24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4153 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4153  fimbrial protein  100 
 
 		 194 aa  380  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4961  fimbrial protein  29.72 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180304  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  31.47 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4250  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  31.34 
 
 		 175 aa  52.4  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151797 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1153  putative fimbrial protein  28.28 
 
 		 186 aa  52  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6929  Fimbrial protein  31.43 
 
 		 185 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2972  putative fimbrial subunit  31.82 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  29.13 
 
 		 184 aa  49.3  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0576  fimbrial protein  31.46 
 
 		 182 aa  48.1  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911674  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4022  fimbrial protein  26.47 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1277  fimbrial protein  26.47 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.244383 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3199  fimbrial protein  28.84 
 
 		 195 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2237  fimbrial protein  28.47 
 
 		 182 aa  45.1  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0169653 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  29.76 
 
 		 187 aa  44.7  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0840  fimbrial protein  41.79 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1694  fimbrial protein  31.82 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857438  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4042  fimbrial protein  29.1 
 
 		 176 aa  42.4  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.382298  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0503  fimbrial protein  29.1 
 
 		 176 aa  42.4  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000550274  hitchhiker  0.00137019 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0171  fimbrial protein  29.1 
 
 		 176 aa  42.4  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2660  fimbrial protein  30.96 
 
 		 180 aa  42  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  hitchhiker  0.00614159 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  27.18 
 
 		 184 aa  42  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3976  pilin chaperone ecpD2  36.07 
 
 		 208 aa  41.6  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1786  fimbrial protein  30.96 
 
 		 180 aa  41.6  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1675  fimbrial protein  30.96 
 
 		 180 aa  41.6  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0767215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>