134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2875 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2875  fimbrial protein  100 
 
 		 355 aa  723    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1052  fimbrial protein  43.7 
 
 		 345 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0195347 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1072  fimbrial protein  35.88 
 
 		 305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2785  fimbrial protein  31.58 
 
 		 317 aa  87  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.971875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  38.22 
 
 		 175 aa  77.4  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5940  fimbrial protein  32.47 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5763  fimbrial protein  27.5 
 
 		 396 aa  75.9  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317961 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2030  type-1 fimbrial protein, A subunit  34.29 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  37.35 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  29.03 
 
 		 187 aa  72  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1024  type-1 fimbrial protein, A subunit  33.57 
 
 		 204 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2230  type-1 fimbrial protein, A subunit  33.57 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2087  major fimbrial subunit protein  33.57 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  38.16 
 
 		 172 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  38.16 
 
 		 172 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  38.16 
 
 		 172 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  38.16 
 
 		 172 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  38.82 
 
 		 172 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  29.14 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  29.14 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5116  fimbrial protein  29.29 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0391315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  28.48 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  29.14 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  29.14 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6274  type-1 fimbrial protein subunit A  29.73 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  33.75 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3297  fimbrial protein  29.7 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0152009 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  30.07 
 
 		 168 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2241  fimbrial protein  28.37 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0288255  normal  0.0430038 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  30.07 
 
 		 171 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  29.01 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1051  fimbrial protein  33.56 
 
 		 174 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0357059 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  29.01 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  30.07 
 
 		 168 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  30.07 
 
 		 171 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  32.03 
 
 		 180 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  30.07 
 
 		 171 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3836  fimbrial protein-like protein  30.13 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.38252  normal  0.631566 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2227  fimbrial protein, putative  31.01 
 
 		 370 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0719141  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  28.4 
 
 		 190 aa  57  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  31.85 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  31.85 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  31.85 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3295  fimbrial protein  26.94 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0139531 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  31.65 
 
 		 182 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5004  putative major fimbrial subunit  29.94 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.170406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3849  protein LpfE  32.03 
 
 		 175 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.551931  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4842  putative major fimbrial protein  29.94 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.491177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6926  Fimbrial protein  28.57 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.289443  normal  0.816903 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4018  hypothetical protein  32.03 
 
 		 175 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.665772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3914  hypothetical protein  32.03 
 
 		 175 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3958  hypothetical protein  32.03 
 
 		 175 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.776659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4915  putative major fimbrial subunit  29.94 
 
 		 361 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4949  putative major fimbrial subunit  29.94 
 
 		 361 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  30.46 
 
 		 174 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5793  fimbrial protein  27.4 
 
 		 311 aa  54.3  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492679 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  30.46 
 
 		 174 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  30.46 
 
 		 174 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5001  putative major fimbrial subunit  29.94 
 
 		 361 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  34.57 
 
 		 181 aa  53.9  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2115  protein FimH homolog  26.14 
 
 		 304 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173626 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01460  predicted fimbrial-like adhesin protein  26.14 
 
 		 304 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2144  FimH mannose-binding domain protein  26.14 
 
 		 304 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.075619  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01472  hypothetical protein  26.14 
 
 		 304 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1586  protein FimH-like protein  26.14 
 
 		 304 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2155  FimH mannose-binding domain-containing protein  26.14 
 
 		 304 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1691  protein FimH-like protein  25.82 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  29.14 
 
 		 174 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0124  fimbrial protein  26.21 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00480  predicted fimbrial-like adhesin protein  26.92 
 
 		 180 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  29.27 
 
 		 179 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3083  Fimbrial protein  26.92 
 
 		 180 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0205144  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  29.27 
 
 		 179 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0631  type-1 fimbrial protein homolog  26.92 
 
 		 180 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168996  normal  0.298976 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  29.27 
 
 		 179 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0604  type-1 fimbrial protein  26.92 
 
 		 180 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000140279  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  29.27 
 
 		 179 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3092  fimbrial protein  26.92 
 
 		 180 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0575  type-1 fimbrial protein  26.92 
 
 		 180 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00485  hypothetical protein  26.92 
 
 		 180 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2700  Fimbrial protein  31.68 
 
 		 187 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1052  fimbrial protein  31.68 
 
 		 171 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000263503  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0571  type-1 fimbrial protein  26.92 
 
 		 180 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004539  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2653  fimbrial protein  31.68 
 
 		 171 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000480938  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1671  protein FimH-like protein  27.36 
 
 		 304 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.817928 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1106  fimbrial protein  32.05 
 
 		 170 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000811079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1058  fimbrial protein  32.05 
 
 		 171 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818586  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2176  fimbrial protein  32.05 
 
 		 170 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  29.27 
 
 		 165 aa  50.4  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  27.81 
 
 		 177 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4996  fimbrial protein  26.32 
 
 		 228 aa  49.7  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.230772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1697  fimbrial protein  26.05 
 
 		 345 aa  49.7  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  28.66 
 
 		 165 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00947  predicted fimbrial-like adhesin protein  31.06 
 
 		 171 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0285836  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  32.1 
 
 		 180 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00954  hypothetical protein  31.06 
 
 		 171 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  29.8 
 
 		 176 aa  49.3  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2238  fimbrial protein  25 
 
 		 327 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160036  decreased coverage  0.00460081 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  29.27 
 
 		 165 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2374  fimbrial protein  31.41 
 
 		 171 aa  48.1  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000854924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>