101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3295 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3295  fimbrial protein  100 
 
 		 336 aa  673    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0139531 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6926  Fimbrial protein  30.59 
 
 		 340 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.289443  normal  0.816903 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2545  fimbrial protein  35.63 
 
 		 360 aa  122  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.625686 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3297  fimbrial protein  34.03 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0152009 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0124  fimbrial protein  33.6 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5763  fimbrial protein  30.94 
 
 		 396 aa  113  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4996  fimbrial protein  46.15 
 
 		 228 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.230772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2969  putative fimbrial protein  42.36 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5793  fimbrial protein  32.81 
 
 		 311 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492679 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3289  fimbrial protein  40.74 
 
 		 134 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.222873 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2241  fimbrial protein  32.93 
 
 		 331 aa  90.5  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0288255  normal  0.0430038 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2030  type-1 fimbrial protein, A subunit  33.5 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1024  type-1 fimbrial protein, A subunit  32.63 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2230  type-1 fimbrial protein, A subunit  33.16 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2087  major fimbrial subunit protein  32.63 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0250  fimbrial family protein  35.86 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.319484  hitchhiker  0.000123535 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0616  fimbrial family protein  35.86 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0697  fimbrial protein  35.86 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4404  adhesin 20K  46.46 
 
 		 99 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4253  fimbrial protein  30.08 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413623  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2238  fimbrial protein  32.7 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160036  decreased coverage  0.00460081 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6274  type-1 fimbrial protein subunit A  27.24 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6650  fimbrial protein  31.68 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136296 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1072  fimbrial protein  25.37 
 
 		 305 aa  62.4  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0836  Fimbrial protein  30.82 
 
 		 298 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.252785 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0765  Fimbrial protein  30.82 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.146412  normal  0.0127423 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1343  Fimbrial protein  34.42 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.259111  normal  0.0328086 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1052  fimbrial protein  29.65 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0195347 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0010  Fimbrial protein  30.95 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2875  fimbrial protein  26.94 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1150  putative fimbrial protein  31.74 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  30.38 
 
 		 180 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1697  fimbrial protein  29.46 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1816  fimbrial protein-like protein  26.29 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  29.94 
 
 		 177 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6640  fimbrial protein  31.29 
 
 		 318 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447531  hitchhiker  0.00000000139123 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  29.56 
 
 		 179 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0564  Fimbrial protein  29.17 
 
 		 345 aa  53.9  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.648396 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  29.56 
 
 		 179 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4961  fimbrial protein  33.54 
 
 		 184 aa  53.1  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180304  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  31.36 
 
 		 183 aa  52.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  30.26 
 
 		 175 aa  52.8  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0010  Fimbrial protein  29.48 
 
 		 319 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  31.01 
 
 		 176 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  31.01 
 
 		 176 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  31.01 
 
 		 176 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  31.78 
 
 		 185 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  31.78 
 
 		 185 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  28.75 
 
 		 187 aa  49.7  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2833  fimbrial protein  29.07 
 
 		 202 aa  49.3  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2036  fimbrial protein  25.22 
 
 		 371 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2234  fimbrial protein  28.48 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.22557  normal  0.0194534 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  28.92 
 
 		 176 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  28.92 
 
 		 176 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  28.92 
 
 		 176 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  28.92 
 
 		 176 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  28.92 
 
 		 176 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1454  fimbrial protein  28.36 
 
 		 360 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118343 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  28.92 
 
 		 176 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  28.92 
 
 		 176 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1051  fimbrial protein  27.63 
 
 		 174 aa  47.4  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0357059 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  33.33 
 
 		 185 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4025  fimbrial protein  30.57 
 
 		 334 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.355446 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0050  fimbrial protein  25.41 
 
 		 354 aa  47  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  29.81 
 
 		 176 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  32.52 
 
 		 185 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  32.52 
 
 		 185 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0062  fimbrial adhesin precursor  23.01 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.571199  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4949  putative major fimbrial subunit  27 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5001  putative major fimbrial subunit  27 
 
 		 361 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4842  putative major fimbrial protein  27 
 
 		 361 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.491177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4915  putative major fimbrial subunit  27 
 
 		 361 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5004  putative major fimbrial subunit  27 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.170406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2785  fimbrial protein  26.07 
 
 		 317 aa  45.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.971875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  27.22 
 
 		 193 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0060  fimbrial adhesin precursor  26.62 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.485498  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3037  fimbrial protein  28.22 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.130146  normal  0.538691 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  27.53 
 
 		 190 aa  44.3  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  27.53 
 
 		 190 aa  43.9  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  28.05 
 
 		 176 aa  43.9  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6670  fimbrial protein  31.62 
 
 		 181 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.12656 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  27.53 
 
 		 190 aa  43.9  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  28.92 
 
 		 176 aa  43.9  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  27.59 
 
 		 168 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  27.59 
 
 		 171 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  27.59 
 
 		 171 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  27.59 
 
 		 171 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  27.59 
 
 		 168 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59710  putative fimbrial protein precursor  30.11 
 
 		 182 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.45565e-17  hitchhiker  1.06825e-18 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3816  Fimbrial protein  25.97 
 
 		 222 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351886 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4917  protein LpfE  24.5 
 
 		 176 aa  43.5  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3929  Fimbrial protein  25.97 
 
 		 222 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.19818 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37060  fimbrial subunit CupA1  29.89 
 
 		 183 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  28 
 
 		 172 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  27.44 
 
 		 176 aa  42.7  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  27.44 
 
 		 176 aa  42.7  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  27.44 
 
 		 176 aa  42.7  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  27.44 
 
 		 176 aa  42.7  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  27.44 
 
 		 176 aa  42.7  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  27.44 
 
 		 176 aa  42.4  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>