135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_02960 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03009  predicted fimbrial-like adhesin protein  100 
 
 
194 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02960  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3334  putative type 1 fimbrial protein  100 
 
 
194 aa  395  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.370999  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0556  fimbrial protein  100 
 
 
194 aa  395  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.710135  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4460  putative type 1 fimbrial protein  96.91 
 
 
194 aa  383  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3624  fimbrial protein  96.91 
 
 
194 aa  384  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0563  Fimbrial protein  95.36 
 
 
194 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  33.52 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  32.99 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  32.99 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  32.99 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  31.61 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  31.61 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  31.09 
 
 
190 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  34.02 
 
 
210 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  33.51 
 
 
170 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  33.51 
 
 
170 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  33.51 
 
 
170 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  32.76 
 
 
170 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  32.76 
 
 
170 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  30.39 
 
 
200 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  32.57 
 
 
174 aa  61.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0809  fimbrial protein  28.29 
 
 
188 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.362705  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  32.57 
 
 
174 aa  61.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  32.57 
 
 
174 aa  61.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  28 
 
 
179 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  28 
 
 
179 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  28 
 
 
179 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  28 
 
 
179 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  28.87 
 
 
185 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  31.91 
 
 
176 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  28.24 
 
 
185 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  28.87 
 
 
185 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  33.51 
 
 
174 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4846  putative fimbrial chaparone  27.84 
 
 
181 aa  58.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.417477  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5008  putative fimbrial chaperone  27.84 
 
 
181 aa  57.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2448  fimbrial protein  30.2 
 
 
191 aa  58.2  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  28.81 
 
 
165 aa  57.8  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  32 
 
 
174 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4953  putative fimbrial chaperone  27.84 
 
 
181 aa  57.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5005  putative fimbrial chaperone  27.84 
 
 
181 aa  57.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  29.44 
 
 
175 aa  56.6  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  28.74 
 
 
187 aa  55.8  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  28.25 
 
 
165 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4919  putative fimbrial chaparone  27.32 
 
 
181 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.663343  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  30 
 
 
185 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  30 
 
 
185 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  31.49 
 
 
174 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0172041 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2917  Fimbrial protein  29.27 
 
 
188 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0948919  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  28.25 
 
 
165 aa  54.3  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  30.77 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00679  predicted fimbrial-like adhesin protein  26.5 
 
 
188 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  27.87 
 
 
172 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0767  putative type 1 fimbrial protein  26.5 
 
 
188 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0745  putative type 1 fimbrial protein  26.5 
 
 
188 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2936  fimbrial protein  26.5 
 
 
188 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.545876  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  27.87 
 
 
172 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  27.87 
 
 
172 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  27.87 
 
 
172 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2227  fimbrial protein, putative  27.11 
 
 
370 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0719141  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0992  putative fimbrial protein  28.93 
 
 
174 aa  52  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000260678 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  27.87 
 
 
172 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2036  fimbrial protein  27.03 
 
 
371 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.229432 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00480  predicted fimbrial-like adhesin protein  43.33 
 
 
180 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3083  Fimbrial protein  43.33 
 
 
180 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0205144  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0604  type-1 fimbrial protein  43.33 
 
 
180 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000140279  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00485  hypothetical protein  43.33 
 
 
180 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0571  type-1 fimbrial protein  43.33 
 
 
180 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004539  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0631  type-1 fimbrial protein homolog  43.33 
 
 
180 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168996  normal  0.298976 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3092  fimbrial protein  43.33 
 
 
180 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124321  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0575  type-1 fimbrial protein  43.33 
 
 
180 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0562802  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1498  fimbrial protein  29.03 
 
 
359 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1454  fimbrial protein  26.47 
 
 
360 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.118343 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6274  type-1 fimbrial protein subunit A  29.09 
 
 
306 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0589  fimbrial protein internal segment  23.12 
 
 
164 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0147243 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0590  fimbrial protein internal segment  23.12 
 
 
164 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0238251  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  27.03 
 
 
193 aa  48.9  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  26.82 
 
 
180 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0597  fimbrial protein internal segment  22.54 
 
 
164 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0916045 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0654  fimbrial protein internal segment  22.54 
 
 
164 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.781355  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02915  predicted fimbrial-like adhesin protein  27.63 
 
 
183 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0657  Fimbrial protein  27.63 
 
 
183 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3221  putative fimbrial protein  27.63 
 
 
183 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501305  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3508  putative fimbrial protein  27.63 
 
 
183 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000529621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0654  putative fimbrial protein  27.63 
 
 
183 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.608236 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  33.8 
 
 
184 aa  48.1  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02865  hypothetical protein  27.63 
 
 
183 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  33.8 
 
 
184 aa  47.8  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  27.81 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  27.81 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  27.81 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0050  fimbrial protein  23.31 
 
 
354 aa  46.2  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  26.47 
 
 
187 aa  45.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0060  fimbrial adhesin precursor  23.93 
 
 
354 aa  45.4  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.485498  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1891  type 1 pili subunit FimI  27.14 
 
 
179 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000387649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3836  fimbrial protein-like protein  29.93 
 
 
362 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.38252  normal  0.631566 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69760  putative fimbrial protein  27.95 
 
 
304 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0511825  normal  0.411103 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3185  probable fimbrial protein  25.38 
 
 
196 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4675  fimbrial protein  25.37 
 
 
204 aa  44.7  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2634  fimbrial protein  36.14 
 
 
187 aa  43.9  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>