194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04793 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04793  P pilus assembly protein  100 
 
 		 173 aa  352  1e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  45.81 
 
 		 170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  42.53 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  42.53 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  42.53 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  44.94 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  44.94 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  43.87 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  43.87 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  43.87 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  43.87 
 
 		 210 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  45.03 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  36.02 
 
 		 185 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  36.76 
 
 		 185 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  36.76 
 
 		 185 aa  91.7  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  38.51 
 
 		 174 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  36.67 
 
 		 187 aa  89  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  36.67 
 
 		 187 aa  89  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  37.84 
 
 		 174 aa  87.8  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  37.84 
 
 		 174 aa  87.8  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  37.84 
 
 		 174 aa  87.8  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  36.76 
 
 		 185 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  32.8 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  36.76 
 
 		 185 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  38.51 
 
 		 174 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  37.41 
 
 		 184 aa  84.3  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0571  type-1 fimbrial protein  36.46 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004539  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00480  predicted fimbrial-like adhesin protein  35.91 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3083  Fimbrial protein  35.91 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0205144  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00485  hypothetical protein  35.91 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0604  type-1 fimbrial protein  35.91 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000140279  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0631  type-1 fimbrial protein homolog  35.91 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168996  normal  0.298976 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0575  type-1 fimbrial protein  35.91 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3092  fimbrial protein  35.91 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  34.42 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  35.61 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4148  fimbrial protein  33.33 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  31.58 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  37.01 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  35.16 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  35.16 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  35.16 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  33.55 
 
 		 183 aa  70.9  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  35.53 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  29.95 
 
 		 187 aa  67  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  33.91 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  33.91 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  33.91 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  33.91 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  34.23 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  31.38 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  33.56 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  31.02 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  31.02 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4675  fimbrial protein  28.99 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  30 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  30 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2448  fimbrial protein  38.75 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  30 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  33.56 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  30 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4677  fimbrial protein  29.66 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  31.72 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01468  predicted transcriptional regulator  35.11 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4672  fimbrial protein  31.21 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0809  fimbrial protein  30.95 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.362705  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2917  Fimbrial protein  32.14 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0948919  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  31.67 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  31.67 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  31.67 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  31.67 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  31.67 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0826  Fimbrial protein  28.1 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  30.72 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  30.72 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  30.72 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  30.72 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  30.72 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  25 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  25 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  25 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4144  fimbrial protein  28.66 
 
 		 222 aa  54.3  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.370887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3481  fimbrial protein  35.37 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00679  predicted fimbrial-like adhesin protein  30.37 
 
 		 188 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0767  putative type 1 fimbrial protein  30.37 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0745  putative type 1 fimbrial protein  30.37 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4721  fimbrial protein  28.57 
 
 		 220 aa  53.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.687124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2936  fimbrial protein  30.37 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.545876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02865  hypothetical protein  36 
 
 		 183 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02915  predicted fimbrial-like adhesin protein  36 
 
 		 183 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0657  Fimbrial protein  36 
 
 		 183 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  35.79 
 
 		 180 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3221  putative fimbrial protein  36 
 
 		 183 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501305  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0654  putative fimbrial protein  36 
 
 		 183 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.608236 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3508  putative fimbrial protein  36 
 
 		 183 aa  52  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000529621  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  31.73 
 
 		 200 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0115  frimbrial protein  27.27 
 
 		 184 aa  50.8  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2490  fimbrial protein  31.71 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4018  hypothetical protein  31.58 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.665772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3914  hypothetical protein  31.58 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>