278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2283 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  100 
 
 		 183 aa  360  5.0000000000000005e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  59.12 
 
 		 187 aa  185  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  51.87 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  57.23 
 
 		 185 aa  178  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  50.8 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  51.34 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  51.34 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00480  predicted fimbrial-like adhesin protein  51.85 
 
 		 180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00485  hypothetical protein  51.85 
 
 		 180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3083  Fimbrial protein  51.85 
 
 		 180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0205144  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0575  type-1 fimbrial protein  51.85 
 
 		 180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3092  fimbrial protein  51.85 
 
 		 180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0604  type-1 fimbrial protein  51.85 
 
 		 180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000140279  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0571  type-1 fimbrial protein  51.85 
 
 		 180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004539  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0631  type-1 fimbrial protein homolog  51.85 
 
 		 180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168996  normal  0.298976 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  54.09 
 
 		 182 aa  150  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  50.31 
 
 		 187 aa  144  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  50.31 
 
 		 187 aa  144  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  55.62 
 
 		 184 aa  142  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  54.09 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  54.09 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  54.09 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  54.37 
 
 		 182 aa  139  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  41.57 
 
 		 170 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  40.85 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  39.89 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  39.89 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  39.89 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  39.76 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  39.76 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  40.65 
 
 		 170 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  40.65 
 
 		 170 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  39.76 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  39.16 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  35 
 
 		 200 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0988  fimbrial protein  35.12 
 
 		 181 aa  99  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.991205  normal  0.0750747 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  37.7 
 
 		 210 aa  98.6  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  37.7 
 
 		 170 aa  98.6  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  37.7 
 
 		 170 aa  98.6  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  37.7 
 
 		 170 aa  98.6  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  35.59 
 
 		 179 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  35.59 
 
 		 179 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  35.59 
 
 		 179 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  35.59 
 
 		 179 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  39.68 
 
 		 190 aa  98.2  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  39.68 
 
 		 190 aa  98.2  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01468  predicted transcriptional regulator  48 
 
 		 178 aa  97.4  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  37.11 
 
 		 165 aa  97.4  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  35.85 
 
 		 165 aa  95.5  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  38.06 
 
 		 174 aa  94.7  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  39.15 
 
 		 190 aa  94.7  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  36.48 
 
 		 165 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0654  fimbrial protein internal segment  33.33 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.781355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0597  fimbrial protein internal segment  33.33 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0916045 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0590  fimbrial protein internal segment  32.74 
 
 		 164 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0238251  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0589  fimbrial protein internal segment  32.74 
 
 		 164 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0147243 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  41.72 
 
 		 193 aa  92.8  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  37.57 
 
 		 175 aa  89.4  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  41.45 
 
 		 180 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  41.45 
 
 		 180 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  41.45 
 
 		 180 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  41.45 
 
 		 180 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  41.45 
 
 		 172 aa  88.6  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  37.43 
 
 		 176 aa  88.2  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  37.43 
 
 		 176 aa  88.2  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  37.43 
 
 		 176 aa  88.2  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  37.43 
 
 		 176 aa  88.2  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  36.84 
 
 		 176 aa  86.7  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04793  P pilus assembly protein  32.79 
 
 		 173 aa  84.3  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  31.55 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  31.55 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  31.55 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  31.55 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  31.55 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  33.16 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  31.55 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  31.55 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  31.55 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  33.33 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  33.77 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  33.77 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  33.77 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  33.77 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  33.77 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  34.78 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  32.62 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0192  putative fimbrial subunit  32.62 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0992  putative fimbrial protein  32.8 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000260678 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  33.52 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  33.52 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  33.52 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  38.22 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0209  putative fimbrial subunit  31.89 
 
 		 177 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  33.97 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  33.54 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  35 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  33.53 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  33.53 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  33.53 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  33.54 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>