48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1669 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1669  protein FimG-like protein  100 
 
 		 215 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.668207 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01461  predicted fimbrial-like adhesin protein  98.74 
 
 		 167 aa  319  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01473  hypothetical protein  98.74 
 
 		 167 aa  319  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2143  Fimbrial protein  98.74 
 
 		 167 aa  319  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00578813  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2154  fimbrial protein  98.74 
 
 		 167 aa  319  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.744663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1692  protein fimG-like protein  98.74 
 
 		 167 aa  319  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1587  protein fimG-like protein  98.11 
 
 		 167 aa  318  5e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4846  protein fimG  57.23 
 
 		 167 aa  190  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4916  protein fimG  57.86 
 
 		 167 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04150  hypothetical protein  57.86 
 
 		 167 aa  181  6e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4545  protein fimG  57.86 
 
 		 167 aa  181  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04188  minor component of type 1 fimbriae  57.86 
 
 		 167 aa  181  6e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3678  Fimbrial protein  57.86 
 
 		 167 aa  181  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.343861  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5825  protein fimG  58.49 
 
 		 167 aa  180  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2116  protein fimG homolog  97.73 
 
 		 96 aa  175  6e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1206  putative prophage side tail fiber protein  100 
 
 		 845 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.116414 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0400  hypothetical protein  92.19 
 
 		 285 aa  132  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1068  fimbrial protein  32.34 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.12012 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1269  S-fimbrial adhesin protein SfaS  34.9 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.207899  normal  0.111309 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2877  fimbrial protein  31.06 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2876  fimbrial protein  28.57 
 
 		 171 aa  62  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1268  fimbrial protein  29.25 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0400591  normal  0.0675958 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  27.97 
 
 		 177 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1819  fimbrial protein-like protein  28.18 
 
 		 173 aa  45.8  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380476 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  28.08 
 
 		 180 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4250  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  33.06 
 
 		 175 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151797 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  30.63 
 
 		 174 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0601  putative fimbrial protein  26.92 
 
 		 172 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176424  normal  0.0654863 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0171  fimbrial protein  30.23 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0658  putative fimbrial protein  26.92 
 
 		 172 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0594  putative fimbrial protein  26.92 
 
 		 172 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0597  putative fimbrial protein  26.92 
 
 		 172 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167394 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4042  fimbrial protein  30.23 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.382298  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0503  fimbrial protein  30.23 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000550274  hitchhiker  0.00137019 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1051  fimbrial protein  28.06 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0357059 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  28.12 
 
 		 171 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.12 
 
 		 171 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  28.12 
 
 		 171 aa  43.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  28.12 
 
 		 171 aa  43.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2237  fimbrial protein  29.32 
 
 		 182 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0169653 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  30.16 
 
 		 182 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  29.69 
 
 		 184 aa  42.7  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2181  putative fimbrial protein  25.67 
 
 		 179 aa  42.7  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614971 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0992  putative fimbrial protein  22.95 
 
 		 174 aa  42.7  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000260678 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  29.79 
 
 		 179 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  29.79 
 
 		 179 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  24.5 
 
 		 172 aa  41.6  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3079  Fimbrial protein  27.34 
 
 		 171 aa  41.6  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>