39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3289 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3289  fimbrial protein  100 
 
 		 134 aa  269  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.222873 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6926  Fimbrial protein  46.02 
 
 		 340 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.289443  normal  0.816903 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3297  fimbrial protein  42.75 
 
 		 329 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0152009 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4996  fimbrial protein  40.29 
 
 		 228 aa  97.4  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.230772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3295  fimbrial protein  40.74 
 
 		 336 aa  97.4  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0139531 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0124  fimbrial protein  41.35 
 
 		 334 aa  95.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2238  fimbrial protein  48.31 
 
 		 327 aa  93.6  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160036  decreased coverage  0.00460081 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2241  fimbrial protein  45.3 
 
 		 331 aa  93.6  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0288255  normal  0.0430038 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2545  fimbrial protein  44.78 
 
 		 360 aa  91.3  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.625686 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2969  putative fimbrial protein  40.74 
 
 		 338 aa  90.9  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5763  fimbrial protein  35.29 
 
 		 396 aa  81.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317961 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4404  adhesin 20K  45.1 
 
 		 99 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0250  fimbrial family protein  34.35 
 
 		 368 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.319484  hitchhiker  0.000123535 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0697  fimbrial protein  33.59 
 
 		 367 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0616  fimbrial family protein  33.59 
 
 		 367 aa  71.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5793  fimbrial protein  37.9 
 
 		 311 aa  68.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492679 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  34.65 
 
 		 177 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  34.13 
 
 		 179 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  33.33 
 
 		 179 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1150  putative fimbrial protein  33.88 
 
 		 380 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6274  type-1 fimbrial protein subunit A  27.2 
 
 		 306 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  32.5 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  32.26 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5940  fimbrial protein  30.6 
 
 		 335 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2030  type-1 fimbrial protein, A subunit  29.31 
 
 		 323 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2230  type-1 fimbrial protein, A subunit  29.31 
 
 		 323 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4958  fimbrial protein  32.46 
 
 		 363 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00524555  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1024  type-1 fimbrial protein, A subunit  28.45 
 
 		 204 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1697  fimbrial protein  25.97 
 
 		 345 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1052  fimbrial protein  25.98 
 
 		 345 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0195347 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2785  fimbrial protein  30.4 
 
 		 317 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.971875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2087  major fimbrial subunit protein  28.45 
 
 		 323 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  30.71 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04793  P pilus assembly protein  42.19 
 
 		 173 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2234  fimbrial protein  25.19 
 
 		 338 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.22557  normal  0.0194534 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  31.48 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5116  fimbrial protein  30.33 
 
 		 339 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0391315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2875  fimbrial protein  26.72 
 
 		 355 aa  40.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4253  fimbrial protein  32.95 
 
 		 336 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413623  normal  0.180606 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>