120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2227 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2227  fimbrial protein, putative  100 
 
 		 370 aa  758    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0719141  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2036  fimbrial protein  66.58 
 
 		 371 aa  518  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1888  fimbrial protein  41.98 
 
 		 364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0436738  hitchhiker  0.00532877 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1498  fimbrial protein  42.09 
 
 		 359 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1454  fimbrial protein  36.81 
 
 		 360 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118343 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3836  fimbrial protein-like protein  34.9 
 
 		 362 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.38252  normal  0.631566 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  30.38 
 
 		 187 aa  68.9  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  32.91 
 
 		 176 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  31.68 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1052  fimbrial protein  30.82 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0195347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3248  fimbrial protein  25.84 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.0628332 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4253  fimbrial protein  29.76 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413623  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  31.06 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3262  putative fimbrial protein  25.84 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.792509  normal  0.342422 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3185  probable fimbrial protein  27.84 
 
 		 196 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  31.94 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2875  fimbrial protein  31.01 
 
 		 355 aa  57  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  30.43 
 
 		 185 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  31.41 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  31.41 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  31.41 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  31.41 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  31.41 
 
 		 176 aa  57  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  31.68 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3364  fimbrial protein  25.36 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  30.89 
 
 		 176 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0564  Fimbrial protein  32.7 
 
 		 345 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.648396 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  31.68 
 
 		 185 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5116  fimbrial protein  26.58 
 
 		 339 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0391315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  30.43 
 
 		 176 aa  55.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  28.93 
 
 		 175 aa  53.9  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6274  type-1 fimbrial protein subunit A  28.7 
 
 		 306 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4460  putative type 1 fimbrial protein  27.11 
 
 		 194 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3624  fimbrial protein  27.11 
 
 		 194 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  30.23 
 
 		 180 aa  52.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03009  predicted fimbrial-like adhesin protein  27.11 
 
 		 194 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3334  putative type 1 fimbrial protein  27.11 
 
 		 194 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.370999  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0556  fimbrial protein  27.11 
 
 		 194 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.710135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02960  hypothetical protein  27.11 
 
 		 194 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  30.25 
 
 		 182 aa  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  26.58 
 
 		 168 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  26.58 
 
 		 171 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  26.58 
 
 		 171 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  26.58 
 
 		 171 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  30 
 
 		 177 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  26.58 
 
 		 168 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0563  Fimbrial protein  27.11 
 
 		 194 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  28.39 
 
 		 176 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  28.39 
 
 		 176 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  28.39 
 
 		 176 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  28.8 
 
 		 183 aa  50.8  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3079  Fimbrial protein  26.86 
 
 		 171 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  26 
 
 		 200 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  29.01 
 
 		 172 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4950  putative fimbrial subunit  27.41 
 
 		 185 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  29.01 
 
 		 172 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5002  putative fimbrial subunit  27.41 
 
 		 185 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.698647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5005  putative fimbrial subunit  27.41 
 
 		 185 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.238032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  29.01 
 
 		 172 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  29.01 
 
 		 172 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  29.63 
 
 		 172 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4843  putative fimbrial protein  27.41 
 
 		 185 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0729132  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  27.84 
 
 		 171 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  27.84 
 
 		 171 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  27.84 
 
 		 171 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  27.84 
 
 		 171 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  29.87 
 
 		 176 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0765  Fimbrial protein  25.84 
 
 		 209 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.146412  normal  0.0127423 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3199  fimbrial protein  22.94 
 
 		 195 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.57 
 
 		 176 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  28.57 
 
 		 176 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  28.57 
 
 		 176 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  28.57 
 
 		 176 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4147  fimbrial protein  26.09 
 
 		 180 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  28.57 
 
 		 176 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4916  putative fimbrial subunit  27.41 
 
 		 185 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  28.48 
 
 		 190 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0836  Fimbrial protein  26.13 
 
 		 298 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.252785 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  28.48 
 
 		 190 aa  47.4  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2969  putative fimbrial protein  25.44 
 
 		 338 aa  47  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0050  fimbrial protein  28.95 
 
 		 354 aa  47  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6926  Fimbrial protein  23.91 
 
 		 340 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.289443  normal  0.816903 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  29.01 
 
 		 176 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  29.01 
 
 		 176 aa  47  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  28.83 
 
 		 183 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3929  Fimbrial protein  29.8 
 
 		 222 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.19818 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3816  Fimbrial protein  29.8 
 
 		 222 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351886 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1105  fimbrial protein  24.84 
 
 		 150 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000686387  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00946  predicted fimbrial-like adhesin protein  24.84 
 
 		 180 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.118713  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2701  Fimbrial protein  24.84 
 
 		 180 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000889642  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00953  hypothetical protein  24.84 
 
 		 180 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116375  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1051  fimbrial protein  24.84 
 
 		 180 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00269088  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1057  fimbrial protein  24.84 
 
 		 180 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000439054  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2654  fimbrial protein  24.84 
 
 		 180 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00417117  hitchhiker  0.00341593 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2375  fimbrial protein  24.84 
 
 		 180 aa  46.2  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000301553  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  29.01 
 
 		 176 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2177  fimbrial protein  24.22 
 
 		 150 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000769116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0060  fimbrial adhesin precursor  26.9 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.485498  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  26.92 
 
 		 174 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00679  predicted fimbrial-like adhesin protein  24.38 
 
 		 188 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>