235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01462 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  100 
 
 		 176 aa  362  2e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  100 
 
 		 176 aa  362  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  100 
 
 		 176 aa  362  2e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  362  2e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  100 
 
 		 176 aa  362  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  99.43 
 
 		 176 aa  359  9e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  98.86 
 
 		 176 aa  359  1e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  98.3 
 
 		 176 aa  356  8e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  45.03 
 
 		 176 aa  150  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  45.03 
 
 		 176 aa  149  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  45.03 
 
 		 176 aa  149  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  45.03 
 
 		 176 aa  149  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  45.03 
 
 		 176 aa  149  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  45.03 
 
 		 176 aa  149  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  44.44 
 
 		 176 aa  148  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  43.86 
 
 		 176 aa  147  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  34.1 
 
 		 172 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  33.53 
 
 		 172 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  33.53 
 
 		 172 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  33.53 
 
 		 172 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  33.53 
 
 		 172 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  34.16 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  34.16 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  34.16 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  34.64 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  34.64 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  33.74 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  33.99 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  34.64 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  34.64 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  30.67 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  30.67 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  30.67 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  30.67 
 
 		 168 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  31.43 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  30.67 
 
 		 168 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00947  predicted fimbrial-like adhesin protein  33.9 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0285836  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00954  hypothetical protein  33.9 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  32.03 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  32.47 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  32.73 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2653  fimbrial protein  33.33 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000480938  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2700  Fimbrial protein  33.33 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1052  fimbrial protein  33.33 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000263503  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  31.85 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2176  fimbrial protein  33.33 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1106  fimbrial protein  33.33 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000811079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1058  fimbrial protein  33.33 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818586  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  31.85 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  31.4 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2374  fimbrial protein  33.33 
 
 		 171 aa  72  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000854924  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0196  putative fimbrial protein  32.91 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.700219  normal  0.468344 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  33.12 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00480  predicted fimbrial-like adhesin protein  33.13 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3083  Fimbrial protein  33.13 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0205144  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  29.14 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  25.42 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0631  type-1 fimbrial protein homolog  33.13 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168996  normal  0.298976 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  25.42 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  25.42 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00485  hypothetical protein  33.13 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3092  fimbrial protein  33.13 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0604  type-1 fimbrial protein  33.13 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000140279  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0575  type-1 fimbrial protein  33.13 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0571  type-1 fimbrial protein  33.13 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004539  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2177  fimbrial protein  33.33 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000769116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  27.85 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  29.14 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  29.14 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  29.14 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  29.14 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  29.14 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1454  fimbrial protein  31.45 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118343 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4953  putative fimbrial chaperone  30.34 
 
 		 181 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4919  putative fimbrial chaparone  30.34 
 
 		 181 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.663343  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4846  putative fimbrial chaparone  29.83 
 
 		 181 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.417477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5005  putative fimbrial chaperone  30.34 
 
 		 181 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5008  putative fimbrial chaperone  30.34 
 
 		 181 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  30.56 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00946  predicted fimbrial-like adhesin protein  32.69 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.118713  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2701  Fimbrial protein  32.69 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000889642  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1105  fimbrial protein  32.69 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000686387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1051  fimbrial protein  32.69 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00269088  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1057  fimbrial protein  32.69 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000439054  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2654  fimbrial protein  32.69 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00417117  hitchhiker  0.00341593 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00953  hypothetical protein  32.69 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116375  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2375  fimbrial protein  32.69 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000301553  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  31.52 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  33.99 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  31.48 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0992  putative fimbrial protein  27.37 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000260678 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  30.92 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  30.92 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3176  fimbrial subunit  33.12 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.312999 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  27.27 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  27.27 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  27.27 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  27.27 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3274  fimbrial subunit  33.12 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  27.67 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>