275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2872 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  100 
 
 		 181 aa  348  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  54.6 
 
 		 193 aa  152  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  46.15 
 
 		 176 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  42.86 
 
 		 175 aa  121  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  42.71 
 
 		 190 aa  117  9e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  42.71 
 
 		 190 aa  117  9e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1051  fimbrial protein  41.94 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0357059 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  40.62 
 
 		 190 aa  114  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  39.18 
 
 		 176 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  39.18 
 
 		 176 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  39.18 
 
 		 176 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  37.84 
 
 		 174 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  31.03 
 
 		 200 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  38.59 
 
 		 174 aa  92  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  38.59 
 
 		 174 aa  92  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  38.59 
 
 		 174 aa  92  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  37.84 
 
 		 174 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  35.33 
 
 		 172 aa  88.2  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  35.33 
 
 		 172 aa  88.2  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  35.33 
 
 		 172 aa  88.2  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  35.33 
 
 		 172 aa  88.2  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1106  fimbrial protein  32.6 
 
 		 170 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000811079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2176  fimbrial protein  32.6 
 
 		 170 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  34.73 
 
 		 172 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2700  Fimbrial protein  32.04 
 
 		 187 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2653  fimbrial protein  32.04 
 
 		 171 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000480938  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1058  fimbrial protein  32.04 
 
 		 171 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818586  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1052  fimbrial protein  32.04 
 
 		 171 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000263503  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00947  predicted fimbrial-like adhesin protein  32.04 
 
 		 171 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0285836  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00954  hypothetical protein  32.04 
 
 		 171 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2374  fimbrial protein  31.49 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000854924  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  36.32 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  35.11 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  28.88 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  28.88 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  28.88 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  28.88 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  34.74 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  39.27 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  34.74 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  31.01 
 
 		 165 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  30.38 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  32.46 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  30.38 
 
 		 165 aa  77.4  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  37.82 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  33.76 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  33.76 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  33.76 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  36.71 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  33.76 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  36.71 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  33.76 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  36.14 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  31.79 
 
 		 183 aa  72  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  37.27 
 
 		 182 aa  72  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  31.4 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  31.4 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  31.4 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  31.4 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  31.41 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  31.4 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  34.78 
 
 		 187 aa  70.9  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3185  probable fimbrial protein  30.65 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  32.46 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  32.46 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  31.4 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3262  putative fimbrial protein  31.84 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.792509  normal  0.342422 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  37.5 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3364  fimbrial protein  31.84 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  30.81 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  33.53 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2875  fimbrial protein  37.04 
 
 		 355 aa  68.2  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  32.91 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  35.52 
 
 		 210 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2279  Fimbrial protein  31.61 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  35.52 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  35.52 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  35.52 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4167  fimbrial protein  30.73 
 
 		 185 aa  67  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208519 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4107  fimbrial protein  32.47 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  37.27 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  37.27 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  37.27 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5933  fimbrial protein  32.5 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0051  fimbrial protein  30.21 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  31.89 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  34.76 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3199  fimbrial protein  29.06 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  30.23 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3248  fimbrial protein  28.21 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.0628332 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  31.35 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  33.87 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  31.35 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  33.87 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  33.87 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  31.35 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  31.35 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2230  type I pilus biogensis protein FimA  34.76 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24181  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5763  fimbrial protein  31.4 
 
 		 396 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317961 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3958  hypothetical protein  32.79 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.776659  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>