89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2492 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2492  putative minor fimbrial subunit  100 
 
 		 174 aa  351  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000455389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3474  fimbrial protein  75.86 
 
 		 173 aa  272  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.855494  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1323  Fimbrial protein  57.71 
 
 		 179 aa  204  6e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.539494  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2628  fimbrial protein  59.76 
 
 		 179 aa  204  6e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1319  fimbrial protein  60.13 
 
 		 179 aa  192  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2485  fimbrial protein  60.13 
 
 		 179 aa  192  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02258  predicted fimbrial-like adhesin protein  59.39 
 
 		 183 aa  185  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02218  hypothetical protein  59.39 
 
 		 183 aa  185  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.918949  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0236  minor fimbrial subunit StfG  47.16 
 
 		 176 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0237  minor fimbrial subunit StfG  46.02 
 
 		 176 aa  151  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000054722  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0221  minor fimbrial subunit StfG  46.02 
 
 		 176 aa  150  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000010852  normal  0.588563 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0219  minor fimbrial subunit StfG  46.02 
 
 		 176 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000084521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3093  fimbrial subunit  44.1 
 
 		 178 aa  141  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3274  fimbrial subunit  42.86 
 
 		 178 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3176  fimbrial subunit  42.86 
 
 		 178 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.312999 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3157  fimbrial subunit  40.99 
 
 		 178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  0.243757 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0408  fimbrial protein  35.95 
 
 		 181 aa  85.9  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4677  fimbrial protein  35.1 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2713  fimbrial protein  61.9 
 
 		 89 aa  80.1  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.790639  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4139  fimbrial protein  30.07 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4717  fimbrial protein  31.68 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0885059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  29.71 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  29.71 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  29.71 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  29.71 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  29.71 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  33.12 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3475  putative minor fimbrial subunit  66.67 
 
 		 57 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.448503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  29.65 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  29.65 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  29.65 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  29.24 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  29.24 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0822  Fimbrial protein  34.65 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1057  Fimbrial protein  34.31 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  33.54 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4672  fimbrial protein  33.86 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  32.07 
 
 		 176 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  32.07 
 
 		 176 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  32.07 
 
 		 176 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  32.07 
 
 		 176 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  32.07 
 
 		 176 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  28.57 
 
 		 179 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  28.57 
 
 		 179 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  28.57 
 
 		 179 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  28.57 
 
 		 179 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  32.07 
 
 		 176 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0401  fimbrial protein  31.11 
 
 		 177 aa  50.8  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  29.56 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  31.52 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  28.76 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  28.76 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  31.52 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.153043 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  29.61 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  31.61 
 
 		 182 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  27.44 
 
 		 185 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  27.33 
 
 		 170 aa  47.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  27.33 
 
 		 170 aa  47.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  27.33 
 
 		 170 aa  47.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4919  putative fimbrial chaparone  24.72 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.663343  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  32.31 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  28.76 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  28.76 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  29.61 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5005  putative fimbrial chaperone  24.72 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5008  putative fimbrial chaperone  24.72 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4953  putative fimbrial chaperone  24.72 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4846  putative fimbrial chaparone  24.72 
 
 		 181 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.417477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  26.75 
 
 		 170 aa  45.1  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3683  Fimbrial protein  32.31 
 
 		 182 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.4607  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04183  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  32.31 
 
 		 182 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04145  hypothetical protein  32.31 
 
 		 182 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  27.85 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  30.95 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0826  Fimbrial protein  27.92 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  27.85 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  25.13 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  28.57 
 
 		 174 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  26 
 
 		 174 aa  42.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  26.01 
 
 		 210 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3982  protein LpfE  31.58 
 
 		 174 aa  42  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567222  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  27.85 
 
 		 187 aa  41.6  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  26.01 
 
 		 170 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  26.01 
 
 		 170 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  26.01 
 
 		 170 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  34.86 
 
 		 176 aa  41.2  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  34.86 
 
 		 176 aa  41.2  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4148  fimbrial protein  30.33 
 
 		 179 aa  40.8  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  34.86 
 
 		 176 aa  40.8  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>