46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1478 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1478  fimbrial protein  100 
 
 		 202 aa  413  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1366  fimbrial protein  100 
 
 		 202 aa  413  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326274  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2870  fimbrial protein  96.53 
 
 		 202 aa  402  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1363  frimbrial protein  36.88 
 
 		 181 aa  72  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.463446  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1475  fimbrial protein  36.88 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2695  frimbrial protein  36.88 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0590722  decreased coverage  0.003545 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3034  fimbrial protein  33.5 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1598  frimbrial protein  31.5 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0150  fimbrial protein  31.5 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0576  fimbrial protein  31.65 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911674  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1153  putative fimbrial protein  28.14 
 
 		 186 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0126  fimbrial protein  32.08 
 
 		 169 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2237  fimbrial protein  40 
 
 		 182 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0169653 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1149  putative fimbrial protein  32.84 
 
 		 183 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  28.22 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4042  fimbrial protein  28.73 
 
 		 176 aa  49.3  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.382298  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0171  fimbrial protein  28.73 
 
 		 176 aa  49.3  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0503  fimbrial protein  28.73 
 
 		 176 aa  49.3  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000550274  hitchhiker  0.00137019 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  26.26 
 
 		 182 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2833  fimbrial protein  34.88 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  28.22 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6650  fimbrial protein  26.49 
 
 		 313 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136296 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2272  fimbrial protein  46.3 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2163  fimbrial protein  46.3 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2110  fimbrial protein  46.3 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2660  fimbrial protein  28.72 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  hitchhiker  0.00614159 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1675  fimbrial protein  28.19 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0767215  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1786  fimbrial protein  28.19 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3031  fimbrial protein  30.14 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  30.98 
 
 		 176 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  30.98 
 
 		 176 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  30.98 
 
 		 176 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4961  fimbrial protein  30.97 
 
 		 184 aa  45.1  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180304  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0371  fimbrial protein  30.43 
 
 		 178 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.136666 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37060  fimbrial subunit CupA1  30.68 
 
 		 183 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4250  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  29.09 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151797 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4958  fimbrial protein major type 1 subunit  30.43 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0414161 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4851  fimbrial protein major subunit  30.43 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.523252  normal  0.0116968 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0373  fimbrial protein  30.43 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6670  fimbrial protein  29.34 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.12656 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4579  fimbrial protein, putative  41.07 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0433  fimbrial protein  30.43 
 
 		 178 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.428443  hitchhiker  0.0000242972 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5933  fimbrial protein  30.71 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0115  frimbrial protein  31.19 
 
 		 184 aa  43.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0118  major fimbrial subunit protein  30.71 
 
 		 181 aa  42.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1277  fimbrial protein  24.07 
 
 		 186 aa  42.7  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.244383 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>