107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0822 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0822  Fimbrial protein  100 
 
 		 189 aa  392  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1057  Fimbrial protein  75.13 
 
 		 189 aa  292  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4677  fimbrial protein  31.41 
 
 		 179 aa  85.1  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  31.97 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4139  fimbrial protein  34.97 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0408  fimbrial protein  33.33 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0024  fimbrial subunit  32.21 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0023  fimbrial subunit  32.21 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.362563  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0023  fimbrial protein  32.21 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159363  normal  0.0604407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0024  fimbrial subunit  32.21 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.585957  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0022  fimbrial subunit  32.21 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.267455 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4717  fimbrial protein  26.54 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0885059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3274  fimbrial subunit  29.79 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3176  fimbrial subunit  29.08 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.312999 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  27.84 
 
 		 174 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  24.44 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00947  predicted fimbrial-like adhesin protein  31.11 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0285836  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  27.84 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  27.84 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  27.84 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00954  hypothetical protein  31.11 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  24.55 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  24.55 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  24.55 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  24.55 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  24.55 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1058  fimbrial protein  30.37 
 
 		 171 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818586  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0826  Fimbrial protein  28.07 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3474  fimbrial protein  37 
 
 		 173 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.855494  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2700  Fimbrial protein  30.37 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1052  fimbrial protein  30.37 
 
 		 171 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000263503  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4148  fimbrial protein  27.33 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2653  fimbrial protein  30.37 
 
 		 171 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000480938  hitchhiker  0.00337068 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2176  fimbrial protein  30.37 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00102099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2374  fimbrial protein  31.62 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000854924  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1106  fimbrial protein  30.37 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000811079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3093  fimbrial subunit  29.08 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3248  fimbrial protein  28.83 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.0628332 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3185  probable fimbrial protein  29.27 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3157  fimbrial subunit  27.66 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  0.243757 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  31.39 
 
 		 172 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4107  fimbrial protein  30.34 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4167  fimbrial protein  31.85 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208519 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  26.11 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4672  fimbrial protein  28.48 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0237  minor fimbrial subunit StfG  26.71 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000054722  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3364  fimbrial protein  27.61 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0051  fimbrial protein  31.21 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3262  putative fimbrial protein  27.61 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.792509  normal  0.342422 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2492  putative minor fimbrial subunit  34.31 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000455389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1100  fimbrial protein  26.67 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.159551  normal  0.51089 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00942  predicted fimbrial-like adhesin protein  26.67 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.608111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2705  Fimbrial protein  26.67 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0296528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2658  fimbrial protein  26.67 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.959086  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2181  putative fimbrial protein  25 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614971 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0221  minor fimbrial subunit StfG  26.71 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000010852  normal  0.588563 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00949  hypothetical protein  26.67 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.654237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1323  Fimbrial protein  27.97 
 
 		 179 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.539494  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1053  fimbrial protein  25.97 
 
 		 180 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.165848  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2380  fimbrial protein  25.97 
 
 		 180 aa  51.6  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2628  fimbrial protein  27.97 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0219  minor fimbrial subunit StfG  26.03 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000084521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0236  minor fimbrial subunit StfG  32 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  26.14 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2485  fimbrial protein  33 
 
 		 179 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1319  fimbrial protein  33 
 
 		 179 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  28.48 
 
 		 187 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3914  hypothetical protein  29.14 
 
 		 175 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3958  hypothetical protein  29.14 
 
 		 175 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.776659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3849  protein LpfE  29.73 
 
 		 175 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.551931  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4018  hypothetical protein  29.14 
 
 		 175 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.665772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  28.48 
 
 		 187 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02258  predicted fimbrial-like adhesin protein  34.83 
 
 		 183 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02218  hypothetical protein  34.83 
 
 		 183 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.918949  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  29.53 
 
 		 174 aa  48.1  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  25 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  26.95 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  26.95 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  26.95 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  28.03 
 
 		 184 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  26.9 
 
 		 170 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  26.9 
 
 		 170 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  26.9 
 
 		 170 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  29.66 
 
 		 176 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  29.66 
 
 		 176 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  29.66 
 
 		 176 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  29.66 
 
 		 176 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  29.66 
 
 		 176 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3199  fimbrial protein  26.06 
 
 		 195 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00946  predicted fimbrial-like adhesin protein  23.56 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.118713  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2701  Fimbrial protein  23.56 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000889642  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  26.21 
 
 		 170 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  26.9 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1051  fimbrial protein  23.56 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00269088  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1057  fimbrial protein  23.56 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000439054  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2654  fimbrial protein  23.56 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00417117  hitchhiker  0.00341593 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  26.9 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2375  fimbrial protein  23.56 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000301553  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00953  hypothetical protein  23.56 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116375  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  28.97 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.554066 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>