295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2090 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  100 
 
 		 176 aa  341  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  100 
 
 		 176 aa  341  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  100 
 
 		 176 aa  341  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  44.97 
 
 		 176 aa  121  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  42.68 
 
 		 193 aa  99.8  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  35.53 
 
 		 171 aa  90.9  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  35.53 
 
 		 171 aa  90.9  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  35.53 
 
 		 171 aa  90.9  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  35.53 
 
 		 168 aa  90.9  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  35.53 
 
 		 168 aa  90.9  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  37.91 
 
 		 172 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  37.04 
 
 		 175 aa  88.2  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  37.25 
 
 		 172 aa  88.2  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  37.25 
 
 		 172 aa  88.2  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  37.25 
 
 		 172 aa  88.2  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  37.25 
 
 		 172 aa  88.2  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  35.16 
 
 		 176 aa  87.4  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  36.13 
 
 		 176 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  36.13 
 
 		 176 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  36.13 
 
 		 176 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  36.13 
 
 		 176 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  32.45 
 
 		 185 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  36.13 
 
 		 176 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  36.13 
 
 		 176 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  36.13 
 
 		 176 aa  85.5  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  35.96 
 
 		 190 aa  85.1  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  35.96 
 
 		 190 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  38.37 
 
 		 181 aa  85.1  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  32.6 
 
 		 179 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  32.6 
 
 		 179 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  32.28 
 
 		 174 aa  84.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  32.6 
 
 		 179 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  32.28 
 
 		 174 aa  84.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  32.6 
 
 		 179 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  32.28 
 
 		 174 aa  84.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  36.21 
 
 		 179 aa  84.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  33.33 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  35.39 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  30.11 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  31.38 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  35.63 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  32.45 
 
 		 185 aa  80.9  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  38.51 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  32.45 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  31.87 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  31.87 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  34.3 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  31.01 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  35.71 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  31.87 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  35.88 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  37.87 
 
 		 170 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  37.87 
 
 		 170 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  37.87 
 
 		 170 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  36.81 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  36.81 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  36.81 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  32.03 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  33.91 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  36.81 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  36.81 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  33.13 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  33.13 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  37.09 
 
 		 170 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  37.09 
 
 		 170 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4018  hypothetical protein  32.77 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.665772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3958  hypothetical protein  32.77 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.776659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3914  hypothetical protein  32.77 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3849  protein LpfE  32.77 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.551931  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  35.1 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4672  fimbrial protein  30.77 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  33.99 
 
 		 182 aa  70.9  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4675  fimbrial protein  25.88 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  25.42 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  25.42 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  36.11 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  25.42 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  25.42 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  25.42 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  25.42 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  25.42 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  25.42 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  36.24 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  31.25 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1106  fimbrial protein  29.65 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000811079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2176  fimbrial protein  29.65 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102099  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00947  predicted fimbrial-like adhesin protein  30.67 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0285836  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00954  hypothetical protein  30.67 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2700  Fimbrial protein  30.67 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3199  fimbrial protein  30.37 
 
 		 195 aa  67.8  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1058  fimbrial protein  30.67 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818586  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1598  frimbrial protein  27.32 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2653  fimbrial protein  30.67 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000480938  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1052  fimbrial protein  30.67 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000263503  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1051  fimbrial protein  37.58 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0357059 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00946  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.48 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.118713  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1057  fimbrial protein  28.48 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000439054  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2654  fimbrial protein  28.48 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00417117  hitchhiker  0.00341593 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2375  fimbrial protein  28.48 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000301553  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1051  fimbrial protein  28.48 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00269088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>