115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5933 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5933  fimbrial protein  100 
 
 		 195 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0576  fimbrial protein  43.65 
 
 		 182 aa  99  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911674  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4022  fimbrial protein  40.8 
 
 		 183 aa  95.1  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1819  fimbrial protein-like protein  36.18 
 
 		 173 aa  84.7  7e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380476 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  33.66 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  33.83 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2237  fimbrial protein  35.71 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0169653 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  34.65 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6929  Fimbrial protein  32.2 
 
 		 185 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0840  fimbrial protein  36 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1694  fimbrial protein  37.01 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857438  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4250  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  33.33 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151797 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  32.11 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  32.11 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  32.11 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1598  frimbrial protein  35.18 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1153  putative fimbrial protein  36 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0150  fimbrial protein  35.18 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0126  fimbrial protein  35.14 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0561  Fimbrial protein  33.91 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2660  fimbrial protein  31.94 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  hitchhiker  0.00614159 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1675  fimbrial protein  31.41 
 
 		 180 aa  67.8  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0767215  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1786  fimbrial protein  31.41 
 
 		 180 aa  67.8  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2972  putative fimbrial subunit  30.21 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4579  fimbrial protein, putative  30.39 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  33.5 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0115  frimbrial protein  29.41 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1014  type I pilus biogensis protein FimA  31.05 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1363  frimbrial protein  27.78 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.463446  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3034  fimbrial protein  30.65 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4961  fimbrial protein  28.36 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180304  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6667  fimbrial protein  31.18 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279989 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2695  frimbrial protein  28.64 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0590722  decreased coverage  0.003545 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1475  fimbrial protein  28.64 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  32.5 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11060  putative fimbrial subunit CupB1  29.29 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.34054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  27 
 
 		 174 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  27 
 
 		 174 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  27 
 
 		 174 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1149  putative fimbrial protein  32.96 
 
 		 183 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2833  fimbrial protein  32.32 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  29.35 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  29.35 
 
 		 170 aa  52  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  29.35 
 
 		 170 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  29.35 
 
 		 170 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  27 
 
 		 174 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  29.31 
 
 		 176 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  29.31 
 
 		 176 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  29.31 
 
 		 176 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  27.14 
 
 		 174 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  29.41 
 
 		 182 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0171  fimbrial protein  30.81 
 
 		 176 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0503  fimbrial protein  30.81 
 
 		 176 aa  47.8  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000550274  hitchhiker  0.00137019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4042  fimbrial protein  30.81 
 
 		 176 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.382298  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0593  putative fimbrial protein  30.32 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.394086  normal  0.0160572 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3031  fimbrial protein  27.27 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  24.17 
 
 		 179 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  24.17 
 
 		 179 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  24.17 
 
 		 179 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2870  fimbrial protein  27.78 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  24.17 
 
 		 179 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  27.23 
 
 		 180 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  27.23 
 
 		 180 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  27.23 
 
 		 180 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  27.23 
 
 		 180 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2163  fimbrial protein  27.12 
 
 		 176 aa  45.4  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2110  fimbrial protein  27.12 
 
 		 176 aa  45.4  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2272  fimbrial protein  27.12 
 
 		 176 aa  45.4  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1053  fimbrial protein  25 
 
 		 180 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.165848  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  27.43 
 
 		 193 aa  45.1  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  28.25 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2380  fimbrial protein  25 
 
 		 180 aa  45.1  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0594  putative fimbrial protein  29.79 
 
 		 172 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  25.87 
 
 		 170 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  25.87 
 
 		 170 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0597  putative fimbrial protein  29.79 
 
 		 172 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167394 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  25.87 
 
 		 170 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0601  putative fimbrial protein  29.79 
 
 		 172 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176424  normal  0.0654863 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0658  putative fimbrial protein  29.79 
 
 		 172 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.25 
 
 		 171 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3079  Fimbrial protein  28.25 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  26.26 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  28.25 
 
 		 171 aa  44.7  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  28.25 
 
 		 171 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  28.25 
 
 		 171 aa  44.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  26.26 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6670  fimbrial protein  28.31 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.12656 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  25.15 
 
 		 172 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3042  fimbrial protein  29.35 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000700395  normal  0.254903 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0371  fimbrial protein  36.59 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.136666 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6650  fimbrial protein  29.48 
 
 		 313 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136296 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  29.78 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0373  fimbrial protein  36.59 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1366  fimbrial protein  30.71 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326274  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1478  fimbrial protein  30.71 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  36.47 
 
 		 184 aa  42.4  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  27.07 
 
 		 174 aa  42.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4958  fimbrial protein major type 1 subunit  36.59 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0414161 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0433  fimbrial protein  36.59 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.428443  hitchhiker  0.0000242972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4851  fimbrial protein major subunit  36.59 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.523252  normal  0.0116968 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>