138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A1051 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00946  predicted fimbrial-like adhesin protein  100 
 
 
180 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.118713  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2701  Fimbrial protein  100 
 
 
180 aa  365  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000889642  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1051  fimbrial protein  100 
 
 
180 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00269088  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1057  fimbrial protein  100 
 
 
180 aa  365  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000439054  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00953  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116375  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2654  fimbrial protein  100 
 
 
180 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00417117  hitchhiker  0.00341593 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2375  fimbrial protein  100 
 
 
180 aa  365  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000301553  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1105  fimbrial protein  100 
 
 
150 aa  301  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000686387  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2177  fimbrial protein  98 
 
 
150 aa  295  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000769116  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  43.51 
 
 
168 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  43.51 
 
 
168 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  43.51 
 
 
171 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  43.51 
 
 
171 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  43.51 
 
 
171 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  32.1 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  30.26 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  31.79 
 
 
185 aa  74.3  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  31.37 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  32.72 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  32.72 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  28.48 
 
 
176 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  28.48 
 
 
176 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  28.48 
 
 
176 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  32.69 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  32.69 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  32.69 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  32.69 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  32.69 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  31.41 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  32.05 
 
 
176 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  32.05 
 
 
176 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0988  fimbrial protein  23.84 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.991205  normal  0.0750747 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  29.03 
 
 
176 aa  62  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  27.81 
 
 
176 aa  61.2  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  28.49 
 
 
176 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  28.49 
 
 
176 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  28.49 
 
 
176 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  28.49 
 
 
176 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  28.49 
 
 
176 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  27.96 
 
 
176 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  28.76 
 
 
176 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0590  fimbrial protein internal segment  24.52 
 
 
164 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0238251  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0589  fimbrial protein internal segment  24.52 
 
 
164 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0147243 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  30.26 
 
 
172 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  30.26 
 
 
172 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  30.26 
 
 
172 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0597  fimbrial protein internal segment  24.52 
 
 
164 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0916045 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  30.26 
 
 
172 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0654  fimbrial protein internal segment  24.52 
 
 
164 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.781355  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  27.42 
 
 
180 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0992  putative fimbrial protein  23.33 
 
 
174 aa  55.1  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000260678 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  32.26 
 
 
183 aa  54.3  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0597  putative fimbrial protein  29.49 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.167394 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  28.95 
 
 
174 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  23.37 
 
 
200 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0601  putative fimbrial protein  29.49 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176424  normal  0.0654863 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  28.95 
 
 
174 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0658  putative fimbrial protein  29.49 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0594  putative fimbrial protein  29.49 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  28.95 
 
 
174 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  29.76 
 
 
184 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  26.32 
 
 
190 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  29.61 
 
 
172 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00480  predicted fimbrial-like adhesin protein  30.77 
 
 
180 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00947  predicted fimbrial-like adhesin protein  29.14 
 
 
171 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0285836  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  25.53 
 
 
179 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3083  Fimbrial protein  30.77 
 
 
180 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0205144  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  25.53 
 
 
179 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00485  hypothetical protein  30.77 
 
 
180 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  25.53 
 
 
179 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0604  type-1 fimbrial protein  30.77 
 
 
180 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000140279  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  25.53 
 
 
179 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0571  type-1 fimbrial protein  30.77 
 
 
180 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004539  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  26.32 
 
 
190 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00954  hypothetical protein  29.14 
 
 
171 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3092  fimbrial protein  30.77 
 
 
180 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124321  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0575  type-1 fimbrial protein  30.77 
 
 
180 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0562802  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0631  type-1 fimbrial protein homolog  30.77 
 
 
180 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168996  normal  0.298976 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  25.49 
 
 
165 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2279  Fimbrial protein  25.57 
 
 
192 aa  52.4  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  26.32 
 
 
190 aa  52.8  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  25.97 
 
 
165 aa  52.4  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  28.29 
 
 
174 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2700  Fimbrial protein  28.48 
 
 
187 aa  52  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1058  fimbrial protein  28.11 
 
 
171 aa  52  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818586  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1106  fimbrial protein  28.48 
 
 
170 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000811079  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1052  fimbrial protein  28.48 
 
 
171 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000263503  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2653  fimbrial protein  28.48 
 
 
171 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000480938  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  25.48 
 
 
165 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2176  fimbrial protein  28.48 
 
 
170 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102099  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0593  putative fimbrial protein  28.85 
 
 
172 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.394086  normal  0.0160572 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  26.88 
 
 
170 aa  50.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  26.88 
 
 
170 aa  50.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  26.88 
 
 
170 aa  50.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2374  fimbrial protein  28.11 
 
 
171 aa  50.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000854924  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1068  fimbrial protein  29.3 
 
 
183 aa  49.7  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.12012 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  26.42 
 
 
170 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  29.33 
 
 
180 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4672  fimbrial protein  26.32 
 
 
183 aa  48.9  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  29.33 
 
 
180 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>