 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3904  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.51 
 
 		 658 aa  702    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.202773  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.78 
 
 		 648 aa  556  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3540  chemotaxis sensory transducer  49.14 
 
 		 668 aa  530  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.502982  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3512  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.06 
 
 		 647 aa  520  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0139  methyl-accepting chemotaxis protein  32.41 
 
 		 650 aa  215  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.41 
 
 		 628 aa  167  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00619864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  30.95 
 
 		 545 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.01 
 
 		 640 aa  128  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43692  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5564  putative chemotaxis transducer  27.98 
 
 		 657 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1007  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.59 
 
 		 573 aa  125  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.02936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3269  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.97 
 
 		 605 aa  124  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000515244  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2193  methyl-accepting chemotaxis protein  36.26 
 
 		 697 aa  124  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  31.23 
 
 		 557 aa  123  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.92 
 
 		 571 aa  121  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  32.09 
 
 		 559 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1498  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.14 
 
 		 687 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000111484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3827  methyl-accepting chemotaxis transducer  29.06 
 
 		 695 aa  120  7e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221184 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2783  methyl-accepting chemotaxisprotein  35.13 
 
 		 690 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.468562 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0680  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.33 
 
 		 679 aa  117  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01753  hypothetical protein  33.08 
 
 		 545 aa  117  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2327  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.48 
 
 		 554 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644098  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.19 
 
 		 650 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64060  putative chemotaxis transducer  28.47 
 
 		 657 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.73 
 
 		 673 aa  115  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.712235  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.93 
 
 		 560 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2544  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.04 
 
 		 633 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00517521  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4190  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.72 
 
 		 688 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.251316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05150  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.06 
 
 		 650 aa  114  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.4 
 
 		 674 aa  114  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.73 
 
 		 673 aa  114  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.73728 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.73 
 
 		 673 aa  114  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.12 
 
 		 541 aa  114  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3212  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.73 
 
 		 673 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.990285  normal  0.659639 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  30.99 
 
 		 639 aa  114  8.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.96 
 
 		 632 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000055  methyl-accepting chemotaxis protein  32.08 
 
 		 543 aa  113  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000458726  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.04 
 
 		 525 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0210  methyl-accepting chemotaxis protein  32.28 
 
 		 543 aa  113  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000824359  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.42 
 
 		 637 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  32.11 
 
 		 564 aa  113  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0622  chemotaxis sensory transducer  26.92 
 
 		 648 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.65 
 
 		 647 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.03 
 
 		 677 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.787316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0900  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.24 
 
 		 573 aa  111  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.476047  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3099  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.14 
 
 		 672 aa  112  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.500846  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.94 
 
 		 638 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.26 
 
 		 654 aa  111  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1091  chemotaxis sensory transducer  28.94 
 
 		 620 aa  112  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0174472  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1770  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.27 
 
 		 538 aa  112  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1228  methyl-accepting chemotaxis transducer  31.56 
 
 		 688 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.54 
 
 		 572 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 		 634 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1249  methyl-accepting chemotaxis protein  31.72 
 
 		 596 aa  111  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000483868  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05691  histidine kinase  28.61 
 
 		 538 aa  111  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3948  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.51 
 
 		 658 aa  111  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0925  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.94 
 
 		 543 aa  111  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5811  putative chemotaxis transducer  30.82 
 
 		 647 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3551  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.46 
 
 		 620 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183884 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.28 
 
 		 588 aa  110  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.031352  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0495  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.14 
 
 		 661 aa  110  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0691  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.46 
 
 		 620 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0106  methyl-accepting chemotaxis protein  27.52 
 
 		 546 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.827543  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.72 
 
 		 688 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  30.09 
 
 		 647 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1043  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.32 
 
 		 673 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.530938  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.32 
 
 		 673 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1539  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  28.7 
 
 		 626 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206608  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1076  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.32 
 
 		 673 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.450868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0974  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.32 
 
 		 673 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.82 
 
 		 660 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  30.65 
 
 		 553 aa  110  9.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  27.42 
 
 		 660 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.1 
 
 		 647 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0828859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3842  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.37 
 
 		 537 aa  110  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000516027 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5159  methyl-accepting chemotaxis protein  30.74 
 
 		 638 aa  110  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.33 
 
 		 630 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1257  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.8 
 
 		 688 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.124474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0962  methyl-accepting chemotaxis protein  32.42 
 
 		 643 aa  109  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000917898  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.46 
 
 		 552 aa  110  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0444  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.88 
 
 		 647 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.77 
 
 		 773 aa  109  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001261  methyl-accepting chemotaxis protein  31.88 
 
 		 547 aa  109  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3725  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.75 
 
 		 620 aa  109  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403145  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3056  methyl-accepting chemotaxis protein  27.1 
 
 		 650 aa  109  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0488  methyl-accepting chemotaxis protein  27.59 
 
 		 660 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  27.1 
 
 		 650 aa  109  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.279097  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.18 
 
 		 499 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0811848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1423  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.74 
 
 		 584 aa  109  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4032  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.61 
 
 		 533 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.21 
 
 		 639 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>