24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2713 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E2713  fimbrial protein  100 
 
 		 89 aa  183  7e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.790639  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2485  fimbrial protein  95.29 
 
 		 179 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1319  fimbrial protein  95.29 
 
 		 179 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2628  fimbrial protein  71.76 
 
 		 179 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1323  Fimbrial protein  68.24 
 
 		 179 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.539494  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3474  fimbrial protein  58.11 
 
 		 173 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.855494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02218  hypothetical protein  52.78 
 
 		 183 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.918949  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02258  predicted fimbrial-like adhesin protein  52.78 
 
 		 183 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2492  putative minor fimbrial subunit  63.33 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000455389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0236  minor fimbrial subunit StfG  48.15 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0237  minor fimbrial subunit StfG  43.64 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000054722  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0221  minor fimbrial subunit StfG  43.64 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000010852  normal  0.588563 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0219  minor fimbrial subunit StfG  43.64 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000084521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3157  fimbrial subunit  32.1 
 
 		 178 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  0.243757 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3093  fimbrial subunit  32.1 
 
 		 178 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3274  fimbrial subunit  32.1 
 
 		 178 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3176  fimbrial subunit  32.1 
 
 		 178 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.312999 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4958  fimbrial protein major type 1 subunit  33.75 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0414161 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0433  fimbrial protein  33.75 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.428443  hitchhiker  0.0000242972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4851  fimbrial protein major subunit  33.75 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.523252  normal  0.0116968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0371  fimbrial protein  32.5 
 
 		 178 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.136666 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0373  fimbrial protein  32.5 
 
 		 178 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0408  fimbrial protein  37.29 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3475  putative minor fimbrial subunit  52.63 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.448503  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>