44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1150 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1150  putative fimbrial protein  100 
 
 		 380 aa  763    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2230  type-1 fimbrial protein, A subunit  30.12 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6274  type-1 fimbrial protein subunit A  31.36 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2030  type-1 fimbrial protein, A subunit  29.81 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2087  major fimbrial subunit protein  30.12 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3297  fimbrial protein  32.31 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0152009 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1024  type-1 fimbrial protein, A subunit  34.23 
 
 		 204 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4253  fimbrial protein  29 
 
 		 336 aa  63.2  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413623  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0010  Fimbrial protein  24.61 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0010  Fimbrial protein  24.05 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2241  fimbrial protein  41.57 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0288255  normal  0.0430038 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3929  Fimbrial protein  31.41 
 
 		 222 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.19818 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3816  Fimbrial protein  31.41 
 
 		 222 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351886 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0050  fimbrial protein  34.78 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0060  fimbrial adhesin precursor  33.12 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.485498  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3295  fimbrial protein  31.74 
 
 		 336 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0139531 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0564  Fimbrial protein  38.31 
 
 		 345 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.648396 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2969  putative fimbrial protein  33.77 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  31.4 
 
 		 176 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  31.4 
 
 		 176 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  31.4 
 
 		 176 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  31.4 
 
 		 176 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  31.4 
 
 		 176 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  31.4 
 
 		 176 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  31.4 
 
 		 176 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2238  fimbrial protein  32.53 
 
 		 327 aa  53.1  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160036  decreased coverage  0.00460081 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0124  fimbrial protein  28.76 
 
 		 334 aa  53.1  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  30.81 
 
 		 176 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2036  fimbrial protein  30.41 
 
 		 371 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5763  fimbrial protein  26.79 
 
 		 396 aa  49.7  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317961 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3289  fimbrial protein  33.88 
 
 		 134 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.222873 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1343  Fimbrial protein  23.73 
 
 		 315 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.259111  normal  0.0328086 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1789  fimbrial protein  27.88 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00112621  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4996  fimbrial protein  36.3 
 
 		 228 aa  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.230772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  32.05 
 
 		 175 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1678  fimbrial family protein  27.88 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5793  fimbrial protein  32.03 
 
 		 311 aa  47.4  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1454  fimbrial protein  31.9 
 
 		 360 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0836  Fimbrial protein  28.19 
 
 		 298 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.252785 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4025  fimbrial protein  29.14 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.355446 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2545  fimbrial protein  33.12 
 
 		 360 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.625686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3037  fimbrial protein  27.91 
 
 		 351 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.130146  normal  0.538691 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0062  fimbrial adhesin precursor  28.44 
 
 		 348 aa  44.7  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.571199  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2227  fimbrial protein, putative  33.33 
 
 		 370 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0719141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>