98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4961 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4961  fimbrial protein  100 
 
 		 184 aa  361  3e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180304  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1694  fimbrial protein  53.29 
 
 		 209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857438  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4250  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  48.13 
 
 		 175 aa  124  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151797 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0840  fimbrial protein  50.31 
 
 		 182 aa  120  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  45.5 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  47.19 
 
 		 184 aa  114  6e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2660  fimbrial protein  41.18 
 
 		 180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  hitchhiker  0.00614159 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1675  fimbrial protein  41.18 
 
 		 180 aa  108  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0767215  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1786  fimbrial protein  41.18 
 
 		 180 aa  108  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1819  fimbrial protein-like protein  45.16 
 
 		 173 aa  104  7e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380476 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4579  fimbrial protein, putative  42.29 
 
 		 186 aa  102  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4022  fimbrial protein  41.57 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0561  Fimbrial protein  43.64 
 
 		 179 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0576  fimbrial protein  41.46 
 
 		 182 aa  95.1  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911674  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  38.12 
 
 		 182 aa  92  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6929  Fimbrial protein  35.94 
 
 		 185 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1153  putative fimbrial protein  38.89 
 
 		 186 aa  84.3  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2237  fimbrial protein  40.96 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0169653 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2972  putative fimbrial subunit  39.88 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1363  frimbrial protein  37.06 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.463446  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1475  fimbrial protein  37.06 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2695  frimbrial protein  37.06 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0590722  decreased coverage  0.003545 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0118  major fimbrial subunit protein  37.2 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0129  major fimbrial subunit protein  35.33 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0153  major fimbrial subunit protein  35.33 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1602  major fimbrial subunit protein  35.33 
 
 		 187 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.543363  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0503  fimbrial protein  32.2 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000550274  hitchhiker  0.00137019 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0171  fimbrial protein  32.2 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4042  fimbrial protein  32.2 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.382298  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0373  fimbrial protein  40.12 
 
 		 178 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4958  fimbrial protein major type 1 subunit  40.12 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0414161 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0433  fimbrial protein  40.12 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.428443  hitchhiker  0.0000242972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4851  fimbrial protein major subunit  40.12 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.523252  normal  0.0116968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0371  fimbrial protein  40.12 
 
 		 178 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.136666 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1667  fimbrial protein  36.96 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.384622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6670  fimbrial protein  34.36 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.12656 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0150  fimbrial protein  33.09 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1598  frimbrial protein  33.09 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1149  putative fimbrial protein  34.03 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5933  fimbrial protein  28.36 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  30 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  30 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  30 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3034  fimbrial protein  30.05 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3031  fimbrial protein  32.52 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2272  fimbrial protein  33.51 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2163  fimbrial protein  33.51 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4153  fimbrial protein  29.72 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2110  fimbrial protein  33.51 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  34.54 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2833  fimbrial protein  33.68 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37060  fimbrial subunit CupA1  33.88 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0126  fimbrial protein  33.62 
 
 		 169 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3295  fimbrial protein  33.54 
 
 		 336 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0139531 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1277  fimbrial protein  32.39 
 
 		 186 aa  52  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.244383 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6667  fimbrial protein  30 
 
 		 207 aa  51.6  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279989 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  32.37 
 
 		 193 aa  51.2  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3023  fimbrial subunit CupA1  34.72 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.143377  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3199  fimbrial protein  30.92 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1532  fimbrial protein  28.14 
 
 		 194 aa  48.1  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.690066 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3248  fimbrial protein  28.43 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.0628332 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0293  fimbrial protein  27.75 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  27.96 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  28.8 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  29.69 
 
 		 181 aa  45.4  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1478  fimbrial protein  30.97 
 
 		 202 aa  45.1  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1366  fimbrial protein  30.97 
 
 		 202 aa  45.1  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326274  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  30.98 
 
 		 170 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  30.98 
 
 		 170 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  30.98 
 
 		 170 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  32.07 
 
 		 170 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  32.07 
 
 		 170 aa  44.7  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  32.07 
 
 		 210 aa  44.7  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  32.07 
 
 		 170 aa  44.7  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  25.13 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59710  putative fimbrial protein precursor  31.61 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.45565e-17  hitchhiker  1.06825e-18 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3364  fimbrial protein  28.5 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  26.98 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  26.22 
 
 		 182 aa  42.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3262  putative fimbrial protein  28.5 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.792509  normal  0.342422 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  28.05 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2870  fimbrial protein  35.71 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  29.7 
 
 		 172 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  26.23 
 
 		 200 aa  42  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0809  fimbrial protein  25.39 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.362705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  29.7 
 
 		 172 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  28.11 
 
 		 177 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  29.7 
 
 		 172 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  29.7 
 
 		 172 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  26.98 
 
 		 179 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  29.7 
 
 		 172 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  25.13 
 
 		 185 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  27.88 
 
 		 170 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  27.88 
 
 		 170 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2181  putative fimbrial protein  27.75 
 
 		 179 aa  41.6  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1014  type I pilus biogensis protein FimA  27.27 
 
 		 187 aa  41.6  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0115  frimbrial protein  29.09 
 
 		 184 aa  41.6  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1131  fimbrial protein  29.41 
 
 		 194 aa  41.2  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0729525 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>