23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4958 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4958  fimbrial protein  100 
 
 		 363 aa  719    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00524555  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3723  fimbrial protein  42.14 
 
 		 364 aa  173  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1697  fimbrial protein  35.88 
 
 		 345 aa  152  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5116  fimbrial protein  36.5 
 
 		 339 aa  145  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0391315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2969  putative fimbrial protein  28.49 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0118  major fimbrial subunit protein  34.11 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1052  fimbrial protein  32.9 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0195347 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6670  fimbrial protein  33.83 
 
 		 181 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.12656 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1816  fimbrial protein-like protein  25.09 
 
 		 338 aa  52.8  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0153  major fimbrial subunit protein  34.38 
 
 		 190 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0129  major fimbrial subunit protein  34.38 
 
 		 190 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1602  major fimbrial subunit protein  34.38 
 
 		 187 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.543363  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3031  fimbrial protein  35.71 
 
 		 187 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3289  fimbrial protein  31.16 
 
 		 134 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.222873 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3295  fimbrial protein  28.02 
 
 		 336 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0139531 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  36.52 
 
 		 176 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  36.52 
 
 		 176 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  36.52 
 
 		 176 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6274  type-1 fimbrial protein subunit A  32.74 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1150  putative fimbrial protein  25.2 
 
 		 380 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  31.91 
 
 		 175 aa  43.5  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6926  Fimbrial protein  28.35 
 
 		 340 aa  43.5  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.289443  normal  0.816903 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  31.25 
 
 		 182 aa  42.7  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>