89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4846 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4846  protein fimG  100 
 
 		 167 aa  338  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5825  protein fimG  97.01 
 
 		 167 aa  311  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04150  hypothetical protein  95.81 
 
 		 167 aa  307  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04188  minor component of type 1 fimbriae  95.81 
 
 		 167 aa  307  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4545  protein fimG  95.81 
 
 		 167 aa  307  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3678  Fimbrial protein  95.81 
 
 		 167 aa  307  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.343861  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4916  protein fimG  95.21 
 
 		 167 aa  306  8e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1692  protein fimG-like protein  56.63 
 
 		 167 aa  201  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2154  fimbrial protein  56.63 
 
 		 167 aa  201  5e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.744663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01473  hypothetical protein  56.63 
 
 		 167 aa  201  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2143  Fimbrial protein  56.63 
 
 		 167 aa  201  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00578813  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01461  predicted fimbrial-like adhesin protein  56.63 
 
 		 167 aa  201  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1587  protein fimG-like protein  56.02 
 
 		 167 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1669  protein FimG-like protein  57.23 
 
 		 215 aa  190  8e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2116  protein fimG homolog  56.84 
 
 		 96 aa  118  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1068  fimbrial protein  36.97 
 
 		 183 aa  98.6  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.12012 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1269  S-fimbrial adhesin protein SfaS  33.33 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.207899  normal  0.111309 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2877  fimbrial protein  33.78 
 
 		 171 aa  80.5  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1268  fimbrial protein  32.93 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0400591  normal  0.0675958 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2876  fimbrial protein  32.43 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4843  putative fimbrial protein  29.61 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0729132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4916  putative fimbrial subunit  29.61 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5002  putative fimbrial subunit  29.61 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.698647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4950  putative fimbrial subunit  29.61 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5005  putative fimbrial subunit  29.61 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.238032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  27.95 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  27.95 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  27.95 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  27.95 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  27.33 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00949  hypothetical protein  31.37 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.654237  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2658  fimbrial protein  31.37 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.959086  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00942  predicted fimbrial-like adhesin protein  31.37 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.608111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2705  Fimbrial protein  31.37 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0296528  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2181  putative fimbrial protein  30.07 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614971 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  28.89 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  28.89 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  28.89 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  28.89 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  34.85 
 
 		 184 aa  48.9  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  31.69 
 
 		 184 aa  48.9  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1363  frimbrial protein  31.85 
 
 		 181 aa  48.5  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.463446  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1100  fimbrial protein  30.72 
 
 		 179 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.159551  normal  0.51089 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5008  putative fimbrial chaperone  34.58 
 
 		 181 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4953  putative fimbrial chaperone  34.58 
 
 		 181 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4846  putative fimbrial chaparone  34.58 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.417477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5005  putative fimbrial chaperone  34.58 
 
 		 181 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4919  putative fimbrial chaparone  34.58 
 
 		 181 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.663343  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1053  fimbrial protein  32.04 
 
 		 180 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.165848  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2380  fimbrial protein  32.04 
 
 		 180 aa  47.8  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1475  fimbrial protein  31.62 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2695  frimbrial protein  31.62 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0590722  decreased coverage  0.003545 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  25.42 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  25.42 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  25.42 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  25.42 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  25.42 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  35.87 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  29.82 
 
 		 177 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3079  Fimbrial protein  28.77 
 
 		 171 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  26.55 
 
 		 175 aa  45.1  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  28.77 
 
 		 171 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.77 
 
 		 171 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  28.77 
 
 		 171 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  28.77 
 
 		 171 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1343  Fimbrial protein  25 
 
 		 315 aa  44.3  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.259111  normal  0.0328086 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  24.87 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  31.51 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  35.87 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  35.87 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  35.87 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  35.87 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  31.51 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  35.87 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  35.87 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  31.51 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  31.51 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1149  putative fimbrial protein  29.77 
 
 		 183 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  31.51 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  35.87 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0561  Fimbrial protein  35.11 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  29.93 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  29.63 
 
 		 179 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  29.63 
 
 		 179 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  29.93 
 
 		 165 aa  41.6  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  29.93 
 
 		 165 aa  41.6  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4579  fimbrial protein, putative  31.37 
 
 		 186 aa  41.2  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3199  fimbrial protein  26.71 
 
 		 195 aa  40.8  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  29.57 
 
 		 183 aa  40.8  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>