104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3274 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A3274  fimbrial subunit  100 
 
 		 178 aa  364  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3176  fimbrial subunit  99.44 
 
 		 178 aa  362  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.312999 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3093  fimbrial subunit  98.31 
 
 		 178 aa  357  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3157  fimbrial subunit  94.94 
 
 		 178 aa  347  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  0.243757 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1323  Fimbrial protein  41.57 
 
 		 179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.539494  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2492  putative minor fimbrial subunit  44.37 
 
 		 174 aa  131  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000455389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0236  minor fimbrial subunit StfG  40.74 
 
 		 176 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3474  fimbrial protein  40 
 
 		 173 aa  127  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.855494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0221  minor fimbrial subunit StfG  42.58 
 
 		 176 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000010852  normal  0.588563 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0237  minor fimbrial subunit StfG  42.11 
 
 		 176 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000054722  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0219  minor fimbrial subunit StfG  42.11 
 
 		 176 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000084521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2628  fimbrial protein  40.72 
 
 		 179 aa  122  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2485  fimbrial protein  39.47 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1319  fimbrial protein  39.47 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02258  predicted fimbrial-like adhesin protein  38.73 
 
 		 183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02218  hypothetical protein  38.73 
 
 		 183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.918949  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0408  fimbrial protein  36.18 
 
 		 181 aa  85.9  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4717  fimbrial protein  31.87 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0885059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4139  fimbrial protein  33.33 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4677  fimbrial protein  30.82 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0822  Fimbrial protein  29.79 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  33.12 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  33.12 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  33.12 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  33.12 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  33.12 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  33.12 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  32.68 
 
 		 185 aa  60.8  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  32.68 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  32.68 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1057  Fimbrial protein  33.98 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1693  fimbrial protein  32.47 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  29.75 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  32.68 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2117  protein FimF homolog  32.47 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.153043 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  29.11 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  29.11 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  29.11 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  29.56 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  29.11 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  32.03 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  28.07 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  28.07 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  28.07 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4796  fimbrial protein FimF  31.55 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  29.11 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  29.94 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  29.56 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  29.56 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  29.56 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5824  fimbrial protein FimF  31.55 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4915  protein FimF  31.55 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04187  minor component of type 1 fimbriae  32.74 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3679  Fimbrial protein  32.74 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.544356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4544  fimbrial protein FimF  32.74 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.596311  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04149  hypothetical protein  32.74 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  28.39 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  29.41 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4845  fimbrial protein FimF  30.95 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  28.21 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  28.21 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5820  type-1 fimbrial protein homolog  31.17 
 
 		 182 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1612  fimbrial protein  27.27 
 
 		 174 aa  52  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4671  fimbrial protein  29.53 
 
 		 176 aa  51.6  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1498  fimbrial protein  28.97 
 
 		 359 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  28 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  27.85 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  27.85 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  27.85 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  28 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4540  type-1 fimbrial protein  31.17 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00344914  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4725  fimbrial protein  24.48 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0619942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2713  fimbrial protein  36.21 
 
 		 89 aa  49.3  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.790639  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4840  type-1 fimbrial protein  30.52 
 
 		 182 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0369  fimbrial protein  25.83 
 
 		 176 aa  47.8  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000261923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0613  fimbrial protein  25.83 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1413  fimbria protein  25.83 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000105951  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0694  fimbrial protein  25.83 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1522  fimbrial protein  25.83 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.14574  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04793  P pilus assembly protein  34.04 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4148  fimbrial protein  28.03 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4953  putative fimbrial chaperone  26.9 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5005  putative fimbrial chaperone  26.9 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4846  putative fimbrial chaparone  26.9 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.417477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5008  putative fimbrial chaperone  26.9 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  28.32 
 
 		 172 aa  44.3  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4672  fimbrial protein  29.73 
 
 		 183 aa  42.4  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4919  putative fimbrial chaparone  29.03 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.663343  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  28.85 
 
 		 174 aa  42.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2448  fimbrial protein  32.47 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1664  fimbrial protein  27.66 
 
 		 187 aa  42  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.515875 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2120  fimbrial protein  27.66 
 
 		 187 aa  42  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.367974 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  27.75 
 
 		 172 aa  42  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  27.75 
 
 		 172 aa  42  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  27.75 
 
 		 172 aa  42  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  27.75 
 
 		 172 aa  42  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3083  Fimbrial protein  35 
 
 		 180 aa  41.2  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0205144  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0604  type-1 fimbrial protein  35 
 
 		 180 aa  41.2  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000140279  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0571  type-1 fimbrial protein  35 
 
 		 180 aa  41.2  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004539  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3092  fimbrial protein  35 
 
 		 180 aa  41.2  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124321  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>