284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3918 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  100 
 
 		 174 aa  344  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  100 
 
 		 174 aa  344  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  100 
 
 		 174 aa  344  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  97.13 
 
 		 174 aa  333  7.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  72.99 
 
 		 174 aa  264  5.999999999999999e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  31.28 
 
 		 179 aa  101  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  31.28 
 
 		 179 aa  101  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  31.28 
 
 		 179 aa  101  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  31.28 
 
 		 179 aa  101  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  33.33 
 
 		 165 aa  100  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  33.33 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0571  type-1 fimbrial protein  38.65 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004539  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  33.33 
 
 		 187 aa  99.4  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00480  predicted fimbrial-like adhesin protein  38.04 
 
 		 180 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0631  type-1 fimbrial protein homolog  38.04 
 
 		 180 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168996  normal  0.298976 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0575  type-1 fimbrial protein  38.04 
 
 		 180 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0562802  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3083  Fimbrial protein  38.04 
 
 		 180 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0205144  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00485  hypothetical protein  38.04 
 
 		 180 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  33.33 
 
 		 165 aa  99.4  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3092  fimbrial protein  38.04 
 
 		 180 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0604  type-1 fimbrial protein  38.04 
 
 		 180 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000140279  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  35.62 
 
 		 172 aa  98.2  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  36.36 
 
 		 185 aa  97.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  38.56 
 
 		 185 aa  97.4  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  38.56 
 
 		 176 aa  97.1  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  36.36 
 
 		 185 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  38.29 
 
 		 170 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  38.29 
 
 		 170 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  38.29 
 
 		 170 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  37.71 
 
 		 210 aa  95.5  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  37.71 
 
 		 170 aa  95.5  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  37.71 
 
 		 170 aa  95.5  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  37.71 
 
 		 170 aa  95.5  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  39.76 
 
 		 183 aa  93.2  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  38.86 
 
 		 170 aa  93.2  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  36.36 
 
 		 185 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  36.36 
 
 		 185 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  34.19 
 
 		 172 aa  90.9  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  34.19 
 
 		 172 aa  90.9  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  34.19 
 
 		 172 aa  90.9  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  34.19 
 
 		 172 aa  90.9  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  37.3 
 
 		 190 aa  90.1  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  37.3 
 
 		 190 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  37.3 
 
 		 190 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  37.25 
 
 		 187 aa  90.1  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  38.29 
 
 		 170 aa  88.2  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  38.29 
 
 		 170 aa  88.2  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04793  P pilus assembly protein  37.84 
 
 		 173 aa  87.8  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  37.09 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  37.09 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  37.29 
 
 		 174 aa  86.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  32.57 
 
 		 176 aa  85.5  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  32.28 
 
 		 176 aa  84.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  32.28 
 
 		 176 aa  84.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  32.28 
 
 		 176 aa  84.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  34.16 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  34.16 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4148  fimbrial protein  33.33 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  34.16 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  34.16 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  34.16 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  33.12 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  32.57 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  33.12 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0590  fimbrial protein internal segment  29.14 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0238251  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0589  fimbrial protein internal segment  29.14 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0147243 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0597  fimbrial protein internal segment  28.48 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0916045 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0654  fimbrial protein internal segment  28.48 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.781355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4167  fimbrial protein  31.11 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208519 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  31.25 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4107  fimbrial protein  30.94 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  33.89 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  31.25 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0051  fimbrial protein  31.11 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  31.25 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  33.89 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  33.89 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  31.25 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  31.25 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  33.89 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  34.83 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  35.86 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  32.96 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2872  fimbrial protein  38.59 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1106  fimbrial protein  29.89 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000811079  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00947  predicted fimbrial-like adhesin protein  29.89 
 
 		 171 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0285836  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2176  fimbrial protein  29.89 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0826  Fimbrial protein  30.81 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00954  hypothetical protein  29.89 
 
 		 171 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0809  fimbrial protein  30.48 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.362705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  32.7 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2700  Fimbrial protein  29.31 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2653  fimbrial protein  29.31 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000480938  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1052  fimbrial protein  29.31 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000263503  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1058  fimbrial protein  29.31 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818586  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2374  fimbrial protein  29.31 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000854924  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0988  fimbrial protein  26.62 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.991205  normal  0.0750747 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  35.48 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0201  putative fimbrial subunit  32.78 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2878  fimbrial protein  30.46 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.905487  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>