192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0826 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0826  Fimbrial protein  100 
 
 		 182 aa  365  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4148  fimbrial protein  36.61 
 
 		 179 aa  120  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  37.44 
 
 		 187 aa  107  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  38.92 
 
 		 176 aa  102  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  36.41 
 
 		 176 aa  97.8  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  35.87 
 
 		 176 aa  96.3  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  35.87 
 
 		 176 aa  96.3  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  35.87 
 
 		 176 aa  96.3  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  35.87 
 
 		 176 aa  96.3  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  33.69 
 
 		 177 aa  93.6  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4677  fimbrial protein  31.89 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  33.33 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  30.81 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  30.81 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  33.54 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  30.81 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  29.73 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0214  putative fimbrial subunit  35.29 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0216  putative fimbrial subunit  35.29 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.17546  normal  0.944353 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0231  putative fimbrial subunit  35.29 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0232  putative fimbrial subunit  35.29 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.69001  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  31.74 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  32.08 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  36.22 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  29.83 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  29.83 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  32.33 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  29.83 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  32.33 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  34.65 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  34.65 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  34.65 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0408  fimbrial protein  27.62 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0767  putative type 1 fimbrial protein  24.47 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0745  putative type 1 fimbrial protein  24.47 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2936  fimbrial protein  24.47 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.545876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  30.13 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  30.13 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00679  predicted fimbrial-like adhesin protein  24.47 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02915  predicted fimbrial-like adhesin protein  27.23 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0657  Fimbrial protein  27.23 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3221  putative fimbrial protein  27.23 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501305  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0654  putative fimbrial protein  27.23 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.608236 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02865  hypothetical protein  27.23 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3508  putative fimbrial protein  27.23 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000529621  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0809  fimbrial protein  26.2 
 
 		 188 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.362705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  29.32 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  28.57 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  29.84 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  29.84 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  29.27 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4167  fimbrial protein  30.85 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208519 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  32.8 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  29.53 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0051  fimbrial protein  30.85 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  28.73 
 
 		 210 aa  62  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  28.73 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  28.73 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  28.73 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4672  fimbrial protein  28.02 
 
 		 183 aa  62  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4107  fimbrial protein  29.83 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  29.63 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2917  Fimbrial protein  29.85 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0948919  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2497  fimbrial protein  28.49 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3481  fimbrial protein  34.91 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0822  Fimbrial protein  28.07 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4139  fimbrial protein  28.48 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1057  Fimbrial protein  28.95 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3088  putative fimbrial subunit  33.33 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3269  putative fimbrial subunit  33.33 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0251275 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3171  putative fimbrial subunit  33.33 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.320855  normal  0.326781 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3152  putative fimbrial subunit  33.33 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156636 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  27.81 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.554066 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  27.81 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  27.81 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  27.81 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  27.81 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  27.81 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  27.81 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  27.27 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  28.57 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  28.57 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3185  probable fimbrial protein  28.57 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  29.34 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  29.59 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  29.59 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3364  fimbrial protein  29.65 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364607  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  29.59 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04793  P pilus assembly protein  28.1 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  29.59 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  29.59 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3262  putative fimbrial protein  33.33 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.792509  normal  0.342422 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00484  predicted fimbrial-like adhesin protein  30 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3248  fimbrial protein  29.76 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.0628332 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0609  putative fimbrial protein  30 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.87429  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1519  fimbrial protein  30.41 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00489  hypothetical protein  30 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3088  putative fimbrial protein  30 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00480  predicted fimbrial-like adhesin protein  28.04 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0604  type-1 fimbrial protein  28.04 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000140279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>