207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6636 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  100 
 
 		 182 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0576  fimbrial protein  42.94 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911674  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4022  fimbrial protein  44.03 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0840  fimbrial protein  44.94 
 
 		 182 aa  104  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1675  fimbrial protein  41.28 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0767215  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1786  fimbrial protein  41.28 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  40.61 
 
 		 184 aa  98.6  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2660  fimbrial protein  40.7 
 
 		 180 aa  99  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  hitchhiker  0.00614159 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1153  putative fimbrial protein  38.64 
 
 		 186 aa  95.9  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  39.39 
 
 		 184 aa  93.6  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1598  frimbrial protein  38.5 
 
 		 181 aa  92  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4961  fimbrial protein  38.12 
 
 		 184 aa  92  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180304  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0150  fimbrial protein  38.5 
 
 		 181 aa  92  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4250  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  41.91 
 
 		 175 aa  91.3  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151797 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3034  fimbrial protein  37.57 
 
 		 180 aa  90.9  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0126  fimbrial protein  39.1 
 
 		 169 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1819  fimbrial protein-like protein  37.84 
 
 		 173 aa  89  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380476 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2237  fimbrial protein  45.4 
 
 		 182 aa  87.8  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0169653 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6929  Fimbrial protein  37.35 
 
 		 185 aa  85.5  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6667  fimbrial protein  37.04 
 
 		 207 aa  85.5  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279989 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4579  fimbrial protein, putative  37.28 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1694  fimbrial protein  44.06 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857438  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3031  fimbrial protein  35.76 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5933  fimbrial protein  33.83 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2972  putative fimbrial subunit  33.16 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1363  frimbrial protein  36.26 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.463446  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1014  type I pilus biogensis protein FimA  33.51 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6670  fimbrial protein  34.23 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.12656 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0561  Fimbrial protein  36.47 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2695  frimbrial protein  35.91 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0590722  decreased coverage  0.003545 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1475  fimbrial protein  35.91 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1602  major fimbrial subunit protein  36.24 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.543363  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0153  major fimbrial subunit protein  36.24 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0129  major fimbrial subunit protein  36.24 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11060  putative fimbrial subunit CupB1  31.76 
 
 		 189 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.34054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0118  major fimbrial subunit protein  35.1 
 
 		 181 aa  72  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1532  fimbrial protein  30.57 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.690066 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  31.93 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  31.93 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  31.93 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  31.93 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0115  frimbrial protein  34.59 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  31.33 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  32.45 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2181  putative fimbrial protein  29.61 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614971 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  33.14 
 
 		 174 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  33.14 
 
 		 174 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  33.14 
 
 		 174 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  30.97 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  33.14 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4408  fimbrial subunit CupC1  32.69 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  30.77 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  30.77 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  30.77 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1277  fimbrial protein  33.95 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.244383 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  30.77 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00942  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.42 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.608111  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2658  fimbrial protein  28.42 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.959086  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2705  Fimbrial protein  28.42 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0296528  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00949  hypothetical protein  28.42 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.654237  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  30.32 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1100  fimbrial protein  28.42 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.159551  normal  0.51089 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  29.68 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00947  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.98 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0285836  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  30.82 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00954  hypothetical protein  28.98 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2700  Fimbrial protein  28.41 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59710  putative fimbrial protein precursor  36.72 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.45565e-17  hitchhiker  1.06825e-18 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2380  fimbrial protein  31.89 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1053  fimbrial protein  31.89 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.165848  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1149  putative fimbrial protein  32.85 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2653  fimbrial protein  28.41 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000480938  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1052  fimbrial protein  28.41 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000263503  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  31.89 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  28.73 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1106  fimbrial protein  30.97 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000811079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0371  fimbrial protein  30.98 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.136666 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1058  fimbrial protein  30.97 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818586  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0373  fimbrial protein  30.98 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2176  fimbrial protein  30.97 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  29.94 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4153  fimbrial protein  31.47 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0433  fimbrial protein  30.98 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.428443  hitchhiker  0.0000242972 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4958  fimbrial protein major type 1 subunit  30.98 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0414161 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4851  fimbrial protein major subunit  30.98 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.523252  normal  0.0116968 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0171  fimbrial protein  34.21 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0503  fimbrial protein  34.21 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000550274  hitchhiker  0.00137019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4042  fimbrial protein  34.21 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.382298  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  29.3 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  31.29 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  29.3 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  31.29 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2374  fimbrial protein  30.97 
 
 		 171 aa  54.3  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000854924  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  28.42 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  29.3 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  29.3 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  27.81 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  29.3 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  25.51 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  29.3 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>