115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1475 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2695  frimbrial protein  100 
 
 		 181 aa  362  2e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0590722  decreased coverage  0.003545 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1475  fimbrial protein  100 
 
 		 181 aa  362  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1363  frimbrial protein  98.9 
 
 		 181 aa  357  6e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.463446  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3034  fimbrial protein  40 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0115  frimbrial protein  42.68 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6667  fimbrial protein  40.76 
 
 		 207 aa  98.2  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279989 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1598  frimbrial protein  37.1 
 
 		 181 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0150  fimbrial protein  39.49 
 
 		 181 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0126  fimbrial protein  39.49 
 
 		 169 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4961  fimbrial protein  37.06 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180304  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  35.91 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2870  fimbrial protein  38.75 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4250  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  32.04 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151797 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  31.28 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  31.94 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1366  fimbrial protein  36.88 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326274  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1478  fimbrial protein  36.88 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4022  fimbrial protein  36.42 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2660  fimbrial protein  34.59 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  hitchhiker  0.00614159 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1675  fimbrial protein  34.59 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0767215  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1053  fimbrial protein  32.76 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.165848  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1786  fimbrial protein  34.59 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2380  fimbrial protein  32.76 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0576  fimbrial protein  31.68 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911674  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1100  fimbrial protein  33.14 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.159551  normal  0.51089 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00942  predicted fimbrial-like adhesin protein  33.14 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.608111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2705  Fimbrial protein  33.14 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0296528  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1819  fimbrial protein-like protein  33.16 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380476 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2658  fimbrial protein  33.14 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.959086  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00949  hypothetical protein  33.14 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.654237  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6929  Fimbrial protein  32.54 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0561  Fimbrial protein  37.89 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3031  fimbrial protein  35.06 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1602  major fimbrial subunit protein  35.06 
 
 		 187 aa  62  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.543363  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0153  major fimbrial subunit protein  35.06 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0129  major fimbrial subunit protein  35.06 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2237  fimbrial protein  35.58 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0169653 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  26.24 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  27.08 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0840  fimbrial protein  34.57 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2181  putative fimbrial protein  31.55 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614971 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0171  fimbrial protein  32.24 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0503  fimbrial protein  32.24 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000550274  hitchhiker  0.00137019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4042  fimbrial protein  32.24 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.382298  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4579  fimbrial protein, putative  32.75 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  26.56 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  26.56 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  31.52 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5933  fimbrial protein  28.64 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  31.52 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  31.52 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1694  fimbrial protein  38.26 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857438  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1149  putative fimbrial protein  34.18 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6670  fimbrial protein  34.62 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.12656 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  30.43 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0118  major fimbrial subunit protein  32.47 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2972  putative fimbrial subunit  33.16 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  32.23 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  32.23 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  32.23 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  30.58 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  30.58 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  30.58 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  30.58 
 
 		 210 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  30.48 
 
 		 174 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  28.11 
 
 		 176 aa  48.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  28.11 
 
 		 176 aa  48.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  28.11 
 
 		 176 aa  48.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1153  putative fimbrial protein  33.33 
 
 		 186 aa  47.8  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37060  fimbrial subunit CupA1  29.53 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4846  protein fimG  31.62 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0371  fimbrial protein  29.63 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.136666 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  26.47 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  26.47 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4958  fimbrial protein major type 1 subunit  29.63 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0414161 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  26.47 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0433  fimbrial protein  29.63 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.428443  hitchhiker  0.0000242972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4851  fimbrial protein major subunit  29.63 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.523252  normal  0.0116968 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  26.47 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0373  fimbrial protein  29.63 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04188  minor component of type 1 fimbriae  35.96 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3678  Fimbrial protein  35.96 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.343861  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5825  protein fimG  35.96 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4545  protein fimG  35.96 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4916  protein fimG  35.96 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04150  hypothetical protein  35.96 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59710  putative fimbrial protein precursor  31.93 
 
 		 182 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.45565e-17  hitchhiker  1.06825e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  26.04 
 
 		 172 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  26.25 
 
 		 175 aa  45.1  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0209  pilin chaperone ecpD2  28.86 
 
 		 197 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  28.31 
 
 		 185 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  27.33 
 
 		 170 aa  44.7  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  27.33 
 
 		 170 aa  44.7  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  28.75 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  34.25 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4843  putative fimbrial protein  26.67 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0729132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4916  putative fimbrial subunit  26.67 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  26.83 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  26.83 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  28.31 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>