251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5164 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  100 
 
 
200 aa  409  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  55.22 
 
 
190 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  55.22 
 
 
190 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  55.22 
 
 
190 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  32.23 
 
 
185 aa  95.1  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  36.11 
 
 
176 aa  95.1  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  35.75 
 
 
174 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  31.1 
 
 
187 aa  89  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  30.81 
 
 
185 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  32.83 
 
 
183 aa  88.2  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  32.02 
 
 
185 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  30.81 
 
 
185 aa  85.1  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  30.81 
 
 
185 aa  85.1  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  31.53 
 
 
181 aa  80.5  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  34.69 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  29 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  32.61 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  32.09 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  28.5 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  28.5 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  28.5 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  28.5 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  29.21 
 
 
187 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  28.8 
 
 
174 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  29.21 
 
 
187 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  30.21 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  28.8 
 
 
174 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  28.8 
 
 
174 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  28.8 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  31.66 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  31.66 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  31.66 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0593  putative fimbrial protein  31.4 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.394086  normal  0.0160572 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  31.25 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  31.25 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  31.25 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0658  putative fimbrial protein  30.81 
 
 
172 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0601  putative fimbrial protein  30.81 
 
 
172 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176424  normal  0.0654863 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0597  putative fimbrial protein  30.81 
 
 
172 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.167394 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0594  putative fimbrial protein  30.81 
 
 
172 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00480  predicted fimbrial-like adhesin protein  31.25 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0631  type-1 fimbrial protein homolog  31.25 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168996  normal  0.298976 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3083  Fimbrial protein  31.25 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0205144  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0575  type-1 fimbrial protein  31.25 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0562802  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3092  fimbrial protein  31.25 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124321  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00485  hypothetical protein  31.25 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0604  type-1 fimbrial protein  31.25 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000140279  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0571  type-1 fimbrial protein  31.25 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004539  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  29.06 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  28.86 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  28.86 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  28.86 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  28.86 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  31.44 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3624  fimbrial protein  30.88 
 
 
194 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  29.61 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0576  fimbrial protein  32.8 
 
 
182 aa  63.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911674  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  27.72 
 
 
176 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  28.57 
 
 
176 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  28.57 
 
 
176 aa  63.5  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  28.57 
 
 
176 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0597  fimbrial protein internal segment  24.58 
 
 
164 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0916045 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0654  fimbrial protein internal segment  24.58 
 
 
164 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.781355  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0590  fimbrial protein internal segment  24.02 
 
 
164 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0238251  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  30.85 
 
 
170 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  30.85 
 
 
170 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0589  fimbrial protein internal segment  24.02 
 
 
164 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0147243 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  29.07 
 
 
171 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3079  Fimbrial protein  29.07 
 
 
171 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  29.07 
 
 
171 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0992  putative fimbrial protein  28.22 
 
 
174 aa  62.4  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000260678 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  29.38 
 
 
187 aa  62.4  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  29.07 
 
 
171 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  29.07 
 
 
171 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  27.23 
 
 
176 aa  62  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  27.23 
 
 
176 aa  62  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  27.23 
 
 
176 aa  62  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  27.23 
 
 
176 aa  62  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  28.88 
 
 
174 aa  62  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1363  frimbrial protein  26.73 
 
 
181 aa  61.6  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.463446  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  29.26 
 
 
210 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0556  fimbrial protein  30.39 
 
 
194 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.710135  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03009  predicted fimbrial-like adhesin protein  30.39 
 
 
194 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02960  hypothetical protein  30.39 
 
 
194 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  29.56 
 
 
170 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  29.56 
 
 
170 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  29.56 
 
 
170 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3334  putative type 1 fimbrial protein  30.39 
 
 
194 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.370999  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4148  fimbrial protein  32.68 
 
 
179 aa  60.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4250  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  29.83 
 
 
175 aa  60.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.151797 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4460  putative type 1 fimbrial protein  29.95 
 
 
194 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0563  Fimbrial protein  29.41 
 
 
194 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1475  fimbrial protein  26.24 
 
 
181 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  27.68 
 
 
176 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2695  frimbrial protein  26.24 
 
 
181 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0590722  decreased coverage  0.003545 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1051  fimbrial protein  27.43 
 
 
174 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0357059 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  27.46 
 
 
175 aa  59.7  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  29.21 
 
 
182 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2660  fimbrial protein  27.75 
 
 
180 aa  58.5  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  hitchhiker  0.00614159 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1675  fimbrial protein  27.75 
 
 
180 aa  58.2  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0767215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>