116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1014 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1014  type I pilus biogensis protein FimA  100 
 
 		 187 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11060  putative fimbrial subunit CupB1  69.31 
 
 		 189 aa  255  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.34054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1532  fimbrial protein  49.49 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.690066 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  33.51 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  34.22 
 
 		 174 aa  74.3  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6929  Fimbrial protein  34.54 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4250  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  37.42 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151797 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  31.07 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  31.07 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  31.07 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0576  fimbrial protein  36.9 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911674  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2972  putative fimbrial subunit  33.13 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4022  fimbrial protein  35.05 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  30.51 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5933  fimbrial protein  31.05 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  31 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  31 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  31 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  32.98 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1675  fimbrial protein  29.65 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0767215  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2660  fimbrial protein  29.65 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  hitchhiker  0.00614159 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1786  fimbrial protein  29.65 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  31.28 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  32.2 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  32.2 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  32.2 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  32.2 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  29.74 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  31.64 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  30.86 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  30.86 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  30.86 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  28.23 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2230  type I pilus biogensis protein FimA  33.95 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1819  fimbrial protein-like protein  28.42 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380476 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  30.23 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  27.71 
 
 		 193 aa  51.6  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69760  putative fimbrial protein  31.48 
 
 		 304 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0511825  normal  0.411103 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  30.65 
 
 		 210 aa  51.2  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  30.11 
 
 		 170 aa  51.2  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  30.11 
 
 		 170 aa  51.2  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  30.11 
 
 		 170 aa  51.2  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  27.72 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3042  fimbrial protein  27.94 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000700395  normal  0.254903 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6274  type-1 fimbrial protein subunit A  32.56 
 
 		 306 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0371  fimbrial protein  29.78 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.136666 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  33.33 
 
 		 177 aa  48.5  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  26.84 
 
 		 185 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4958  fimbrial protein major type 1 subunit  29.78 
 
 		 178 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0414161 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4851  fimbrial protein major subunit  29.78 
 
 		 178 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.523252  normal  0.0116968 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1153  putative fimbrial protein  29.53 
 
 		 186 aa  48.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1891  type 1 pili subunit FimI  28.06 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387649 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3927  putative fimbrial protein FanC  30.16 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.662552 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0373  fimbrial protein  29.21 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0840  fimbrial protein  30.63 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  28.65 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  28.65 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0809  fimbrial protein  30.35 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.362705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  28.65 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0433  fimbrial protein  29.21 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.428443  hitchhiker  0.0000242972 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  27.22 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  30.48 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  29.53 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2039  fimbrial protein  31.29 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330404  normal  0.373612 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3508  putative fimbrial protein  28.79 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000529621  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  27.81 
 
 		 171 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  27.81 
 
 		 171 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  27.81 
 
 		 171 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  27.81 
 
 		 168 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  27.81 
 
 		 168 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4408  fimbrial subunit CupC1  33.01 
 
 		 203 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02915  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.28 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0657  Fimbrial protein  28.28 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59710  putative fimbrial protein precursor  32.78 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.45565e-17  hitchhiker  1.06825e-18 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0767  putative type 1 fimbrial protein  30.05 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3221  putative fimbrial protein  28.28 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501305  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0745  putative type 1 fimbrial protein  30.05 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02865  hypothetical protein  28.28 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0654  putative fimbrial protein  28.28 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.608236 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2936  fimbrial protein  30.05 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.545876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  25.79 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0593  putative fimbrial protein  30.48 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.394086  normal  0.0160572 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37060  fimbrial subunit CupA1  30.65 
 
 		 183 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0597  putative fimbrial protein  29.95 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167394 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3297  fimbrial protein  30.43 
 
 		 329 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0152009 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0601  putative fimbrial protein  29.95 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176424  normal  0.0654863 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0658  putative fimbrial protein  29.95 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0594  putative fimbrial protein  29.95 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  29.17 
 
 		 183 aa  43.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  29.17 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  29.17 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  29.17 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.554066 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00679  predicted fimbrial-like adhesin protein  29.06 
 
 		 188 aa  42  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2917  Fimbrial protein  29.35 
 
 		 188 aa  42  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0948919  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  29.7 
 
 		 170 aa  41.6  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0124  fimbrial protein  29.01 
 
 		 334 aa  41.6  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4961  fimbrial protein  27.27 
 
 		 184 aa  41.6  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180304  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3034  fimbrial protein  32.81 
 
 		 180 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0761  Fimbrial protein  32.17 
 
 		 194 aa  41.6  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.977833  normal  0.0148789 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  26.84 
 
 		 185 aa  41.6  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>