84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5763 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5763  fimbrial protein  100 
 
 		 396 aa  809    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5793  fimbrial protein  45.26 
 
 		 311 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492679 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0124  fimbrial protein  36.36 
 
 		 334 aa  146  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4996  fimbrial protein  38.98 
 
 		 228 aa  137  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.230772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3297  fimbrial protein  31.86 
 
 		 329 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0152009 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5940  fimbrial protein  33.96 
 
 		 335 aa  129  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3295  fimbrial protein  30.94 
 
 		 336 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0139531 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6926  Fimbrial protein  32.82 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.289443  normal  0.816903 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2545  fimbrial protein  32.03 
 
 		 360 aa  96.7  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.625686 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2969  putative fimbrial protein  30.46 
 
 		 338 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0564  Fimbrial protein  31.36 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.648396 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1072  fimbrial protein  29.48 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3289  fimbrial protein  35.29 
 
 		 134 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.222873 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2875  fimbrial protein  27.5 
 
 		 355 aa  75.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1024  type-1 fimbrial protein, A subunit  32.47 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2230  type-1 fimbrial protein, A subunit  32.47 
 
 		 323 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2030  type-1 fimbrial protein, A subunit  32.47 
 
 		 323 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2087  major fimbrial subunit protein  32.47 
 
 		 323 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2241  fimbrial protein  23.75 
 
 		 331 aa  67  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0288255  normal  0.0430038 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1052  fimbrial protein  28.24 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0195347 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0050  fimbrial protein  29.08 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6274  type-1 fimbrial protein subunit A  28.67 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4404  adhesin 20K  45.1 
 
 		 99 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0060  fimbrial adhesin precursor  28.72 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.485498  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4842  putative major fimbrial protein  26.03 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.491177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0062  fimbrial adhesin precursor  28.01 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.571199  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1816  fimbrial protein-like protein  25.28 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5004  putative major fimbrial subunit  25.58 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.170406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5001  putative major fimbrial subunit  25.58 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4949  putative major fimbrial subunit  25.58 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4915  putative major fimbrial subunit  25.32 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2238  fimbrial protein  27.74 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160036  decreased coverage  0.00460081 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  32.58 
 
 		 193 aa  57  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2785  fimbrial protein  28.4 
 
 		 317 aa  53.9  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.971875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0250  fimbrial family protein  26.35 
 
 		 368 aa  53.1  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.319484  hitchhiker  0.000123535 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0616  fimbrial family protein  26.11 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0697  fimbrial protein  26.95 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  30.64 
 
 		 176 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1150  putative fimbrial protein  26.79 
 
 		 380 aa  49.7  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1498  fimbrial protein  26.46 
 
 		 359 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  28.99 
 
 		 190 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  28.99 
 
 		 190 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  28.99 
 
 		 190 aa  49.3  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4253  fimbrial protein  25.19 
 
 		 336 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413623  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  30.41 
 
 		 180 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  27.22 
 
 		 177 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  29.24 
 
 		 185 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  29.41 
 
 		 172 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  29.41 
 
 		 172 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  29.41 
 
 		 172 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  29.41 
 
 		 172 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  29.82 
 
 		 210 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  27.49 
 
 		 179 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  29.82 
 
 		 170 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  28.65 
 
 		 185 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  29.82 
 
 		 170 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  29.82 
 
 		 170 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  28.65 
 
 		 185 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  27.49 
 
 		 179 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  28.82 
 
 		 172 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  28.82 
 
 		 179 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0836  Fimbrial protein  31.16 
 
 		 298 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.252785 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  28.82 
 
 		 179 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  30.41 
 
 		 176 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  28.82 
 
 		 179 aa  45.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  30.41 
 
 		 176 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  27.78 
 
 		 170 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  27.78 
 
 		 170 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  30.41 
 
 		 176 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  28.82 
 
 		 179 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  31.79 
 
 		 175 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  29.07 
 
 		 181 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  27.78 
 
 		 170 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  28.24 
 
 		 165 aa  44.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5116  fimbrial protein  26.52 
 
 		 339 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0391315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3293  fimbrial protein  26.52 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0241788 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30690  hypothetical protein  29.41 
 
 		 351 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000866279  hitchhiker  0.000842933 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1454  fimbrial protein  27.75 
 
 		 360 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118343 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1697  fimbrial protein  29.41 
 
 		 345 aa  43.9  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  28.24 
 
 		 165 aa  43.5  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  28.24 
 
 		 165 aa  43.1  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  27.22 
 
 		 170 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  27.22 
 
 		 170 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1019  fimbrial protein CupB6  29.89 
 
 		 379 aa  43.1  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>