151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C5005 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C5005  putative fimbrial chaperone  100 
 
 		 181 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5008  putative fimbrial chaperone  100 
 
 		 181 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4846  putative fimbrial chaparone  99.45 
 
 		 181 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.417477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4953  putative fimbrial chaperone  100 
 
 		 181 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4919  putative fimbrial chaparone  98.34 
 
 		 181 aa  360  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.663343  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  30.43 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  30.43 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  30.34 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  30.34 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  30.34 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  30.34 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  30.34 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  29.89 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  29.89 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  29.89 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  29.83 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  29.89 
 
 		 176 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  29.89 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  29.35 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  29.78 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  29.28 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  32.34 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37060  fimbrial subunit CupA1  30.98 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  31.67 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  31.67 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  31.67 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03009  predicted fimbrial-like adhesin protein  27.84 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02960  hypothetical protein  27.84 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3334  putative type 1 fimbrial protein  27.84 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.370999  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0556  fimbrial protein  27.84 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.710135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  27.04 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  27.04 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  27.04 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  27.04 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  27.04 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2448  fimbrial protein  31.58 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  37.04 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  27.57 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  27.75 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3624  fimbrial protein  27.32 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3023  fimbrial subunit CupA1  31.94 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.143377  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  37.04 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  35.34 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  37.04 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0809  fimbrial protein  25.39 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.362705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  30.57 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4460  putative type 1 fimbrial protein  26.56 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  30.57 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0563  Fimbrial protein  30.88 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  24.86 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  24.86 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  24.86 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  24.86 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  25.67 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  25.67 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  30 
 
 		 210 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  25.67 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  25.67 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  30 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  30 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  30 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  29.38 
 
 		 187 aa  52  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1153  putative fimbrial protein  28.49 
 
 		 186 aa  52  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  36.11 
 
 		 185 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  24.31 
 
 		 172 aa  51.6  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0561  Fimbrial protein  31.1 
 
 		 179 aa  51.2  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  26.92 
 
 		 165 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  31.15 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59710  putative fimbrial protein precursor  30.54 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.45565e-17  hitchhiker  1.06825e-18 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  26.24 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0826  Fimbrial protein  29.95 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  26.28 
 
 		 165 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1277  fimbrial protein  28.82 
 
 		 186 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.244383 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4846  protein fimG  34.58 
 
 		 167 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0840  fimbrial protein  34.36 
 
 		 182 aa  48.5  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4916  putative fimbrial subunit  30 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  27.23 
 
 		 187 aa  48.1  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2833  fimbrial protein  38.75 
 
 		 202 aa  47.8  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0992  putative fimbrial protein  21.55 
 
 		 174 aa  47.8  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000260678 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  28.12 
 
 		 184 aa  47.8  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4843  putative fimbrial protein  29.41 
 
 		 185 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0729132  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  31.31 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5005  putative fimbrial subunit  29.41 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.238032  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  31.31 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1891  type 1 pili subunit FimI  25.26 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1675  fimbrial protein  29.65 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0767215  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5002  putative fimbrial subunit  29.41 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.698647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0145  fimbrial protein  28.06 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.751304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  27.75 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  31.31 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2660  fimbrial protein  29.65 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  hitchhiker  0.00614159 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1786  fimbrial protein  29.65 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  25.64 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4950  putative fimbrial subunit  29.41 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02915  predicted fimbrial-like adhesin protein  25.68 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0657  Fimbrial protein  25.68 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2237  fimbrial protein  30.99 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0169653 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3221  putative fimbrial protein  25.68 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501305  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3508  putative fimbrial protein  25.68 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000529621  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02865  hypothetical protein  25.68 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>